Abstract Nucleotidesequencesofthetr

Abstract Nucleotidesequencesofthetriosephosphateisomerase (TPI) gene (624 bp) and mitochondrial cytochrome b (cob) gene (520 bp) were obtained by PCR and evaluated for utility in inferring the phylogenetic relationships among Trichuris species. Published sequences of one other nuclear gene (18S or SSU rRNA, 1816–1846 bp) and one additional mitochondrial (mtDNA) gene (cytochrome oxidase 1, cox1, 342 bp) were also analyzed. Maximum likelihood and Bayesian inference methods were used to infer phylogenies for each gene separately but also for the combined mitochondrialdata(twogenes),thecombinednucleardata(twogenes), and the total evidence (four gene) dataset. Few Trichuris clades were uniformly resolved across separate analyses of individual genes. For the mtDNA, the cob gene trees had greaterphylogeneticresolutionandtendedtohavehighersupportvaluesthanthecox1analyses.Fornucleargenes,theSSU gene trees had slightly greater resolution and support values thantheTPI analyses,but TPIwastheonlygenewithreliable support for the deepest nodes in the tree. Combined analyses ofgenesyieldedstronglysupportedcladesinmostcases,with the exception of the relationship among Trichuris clades 1, 2, and 3, which showed conflicting results between nuclear and mitochondrialgenes.BoththeTPIandcobgenesprovedvaluable for inferring Trichuris relationships, with greatest resolution and support values achieved through combined analysis of multiple genes. Based on the phylogeny of the combined
analysis of nuclear and mitochondrial genes, parsimony mapping of definitive host utilization depicts artiodactyls as the ancestral hosts for these Trichuris, with host-shifts into primates, rodents, and Carnivora.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Abstract Nucleotidesequencesofthetriosephosphateisomerase (TPI) gene (624 bp) and mitochondrial cytochrome b (cob) gene (520 bp) were obtained by PCR and evaluated for utility in inferring the phylogenetic relationships among Trichuris species. Published sequences of one other nuclear gene (18S or SSU rRNA, 1816–1846 bp) and one additional mitochondrial (mtDNA) gene (cytochrome oxidase 1, cox1, 342 bp) were also analyzed. Maximum likelihood and Bayesian inference methods were used to infer phylogenies for each gene separately but also for the combined mitochondrialdata(twogenes),thecombinednucleardata(twogenes), and the total evidence (four gene) dataset. Few Trichuris clades were uniformly resolved across separate analyses of individual genes. For the mtDNA, the cob gene trees had greaterphylogeneticresolutionandtendedtohavehighersupportvaluesthanthecox1analyses.Fornucleargenes,theSSU gene trees had slightly greater resolution and support values thantheTPI analyses,but TPIwastheonlygenewithreliable support for the deepest nodes in the tree. Combined analyses ofgenesyieldedstronglysupportedcladesinmostcases,with the exception of the relationship among Trichuris clades 1, 2, and 3, which showed conflicting results between nuclear and mitochondrialgenes.BoththeTPIandcobgenesprovedvaluable for inferring Trichuris relationships, with greatest resolution and support values achieved through combined analysis of multiple genes. Based on the phylogeny of the combinedการวิเคราะห์ยีนนิวเคลียร์ และยล parsimony แม็ปของโฮสต์ระบบการใช้ประโยชน์มีภาพ artiodactyls เป็นโฮสต์ของบรรพบุรุษสำหรับ Trichuris เหล่านี้ กับกะโฮสต์เป็นไพรเมต หนู และ Carnivora

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อ Nucleotidesequencesofthetriosephosphateisomerase (ทีพีไอ) ของยีน (624 BP) และยล cytochrome B (ซัง) ยีน (520 BP) ที่ได้รับโดยวิธี PCR และประเมินผลเพื่อประโยชน์ในการอนุมาน phylogenetic สัมพันธ์ในหมู่ Trichuris ชนิด ลำดับการตีพิมพ์ของยีนอีกคนหนึ่งนิวเคลียร์ (18S rRNA หรือซุ, BP 1816-1846) และเป็นหนึ่งยลเพิ่มเติม (mtDNA) ยีน (cytochrome oxidase 1 cox1 342 bp) นอกจากนี้ยังถูกนำมาวิเคราะห์ ความน่าจะเป็นสูงสุดและวิธีการอนุมานแบบเบย์ถูกนำมาใช้เพื่อสรุป phylogenies สำหรับแต่ละยีนแยกต่างหาก แต่ยังสำหรับ mitochondrialdata รวม (twogenes) thecombinednucleardata (twogenes) และหลักฐานทั้งหมด (สี่ยีน) ชุดข้อมูล ไม่กี่ clades Trichuris ได้รับการแก้ไขอย่างสม่ำเสมอทั่ววิเคราะห์แยกจากกันของยีนของแต่ละบุคคล สำหรับ mtDNA ต้นไม้ซังยีนมี greaterphylogeneticresolutionandtendedtohavehighersupportvaluesthanthecox1analyses.Fornucleargenes, theSSU ต้นไม้ยีนได้มีมติและการสนับสนุนมากขึ้นเล็กน้อยค่า thantheTPI วิเคราะห์ แต่การสนับสนุน TPIwastheonlygenewithreliable สำหรับโหนดที่ลึกที่สุดในต้นไม้ รวมวิเคราะห์ ofgenesyieldedstronglysupportedcladesinmostcases มีข้อยกเว้นของความสัมพันธ์ระหว่าง Trichuris clades 1, 2 และ 3 ซึ่งแสดงให้เห็นผลที่ขัดแย้งกันระหว่างนิวเคลียร์และ mitochondrialgenes.BoththeTPIandcobgenesprovedvaluable สำหรับการอนุมานความสัมพันธ์ Trichuris, ที่มีความละเอียดและการสนับสนุนที่ยิ่งใหญ่ที่สุดค่าประสบความสำเร็จผ่านการวิเคราะห์ร่วมกันของยีนหลาย ขึ้นอยู่กับเชื้อชาติของรวม
การวิเคราะห์ยีนนิวเคลียร์และยลทำแผนที่ความประหยัดการใช้โฮสต์ที่ชัดเจนแสดงให้เห็น artiodactyls เป็นเจ้าภาพบรรพบุรุษสำหรับ Trichuris นี้กับโฮสต์กะเข้าไปในบิชอพ, หนูและสัตว์กินเนื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

nucleotidesequencesofthetriosephosphateisomerase นามธรรม ( ทีพีไอ ) ( 624 bp ) และยีนไมโตคอนเดรีย - B ( คอบ ) ยีน ( 520 bp ) ได้ โดยวิธี PCR และการประเมินเพื่ออรรถประโยชน์ในการความสัมพันธ์ต่างๆระหว่าง trichuris ชนิด พิมพ์ลำดับของยีนนิวเคลียร์อื่น ๆ ( 18S rRNA –ค.ศ. 1520 หรือซื่อ , BP ) และหนึ่งเพิ่มเติมของไมโตคอนเดรีย ( แสดง ) จีน ( นกลุมพู 1 , cox1 342 BP วิเคราะห์ . ความควรจะเป็นสูงสุดและวิธีการอนุมานคชกรรมการอนุมานที่ใช้ phylogenies แต่ละยีนที่แยกต่างหาก แต่ยังสำหรับ mitochondrialdata รวม ( twogenes ) thecombinednucleardata ( twogenes ) และหลักฐานทั้งหมด ( 4 ) ) ข้อมูล . clades trichuris มีจุดแก้ไขข้ามแยกการวิเคราะห์ยีนของแต่ละบุคคล สำหรับแสดง , ซังข้าวโพดยีนต้นไม้มี greaterphylogeneticresolutionandtendedtohavehighersupportvaluesthanthecox1analyses . fornucleargenes thessu ยีน , ต้นไม้มีความละเอียดมากขึ้น และสนับสนุน thanthetpi วิเคราะห์ค่าเล็กน้อย แต่ tpiwastheonlygenewithreliable สนับสนุนจุดที่ลึกที่สุดในต้นไม้ รวม ofgenesyieldedstronglysupportedcladesinmostcases วิเคราะห์ด้วยข้อยกเว้นของความสัมพันธ์ระหว่าง trichuris clades 1 , 2 และ 3 ซึ่งแสดงผลที่ขัดแย้งกันระหว่างนิวเคลียร์และ mitochondrialgenes.boththetpiandcobgenesprovedvaluable สำหรับระดับความสัมพันธ์ trichuris ที่มีความละเอียดมากที่สุด และสนับสนุนค่าได้ผ่านการวิเคราะห์รวมหลายยีน ตามระบบเชื้อชาติของรวมการวิเคราะห์ของนิวเคลียร์ และการทำแผนการใช้โฮสต์ยีนตระหนี่ชัดเจนแสดงให้เห็น artiodactyls เป็นโฮสต์ของบรรพบุรุษเหล่านี้ trichuris กับโฮสต์กะเข้าไปในนม , หนู , และงาน .