The ribosomal RNA genes (rDNA) of f

The ribosomal RNA genes (rDNA) of fungi exist, as a multiple-copy gene family comprised of highly similar DNA sequences that provide a large number of characters, typically from 8–12 kb. The mode of sequence variation among fungal species at different taxonomic level can be further investigated since the ribosomal DNA consists of regions of highly conserved sequences and regions which are rapidly evolving, which contain highly variable sequences. The more conserved regions, namely the small subunit (SSU) and large subunit (LSU) rDNA, have been useful in finding relationships between distantly related taxa or family. The internal transcribed spacers (ITSs) have been used to examine relationships between closely related taxa (Gardes and Bruns, 1991; Baura et al., 1992; Lee and Taylor, 1992; McCullough et al., 1998; Callac and Guinberteau, 2005; Didukh et al., 2005). Many sequences from fungal taxa are already in the molecular genetic databases (GenBank, EMBL and DDBJ), and can be easily downloaded for data comparison.Sequences of the universal primers for these genes are also available (White et al. 1990), and DNA can be easily sequenced either directly from PCR product or from cloned fragments. Thus DNA sequence analysis has been widely used in fungal phylogeny and has been used to infer phylogenetic relationships between fungi at all taxonomic levels (Bruns et al., 1991; Hibbett, 1992;Lee and Taylor, 1992; Li, 1997; Okane et al., 2003; Pandey et al., 2003; Tomita, 2003;Menkis et al., 2004; Rodrigues et al., 2004).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีน ribosomal RNA (rDNA) ของเชื้อรามีอยู่ เป็นครอบครัวหลายสำเนายีนประกอบด้วยลำดับดีเอ็นเอคล้ายสูงที่มีจำนวนมากของตัวอักษร โดยทั่วไปจาก 8 – 12 kb โหมดของการเปลี่ยนแปลงลำดับระหว่างชนิดเชื้อราที่ระดับอนุกรมวิธานที่แตกต่างกันสามารถถูกตรวจสอบเพิ่มเติมเนื่องจากดีเอ็นเอ ribosomal ประกอบด้วยภูมิภาคนำสูงลำดับที่และที่พัฒนาอย่างรวดเร็ว ซึ่งประกอบด้วยตัวแปรสูงลำดับ ภูมิภาคนำมาก คืองานย่อยขนาดเล็ก (SSU) และ rDNA ย่อยขนาดใหญ่ (LSU) ได้รับประโยชน์ในการหาความสัมพันธ์ระหว่างแท็กซ่าคลับที่เกี่ยวข้องหรือครอบครัว แหวนทับภายใน (ITSs) ถูกใช้เพื่อตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างแท็กซ่าที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด (Gardes และบรันซ์ 1991 Baura et al. 1992 ลีและ Taylor, 1992 McCullough et al. 1998 Callac และ Guinberteau, 2005 Didukh et al. 2005) ลำดับหลายจากแท็กซ่าเชื้อราที่มีอยู่แล้วในฐานข้อมูลพันธุกรรมโมเลกุล (GenBank, EMBL และ DDBJ), และสามารถดาวน์โหลดได้อย่างง่ายดายสำหรับการเปรียบเทียบข้อมูล ลำดับของไพรเมอร์สากลสำหรับยีนเหล่านี้พร้อมใช้งาน (ขาว et al. 1990), และดีเอ็นเอสามารถถูกเรียงลำดับได้โดยตรง จากผลิตภัณฑ์ PCR หรือ จากเศษโคลน ดังนั้นการวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอมีการใช้กันอย่างแพร่หลายในมหารา และการสรุป phylogenetic ความสัมพันธ์ระหว่างเชื้อรา (บรันซ์และ al. 1991 อนุกรมวิธานที่ระดับ Hibbett, 1992 ลีและ Taylor, 1992 หลี่ 1997 Okane et al. 2003 นี้ et al. 2003 โทมิตะ 2003 Menkis et al. 2004 คลิ et al. 2004)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ยีนโซมอลอาร์เอ็นเอ (rDNA) ของเชื้อราที่มีอยู่เป็นหลายสำเนาครอบครัวประกอบด้วยยีนที่คล้ายกันอย่างมากในลำดับดีเอ็นเอที่มีเป็นจำนวนมากของตัวละครโดยทั่วไป 8-12 กิโล โหมดของการเปลี่ยนแปลงลำดับในหมู่สายพันธุ์เชื้อราในระดับการจัดหมวดหมู่ที่แตกต่างกันสามารถที่จะสืบสวนสอบสวนต่อไปตั้งแต่โซมอลดีเอ็นเอประกอบด้วยภูมิภาคของลำดับป่าสงวนและภูมิภาคท​​ี่มีการพัฒนาอย่างรวดเร็วซึ่งมีลำดับตัวแปร ภูมิภาคอนุรักษ์มากขึ้นคือหน่วยย่อยขนาดเล็ก (ซุ) และหน่วยย่อยขนาดใหญ่ (LSU) rDNA ได้รับประโยชน์ในการค้นหาความสัมพันธ์ระหว่างแท็กซ่าที่เกี่ยวข้องห่างไกลหรือคนในครอบครัว spacers คัดลอกภายใน (Itss) ได้ถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างแท็กซ่าเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด (Gardes และ Bruns 1991; Baura et al, 1992;. ลีและเทย์เลอร์, 1992; แม็กคัลล็อก, et al, 1998;. Callac และ Guinberteau 2005; Didukh et al., 2005) ลำดับจำนวนมากจากแท็กซ่าเชื้อรามีอยู่แล้วในฐานข้อมูลทางอณูพันธุศาสตร์ (GenBank, EMBL และ DDBJ) และสามารถดาวน์โหลดได้อย่างง่ายดายสำหรับข้อมูล comparison.Sequences ของไพรเมอร์สากลสำหรับยีนเหล่านี้นอกจากนี้ยังมีสีขาว (et al. 1990) และดีเอ็นเอ สามารถจัดลำดับได้อย่างง่ายดายไม่ว่าจะโดยตรงจากผลิตภัณฑ์ PCR หรือจากเศษโคลน ดังนั้นการวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในเชื้อชาติของเชื้อราและได้ถูกนำมาใช้เพื่อสรุปความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการระหว่างเชื้อราในระดับการจัดหมวดหมู่ทั้งหมด (บรู et al, 1991;. Hibbett 1992; ลีและเทย์เลอร์, 1992; Li, 1997; Okane et al, ., 2003; Pandey et al, 2003;. โทมิตะ, 2003. Menkis et al, 2004;. โรดริกู, et al, 2004)