OsRH17 (Os05g0110500) is located on

OsRH17 (Os05g0110500) is located on chromosome 5 of the rice genome and consists of 10 exons. The full-length cDNA shows that OsRH17 encodes a putative protein that consists of 591 amino acid residues with a calculated molecular weight of 67 kDa and an isoelectric point of 9.56. Searching for conserved domains revealed that amino acids 22 to 248 and 295 to 443 in the OsRH17 protein represent two typical conserved domains, DEADc (PF00270) and HELICs (helicase superfamily C-terminal domain, PF00271) (Fig. 1A), which are composed of nine conserved RH motifs. OsRH17 contained amino acid residues D-E-A-D in motif II (Fig. 1B). Thus, we hypothesized that OsRH17 is a member of the DEAD-box class of RNA helicases. Sequence comparisons revealed that this OsRH17 was highly conserved in plant evolution. The predicted OsRH17 protein shares more than 85% amino acid sequence identity with homologous proteins from several monocots such as Zea mays and Sorghum bicolor and approximately 60% identity with proteins from dicot species including Populus trichocarpa, Vitis vinifera, Ricinus communis, Medicago truncatula, Glycine max, and A. thaliana. The relative homology of OsRH17 to proteins from different species revealed their evolutionary relationships to a certain degree

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

OsRH17 (Os05g0110500) อยู่บนโครโมโซมที่ 5 ของพันธุข้าว และ 10 exons ประกอบด้วย CDNA เต็มตัวแสดงว่า OsRH17 จแมปโปรตีนอ้างว่าฝาที่ประกอบด้วยกรดอะมิโน 591 ตก molecular weight คำนวณของ 67 kDa และจุด isoelectric ของ 9.56 ค้นหาสำหรับโดเมนนำเปิดเผยว่า กรดอะมิโน 22 248 และ 295 443 โปรตีน OsRH17 เป็นตัวแทนสองทั่วไปอนุรักษ์โดเมน DEADc (PF00270) และ HELICs (helicase superfamily C-เทอร์มินัลโดเมน PF00271) (รูปที่ 1A), ซึ่งประกอบด้วยเก้าอนุรักษ์ลวดลาย RH OsRH17 อยู่ตกค้างกรดอะมิโน D E A D ในรูปที่สอง (รูปที่ 1B) ดังนั้น เราตั้งสมมติฐานว่า OsRH17 เป็นสมาชิกของคลากล่องตายของ RNA helicases เปรียบเทียบลำดับเปิดเผยว่า OsRH17 นี้มีอนุรักษ์สูงในวิวัฒนาการพืช โปรตีน OsRH17 ทำนายหุ้นมากกว่าประมาณ 60% ตนกับโปรตีนจากสัตว์ dicot Populus trichocarpa, Vitis vinifera, Ricinus communis, Medicago truncatula, Glycine สูงสุด และ A. thaliana และข้อมูลประจำตัวลำดับ 85% กรดอะมิโนโปรตีนเซทจะมีโครโมโซมจากหลาย monocots เช่นซี mays และฟ่าง bicolor Homology ญาติของ OsRH17 กับโปรตีนจากสายพันธุ์ที่แตกต่างเปิดเผยความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการในระดับหนึ่ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

OsRH17 (Os05g0110500) ตั้งอยู่บนโครโมโซมที่ 5 ของจีโนมข้าวและประกอบด้วย 10 exons ซึ่งแปลความยาวเต็มแสดงให้เห็นว่า OsRH17 encodes โปรตีนสมมุติที่ประกอบด้วย 591 กรดอะมิโนที่มีน้ำหนักโมเลกุลคำนวณจาก 67 กิโลดาลตันและจุดเชื่อมต่อของ Isoelectric 9.56 ค้นหาโดเมนอนุรักษ์เปิดเผยว่ากรดอะมิโน 22-248 และ 295-443 ในโปรตีน OsRH17 แทนสองโดเมนทั่วไปอนุรักษ์ DEADc (PF00270) และ HELICs (helicase superfamily ขั้ว c- โดเมน PF00271) (รูป. 1A) ซึ่งจะประกอบด้วย เก้าลวดลาย RH อนุรักษ์ OsRH17 ที่มีกรดอะมิโนตายอยู่ในบรรทัดฐาน II (รูปที่ 1B.) ดังนั้นเราจึงตั้งสมมติฐานว่า OsRH17 เป็นสมาชิกของชนชั้นตายกล่อง helicases อาร์เอ็นเอ เปรียบเทียบลำดับเปิดเผยว่า OsRH17 นี้ได้รับการอนุรักษ์อย่างมากในการวิวัฒนาการของพืช ที่คาดการณ์หุ้นโปรตีน OsRH17 กว่า 85% ลำดับบัตรกรดอะมิโนโปรตีนคล้ายคลึงกันจากหลายพืชใบเลี้ยงเดี่ยวเช่น Zea Mays และข้าวฟ่างสีและเอกลักษณ์ประมาณ 60% กับโปรตีนจากสัตว์ dicot รวมทั้ง Populus trichocarpa, Vitis vinifera, Ricinus communis, Medicago truncatula, Glycine แม็กซ์และเอ thaliana เหมือนญาติของ OsRH17 กับโปรตีนจากสายพันธุ์ที่แตกต่างกันเปิดเผยความสัมพันธ์ของพวกเขาวิวัฒนาการในระดับหนึ่ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

osrh17 ( os05g0110500 ) ตั้งอยู่บนโครโมโซมคู่ที่ 5 ของจีโนมข้าวและประกอบด้วย 10 ฆ . วิธียาวแสดงให้เห็นว่า osrh17 encodes เป็นกรดอะมิโนโปรตีน ที่ประกอบด้วยกรดอะมิโนจะตกค้างกับคำนวณน้ำหนักโมเลกุลของ 67 กิโลดาลตันและมีจุดไอโซอิเล็กทริกของ 9.56 . ค้นหาโดเมนที่อนุรักษ์พบว่ากรดอะมิโน 22 และไปแต่ใน osrh17 โปรตีนทั่วไปเพื่อแสดงสองโดเมน deadc ( pf00270 ) และ helics ( โมเลกุลซูเปอร์แฟมิลีซึ่งโดเมน pf00271 ) ( รูปที่ 1 ) ซึ่งประกอบด้วย 9 กิจกรรมอนุรักษ์ลวดลาย osrh17 ประกอบด้วยกรดอะมิโน d-e-a-d ตกค้างในแม่ลาย 2 ( รูปที่ 1A ) ดังนั้นเราจึงตั้งสมมุติฐานว่า osrh17 เป็นสมาชิกของกล่องรุ่นนี้ helicases ตาย . การเปรียบเทียบลำดับ พบว่า osrh17 นี้ที่มีการอนุรักษ์ในวิวัฒนาการของพืช ทำนายหุ้น osrh17 โปรตีนมากกว่า 85% ลำดับกรดอะมิโนจากโปรตีนหลายตัวตนกับโฮโมโลกัส พืชใบเลี้ยงเดี่ยว เช่น ข้าวโพด และ ข้าวฟ่าง และประมาณ 60% ตัวตนกับโปรตีนจากชนิดพืชใบเลี้ยงคู่ได้แก่ คน trichocarpa vinifera , communis ricinus , องุ่น , MEDICAGO truncatula , ถั่วเหลือง , และ A . thaliana . ญาติที่เป็น osrh17 จากโปรตีนในสายพันธุ์ที่แตกต่างกันเปิดเผยความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของพวกเขาในระดับหนึ่ง