Microarray analysis of large-scale

Microarray analysis of large-scale temporal and tissue-specific plant gene expression changes occurring during a susceptible plant–pathogen interaction revealed different gene expression profile changes in cotton root and hypocotyl tissues. In hypocotyl tissues infected with Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum, increased expression of defense-related genes was observed, whereas few changes in the expression levels of defense-related genes were found in infected root tissues. In infected roots, more plant genes were repressed than were induced, especially at the earlier stages of infection. Although many known cotton defense responses were identified, including induction of pathogenesis-related genes and gossypol biosynthesis genes, potential new defense responses also were identified, such as the biosynthesis of lignans. Many of the stress-related gene responses were common to both tissues. The repression of drought-responsive proteins such as aquaporins in both roots and hypocotyls represents a previously unreported response of a host to pathogen attack that may be specific to vascular wilt diseases. Gene expression results implicated the phytohormones ethylene and auxin in the disease process. Biochemical analysis of hormone level changes supported this observation.
Plants

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Microarray วิเคราะห์ขนาดใหญ่ขมับและเปลี่ยนแปลงนิพจน์ยีนเฉพาะเนื้อเยื่อพืชที่เกิดขึ้นในระหว่างการโต้ตอบที่ไวต่อพืช – เชื้อโรคเผยเปลี่ยนโปรไฟล์นิพจน์ยีนแตกต่างกันในเนื้อเยื่อรากและ hypocotyl ของฝ้าย ใน hypocotyl เนื้อเยื่อติดเชื้อ Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum เพิ่มนิพจน์ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันพบว่า ในขณะที่การเปลี่ยนแปลงเล็ก ๆ ในระดับการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันพบว่าในเนื้อเยื่อรากติดเชื้อ ในรากติดเชื้อ ยีนพืชเพิ่มเติมถูกอัดอั้นกว่านำ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในระยะเริ่มต้นของการติดเชื้อ แม้ว่าการตอบสนองการป้องกันรู้จักฝ้ายหลายระบุ รวมทั้งการเหนี่ยวนำของยีนที่เกี่ยวข้องกับพยาธิกำเนิดและสังเคราะห์ยีน gossypol ศักยภาพใหม่ป้องกันการตอบสนองยังถูกระบุ เช่นสังเคราะห์ของ lignans ทั่วไปเนื้อเยื่อทั้งหลายการตอบสนองของยีนที่เกี่ยวข้องกับความเครียดได้ ปราบปรามภัยแล้งสนองโปรตีนเช่นนวัตกรรมในรากและ hypocotyls แสดงถึงการตอบสนองที่ไม่ถูกรายงานก่อนหน้าของโฮสต์เพื่อโจมตีเชื้อโรคที่อาจเป็นลักษณะเฉพาะโรคเหี่ยวที่หลอดเลือด ผลการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้อง phytohormones เอทิลีนและออกซิในกระบวนการเกิดโรค การวิเคราะห์ทางชีวเคมีการเปลี่ยนแปลงระดับฮอร์โมนสนับสนุนข้อสังเกตนี้ พืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วิเคราะห์ microarray ขนาดใหญ่ชั่วคราวและเนื้อเยื่อเฉพาะยีนพืชการเปลี่ยนแปลงการแสดงออกที่เกิดขึ้นระหว่างการทำงานร่วมเชื้อโรคพืชที่ไวต่อการเปิดเผยรายละเอียดการเปลี่ยนแปลงการแสดงออกของยีนที่แตกต่างกันในรากผ้าฝ้ายและเนื้อเยื่อ hypocotyl ในเนื้อเยื่อ hypocotyl ติดเชื้อเชื้อรา Fusarium oxysporum F SP vasinfectum เพิ่มการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันตัวที่ถูกพบในขณะที่การเปลี่ยนแปลงเล็กน้อยในระดับการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันของเขาถูกพบในเนื้อเยื่อรากที่ติดเชื้อ ในรากติดเชื้อมากขึ้นยีนโรงงานถูกอัดอั้นกว่าถูกเหนี่ยวนำให้เกิดโดยเฉพาะอย่างยิ่งในช่วงก่อนหน้านี้ของการติดเชื้อ แม้ว่าจะมีหลายที่รู้จักกันในการตอบสนองการป้องกันฝ้ายถูกระบุรวมทั้งการเหนี่ยวนำของยีนที่ทำให้เกิดโรคที่เกี่ยวข้องกับยีน gossypol สังเคราะห์ที่มีศักยภาพการตอบสนองการป้องกันใหม่นี้ยังมีการระบุเช่นการสังเคราะห์ของ lignans หลายคนที่เกี่ยวข้องกับความเครียดการตอบสนองของยีนเป็นเรื่องปกติไปยังเนื้อเยื่อทั้งสอง ปราบปรามของโปรตีนแล้งตอบสนองเช่น aquaporins ทั้งรากและลำต้นใต้ใบเลี้ยงแสดงให้เห็นถึงการตอบสนองที่ได้รับรายงานก่อนหน้านี้ของเจ้าภาพในการโจมตีเชื้อโรคที่อาจจะเฉพาะเจาะจงต่อโรคเหี่ยวของหลอดเลือด ผลการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องเอธิลีน phytohormones และออกซินในกระบวนการของโรค การวิเคราะห์ทางชีวเคมีของการเปลี่ยนแปลงระดับฮอร์โมนสนับสนุนข้อสังเกตนี้.
พืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ของขนาดใหญ่และโรงงานชั่วคราว tissue-specific ยีนเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้นในระหว่างที่อ่อนแอและเชื้อโรคพืชปฏิสัมพันธ์พบแตกต่างกันการแสดงออกของยีนโปรไฟล์การเปลี่ยนแปลงในผ้าฝ้ายและเนื้อเยื่อรากได้ดีที่สุด ในเนื้อเยื่อของระบบที่ติดเชื้อ Fusarium oxysporum F . . vasinfectum เพิ่มการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกัน พบว่า มีการเปลี่ยนแปลงบางอย่างในระดับการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันที่พบในเนื้อเยื่อรากติดเชื้อ ในรากของไวรัส ยีนพืชมากขึ้นและกดดันกว่า โดยเฉพาะในขั้นตอนก่อนหน้านี้ของการติดเชื้อ แม้ว่าหลายรู้จักฝ้ายป้องกันการระบุ รวมทั้งการตรวจหายีนที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ยีน และกากเมล็ดฝ้าย , การป้องกันการตอบสนองยังถูกระบุใหม่ที่มีศักยภาพ เช่น การสังเคราะห์ลิกแนน . หลายของการตอบสนองความเครียดที่เกี่ยวข้องกับยีนอยู่ทั่วไปทั้งเนื้อเยื่อ การปราบปรามของความแห้งแล้งต่อโปรตีนเช่น aquaporins ทั้งรากและสารแสดงถึงการตอบสนองแต่ก่อนหน้านี้ของโฮสต์ที่อาจจะมีเชื้อโรคโจมตีเฉพาะหลอดเลือด โรคเหี่ยวเขียว . การแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องในการ phytohormones เอทิลีนและออกซินในการเป็นโรค การวิเคราะห์ทางชีวเคมีของฮอร์โมน การเปลี่ยนแปลงที่สังเกตนี้พืช