The farm concerned has been regularly and severely impacted by both types of vibriosis for several years. Flow cytometry (FCM) was used to describe the phytoplankton community changes, because this technique is one of the most efficient for monitoring rapid microbial population changes within the water column (Courties and Boeuf, 2004). The statistical reliability of abundance is better than microscopic cell counts as greater proportion of cells (thousands) can be analysed over shorter period (seconds) (Troussellier et al., 1993). Potentially toxic phytoplankton species were searched in all samples collected during mortality outbreaks, using optical microscopy. To describe more accurately and specifically the phytoplankton communities, complementary approaches were combined on several samples. Taxonomic groups of phytoplankton were identified by HPLC analysis according to their marker pigments. Various photopigments characterize specific phytoplankton taxonomic groups (chlorophytes, cryptophytes, cyanobacteria, diatoms and dinoflagellates) (Paerl et al., 2003 and Jeffrey et al., 2011). This technique has also been shown to be useful for the detection of fragile flagellates, which are destroyed by procedures used for microscopic observations. This technique, known as chemotaxonomy, has been widely and successfully used in marine, estuarine and freshwater environments (Jeffrey et al., 1997 and Descy et al., 2009), but has been applied less frequently to tropical aquaculture ponds (Burford, 1997 and Gárate-Lizárraga et al., 2009). Metagenomic analysis of flow-sorted selected cells was conducted on one fresh sample to estimate the diversity of two dominant cytometric groups: picoeukaryotes, which are highly abundant, and an unknown prokaryotic group regularly observed in shrimp ponds in New Caledonia (Courties and Boeuf, 2004 and Lucas et al., 2010). The combination of cell sorting by FCM with molecular tools allows the molecular taxonomic identification of specific planktonic cells (Guillebault et al., 2010).
ฟาร์มที่เกี่ยวข้องได้รับอย่างสม่ำเสมออย่างรุนแรงและผลกระทบจากทั้งสองประเภทของวิบริโอเป็นเวลาหลายปี flow cytometry (FCM) ถูกนำมาใช้เพื่ออธิบายการเปลี่ยนแปลงของแพลงก์ตอนพืชชุมชนเพราะเทคนิคนี้เป็นหนึ่งในมีประสิทธิภาพมากที่สุดสำหรับการตรวจสอบอย่างรวดเร็วการเปลี่ยนแปลงประชากรจุลินทรีย์ที่อยู่ในน้ำคอลัมน์ (Courties และ Boeuf, 2004) ความน่าเชื่อถือทางสถิติของความอุดมสมบูรณ์ดีกว่าจำนวนเซลล์กล้องจุลทรรศน์เป็นสัดส่วนมากขึ้นของเซลล์ (พันบาท) สามารถวิเคราะห์ได้ในช่วงระยะเวลาสั้น (วินาที) (Troussellier et al., 1993) ที่อาจเป็นพิษชนิดแพลงก์ตอนพืชถูกค้นในตัวอย่างที่เก็บรวบรวมทั้งหมดในช่วงการระบาดตายโดยใช้กล้องจุลทรรศน์แสง เพื่ออธิบายถูกต้องมากขึ้นและโดยเฉพาะชุมชนแพลงก์ตอนพืชวิธีการเสริมกำลังทำงานร่วมกันในหลายตัวอย่าง กลุ่มการจัดหมวดหมู่ของแพลงก์ตอนพืชที่ถูกระบุโดยการวิเคราะห์ HPLC ตามเม็ดสีเครื่องหมายของพวกเขา photopigments ต่างๆลักษณะเฉพาะแพลงก์ตอนพืชกลุ่มอนุกรมวิธาน (chlorophytes, cryptophytes, ไซยาโนแบคทีเรียไดอะตอมและ dinoflagellates) (มุก et al., 2003 และเจฟฟรีย์ et al., 2011) เทคนิคนี้ยังได้รับการแสดงที่จะเป็นประโยชน์ในการตรวจหา flagellates เปราะบางซึ่งจะถูกทำลายโดยวิธีการที่ใช้สำหรับการสังเกตด้วยกล้องจุลทรรศน์ เทคนิคนี้เป็นที่รู้จัก chemotaxonomy ได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางและประสบความสำเร็จที่ใช้ในทะเลน้ำเค็มและน้ำจืดสภาพแวดล้อม (เจฟฟรีย์ et al., 1997 และ Descy et al., 2009) แต่ได้ถูกนำมาใช้ไม่บ่อยบ่อเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำในเขตร้อน (เบอร์ฟอร์ 1997 และ Garate-Lizarraga et al., 2009) วิเคราะห์ Metagenomic ของเซลล์ที่เลือกไหลเรียงได้ดำเนินการในตัวอย่างสดหนึ่งในการประเมินความหลากหลายของทั้งสองกลุ่ม cytometric ที่โดดเด่น: picoeukaryotes ซึ่งมีความอุดมสมบูรณ์สูงและกลุ่มโปรคาริโอที่ไม่รู้จักสังเกตเห็นเป็นประจำในบ่อเลี้ยงกุ้งในนิวแคลิโดเนีย (Courties และ Boeuf 2004 และลูคัส et al., 2010) การรวมกันของการจัดเรียงเซลล์โดย FCM ด้วยเครื่องมือโมเลกุลช่วยให้ประชาชนอนุกรมวิธานระดับโมเลกุลของเซลล์ planktonic เฉพาะ (Guillebault et al., 2010)
การแปล กรุณารอสักครู่..

ฟาร์มที่เกี่ยวข้องได้รับผลกระทบอย่างรุนแรงโดยสม่ำเสมอและทั้งสองชนิดเฉียบพลันเป็นเวลาหลายปี เครื่องนับเซลล์ ( FCM ) ถูกนำมาใช้เพื่ออธิบายการเปลี่ยนแปลงชุมชนแพลงก์ตอนพืช เพราะเทคนิคนี้เป็นหนึ่งในมีประสิทธิภาพมากที่สุดสำหรับการตรวจสอบอย่างรวดเร็วของประชากร การเปลี่ยนแปลงภายในคอลัมน์น้ำ ( courties และ boeuf , 2004 ) ความน่าเชื่อถือทางสถิติของความอุดมสมบูรณ์ ดีกว่านับเซลล์ด้วยกล้องจุลทรรศน์เป็นสัดส่วนมากกว่าเซลล์ ( พัน ) สามารถวิเคราะห์ช่วงเวลาสั้น ( วินาที ) ( troussellier et al . , 1993 ) แพลงก์ตอนพืชชนิดที่เป็นพิษที่อาจถูกตรวจค้นตัวอย่างที่เก็บรวบรวมได้ในระหว่างอัตราการตายระบาดโดยใช้แสงกล้องจุลทรรศน์ . จะอธิบายเพิ่มเติมได้อย่างถูกต้องและโดยเฉพาะแพลงก์ตอนพืชชุมชน แนวทาง ซึ่งถูกรวมในตัวอย่างของหลาย อนุกรมวิธานของแพลงก์ตอนพืชกลุ่มที่ถูกระบุโดยการวิเคราะห์ HPLC ตามสีสัญลักษณ์ของพวกเขา photopigments แพลงก์ตอนพืชต่าง ๆลักษณะทางเฉพาะกลุ่ม ( chlorophytes cryptophytes ~ , , ไดอะตอม และ ไดโนแฟลเจลเลต ) ( paerl et al . , 2003 และเจฟฟรีย์ et al . , 2011 ) เทคนิคนี้ได้รับการแสดงเพื่อเป็นประโยชน์ในการตรวจหาเปราะบางของแฟลกเจลเลทซึ่งถูกทำลายโดยขั้นตอนที่ใช้สำหรับสังเกตด้วยกล้องจุลทรรศน์ เทคนิคนี้ เรียกว่า chemotaxonomy ได้รับอย่างกว้างขวางและใช้ประสบความสำเร็จในทะเลน้ำเค็มน้ำจืดและสภาพแวดล้อม ( เจฟฟรีย์ et al . , 1997 และ descy et al . , 2009 ) แต่มีการใช้น้อยกว่าเขตร้อน การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำบ่อ ( เบอร์ฟอร์ด , 1997 และ G . kgm อัตราอะไรรึเปล่า ลิซ . kgm rraga et al . 2009 ) การวิเคราะห์เมตาจีโนมิคการจัดเรียงเซลล์ที่เลือกเป็นหนึ่งสดตัวอย่างเพื่อประเมินความหลากหลายของ 2 กลุ่ม ลักษณะเด่น : มีสัดส่วนความหนาแน่นสูงกว่ากลุ่มอื่นๆ ซึ่งอยู่สูงมาก และกลุ่มโพรคาริโอติกไม่ทราบเป็นประจำพบในบ่อเลี้ยงกุ้งในสกอตแลนด์ ( courties boeuf และ 2004 และลูคัส et al . , 2010 ) การรวมกันของเซลล์เรียงลําดับตาม FCM เครื่องมือโมเลกุลช่วยให้กำหนดเฉพาะทางโมเลกุลของสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กมากในน้ำเซลล์ ( guillebault et al . , 2010 )
การแปล กรุณารอสักครู่..
