Cycle conditions werethe same as th

Cycle conditions were
the same as those described for the 16S rRNA gene
amplification except that the annealing temperature was
68 uC. For sequencing, primer 870Rev was used. The
obtained sequences were aligned using CLUSTAL_X, version
2.0 (Thompson et al., 1997) and distance matrices of the
resulting multiple sequence alignments were calculated
using TREECON (Van de Peer & De Wachter, 1997). Rooted
phylogenetic trees were then constructed by the neighbourjoining
method, within the TREECON program. The values for
sequence similarities among the most closely related strains
were determined using the EzTaxon server (Chun et al.,
2007).
The 16S rRNA ge

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เงื่อนไขรอบได้เหมือนกับที่อธิบายไว้ในยีน rRNA 16Sขยายยกเว้นว่าอุณหภูมิหลอม68 uC การจัดลำดับ มีใช้รองพื้น 870Rev ที่มีจัดลำดับที่ได้รับใช้ CLUSTAL_X รุ่น2.0 (ทอมป์สันและ al., 1997) และห่างจากเมทริกซ์ของการผลการจัดลำดับหลายแนวมีคำนวณใช้ TREECON (Van de เพียร์แอนด์เด Wachter, 1997) รากต้นไม้ phylogenetic ถูกสร้างแล้ว โดย neighbourjoiningวิธี ในโปรแกรม TREECON ค่าสำหรับลำดับความเหมือนระหว่างสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดมากที่สุดมีกำหนดใช้เซิร์ฟเวอร์ EzTaxon (ชุน et al.,2007)16S rRNA ge

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เงื่อนไขวงจรเป็น
เช่นเดียวกับที่ระบุไว้สำหรับ 16S rRNA ยีน
ขยายยกเว้นว่าอุณหภูมิการหลอมเป็น
68 UC สำหรับลำดับ 870Rev ไพรเมอร์ที่ใช้
ลำดับได้ถูกจัดชิดโดยใช้ CLUSTAL_X, รุ่น
2.0 (ธ อมป์สัน et al., 1997) และการฝึกอบรมระยะทางของ
ผลการจัดแนวหลายลำดับจะถูกคำนวณ
โดยใช้ TREECON (แวนเดอเพียร์และ De Wachter, 1997) ราก
ต้นไม้ที่ถูกสร้างขึ้นแล้วโดย neighbourjoining
วิธีการภายในโปรแกรม TREECON ค่าสำหรับ
ความคล้ายคลึงกันในหมู่ลำดับสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดมากที่สุด
ได้รับการพิจารณาโดยใช้เซิร์ฟเวอร์ EzTaxon (จุน et al.,
2007).
16S rRNA จีอี

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เงื่อนไขวงจรถูก
เช่นเดียวกับที่อธิบายไว้สำหรับเบส 16S rRNA ยีน
( ยกเว้นที่อุณหภูมิการอบอ่อนคือ
68 เป็นต้น . เพื่อจัดลำดับ 870rev รองพื้นใช้
ได้ลำดับชิดใช้ clustal_x รุ่น
2.0 ( Thompson et al . , 1997 ) และระยะทางที่เมทริกซ์ของ
ที่เกิดการลำดับหลายคำนวณ
ใช้ treecon ( แวน เพื่อน& de wachter , 1997 )รากต้นไม้แล้ว
ซึ่งสร้างโดย neighbourjoining
วิธี ภายในโปรแกรม treecon . ค่าสำหรับ
ลำดับความคล้ายคลึงกันระหว่างสายพันธุ์ส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
ตัดสินใจใช้ eztaxon เซิร์ฟเวอร์ ( ชุน et al . ,

16S rRNA ( GE )