In this context, it is particularly preferred that the ไวด์ไทป์ from which the modified microorganism according to the การประดิษฐ์นี้ has been derived has a 16S rDNA of SEQ ID NO: 1 or a sequence, which shows a ความเหมือนของลำดับ of ทททคือ อย่างน้อย 96%,
อย่างน้อย 97%, อย่างน้อย 98%, อย่างน้อย 99%, อย่างน้อย 99,5%, อย่างน้อย 99,6 %, อย่างน้อย 99,7%, at 5 least 99,8% or อย่างน้อย 99.9% with SEQ ID NO: 1, the identity being the identity over the
whole length of nucleic acid with SEQ ID NO:1.
In this context, it is particularly preferred that the ไวด์ไทป์ from which the modified
microorganism according to the การประดิษฐ์นี้ has been derived has a 23S rDNA of 10 SEQ ID NO: 2 or a sequence, which shows a ความเหมือนของลำดับ ทททคือ of อย่างน้อย 96 %,
อย่างน้อย 97 %, อย่างน้อย 98 %, อย่างน้อย 99% , อย่างน้อย 99,5%, อย่างน้อย 99,6 %, อย่างน้อย 99,7%,
อย่างน้อย 99,8% or ทททที่สุดคือ อย่างน้อย 99.9% with SEQ ID NO: 2., the identity being the
identity over the whole length of nucleic acid with SEQ ID NO:2.
15 The identity in percentage values referred to in connection with the various polypeptides or
polynucleotides to be used for the modified microorganism according to the การประดิษฐ์นี้ is, ทททคือ, calculated as identity of the residues over the complete length of the aligned sequences, such as, for example, the identity calculated (for rather similar
sequences) with the aid of the program needle from the bioinformatics software package
20 EMBOSS (Version 5.0.0, http://emboss.source-forge.net/what/) with the default parameters
5
which are, i.e. gap open (penalty to open a gap): 10.0, gap extend (penalty to extend a gap): 0.5, and data file (scoring matrix file included in package): EDNAFUL.
It should be noted that the modified microorganism according to the การประดิษฐ์นี้ can not only be derived from the above mentioned ไวด์ไทป์-microorganisms, especially from
5 Basfia succiniciproducens-strain DD1, but also from รูปแปรผัน of these strains. In this context
the expression "a รูปแปรผัน of a strain" ประกอบรวมด้วย every strain having the same or essentially
the same characteristics as the ไวด์ไทป์-strain. In this context it is particularly preferred that
the 16 S rDNA of the รูปแปรผัน has an identity of อย่างน้อย 99 %, ทททคือ อย่างน้อย 99.5 %, at
least 99,6 %, อย่างน้อย 99,7%, อย่างน้อย 99,8%, อย่างน้อย 99.9% or ทททที่สุดคือ อย่างน้อย
10 99.9 % with the ไวด์ไทป์ from which the รูปแปรผัน has been derived. Furthermore, it is
particularly preferred that the 23 S rDNA of the รูปแปรผัน has an identity of อย่างน้อย 99 %, ทททคือ อย่างน้อย 99.5 %, อย่างน้อย 99,6 %, อย่างน้อย 99,7%, อย่างน้อย 99,8%, อย่างน้อย 99.9% or ทททที่สุดคือ อย่างน้อย 99.9 % with the ไวด์ไทป์ from which the รูปแปรผัน has been derived. A
รูปแปรผัน of a strain in the sense of this definition can, for example, be obtained by treating the 15 ไวด์ไทป์-strain with a mutagenizing chemical agent, X-rays, or UV light.
The modified microorganism according to the การประดิษฐ์นี้ is characterized in that,
compared to its ไวด์ไทป์, the expression and/or the activity of the enzyme that is encoded
by the a/aD-gene is increased. The term "increased expression and/or activity of the
20 enzyme that is encoded by the alaD-gene", also encompasses a ไวด์ไทป์ microorganism
which has no detectable expression and/or activity of the enzyme that is encoded by the
alaD-gene. Methods for the detection and determination of the expression and/or activity of
the enzyme that is encoded by the alaD-gene can be found, for example, in the Jojima T,
Fujii M, Mod E, Inui M, Yukawa H., Engineering of sugar metabolism of Corynebacterium 25 glutamicum for production of amino acid L-alanine under oxygen deprivation (2010) Appl
Microbiol Biotechnol. 87, 159-165; in WO 2008119009 A2 (Materials and methods for
efficient alanine production); A. Freese, E. Biochim. Biophys. Acta 96, 248-262 (1965) or
Sakamoto et al., J. Ferment. Bioeng. 69, 154-158 (1990); Honorat et al. Enzyme Microb.
Technol. 12, 515-520 (1990); or Laue, H.; Cook, A.M., Arch. Microbiol. 174, 162-167
30 (2000). Preferred is the method described in Jojima et al. (2010).
ในหนึ่งรุรุ the increase of the expression and/or activity of alanine ดีไฮโดรจีเนส
(alaD) is an increase of the expression and/or enzymatic activity by อย่างน้อย 110%,
compared to the expression and/or activity of said enzyme in the ไวด์ไทป์ of the
35 microorganism, or an increase of the expression and/or enzymatic activity by อย่างน้อย 120%,
or ทททกว่าคือ an increase of expression and/or the enzymatic activity by อย่างน้อย
130%, or ทททกว่าคือ an increase of expression and/or the enzymatic activity by at
least 140%, or even ทททกว่าคือ an increase of the expression and/or enzymatic
activity by อย่างน้อย 150% or even ทททกว่าคือ an rincrease of the expression and/or the
40 I enzymatic activity by อย่างน้อย 160%. The expression and/or enzymatic activity of ealanine
ดีไฮโดรจีเนส in the ไวด์ไทป์ is 100% compared to the inc
ในบริบทนี้ มันเป็นที่ต้องการโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ไวด์ไทป์ซึ่งจุลินทรีย์แก้ไขตามการประดิษฐ์นี้ได้รับมามี rDNA 16S ของลำดับ ID ไม่: 1 หรือลำดับ ซึ่งแสดงความเหมือนของลำดับของทททคืออย่างน้อย 96%อย่างน้อยอย่างน้อย 99% อย่างน้อย 99,5, 97% อย่างน้อย 98%% อย่างน้อย 99,6 อย่างน้อย 99,7% อย่างน้อย 5 99,8% หรืออย่างน้อย 99.9% มีลำดับ ID: 1 รหัสการรหัสผ่าน ความยาวทั้งหมดของกรดนิวคลีอิกมีลำดับ ID ไม่: 1ในบริบทนี้ มันเป็นที่ต้องการโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ไวด์ไทป์ซึ่งการปรับเปลี่ยน จุลินทรีย์ตามการประดิษฐ์นี้ได้รับมามี rDNA 23S ของ 10 ลำดับ ID ไม่: 2 หรือลำดับ ซึ่งแสดงทททคือความเหมือนของลำดับของอย่างน้อย 96% อย่างน้อยอย่างน้อย 99% อย่างน้อย 99,5, 97% อย่างน้อย 98%% อย่างน้อย 99,6 อย่างน้อย 99,7 %, อย่างน้อย 99,8% หรือทททที่สุดคืออย่างน้อย 99.9% มีลำดับ ID: 2., มีเอกลักษณ์ รหัสผ่านความยาวทั้งหมดของกรดนิวคลีอิกมีลำดับ ID ไม่: 215 ตัวเปอร์เซ็นต์ค่าที่อ้างอิงกับเปปไทด์ต่าง ๆ หรือเป็น polynucleotides จะใช้สำหรับจุลินทรีย์เพื่อแก้ไขตามการประดิษฐ์นี้ ทททคือ คำนวณเป็นลักษณะเฉพาะของการตกช่วงสมบูรณ์ของลำดับที่จัดตำแหน่ง เช่น เช่น คำนวณรหัสประจำตัว (สำหรับค่อนข้างคล้ายกันลำดับ) ด้วยความช่วยเหลือของเข็มโปรแกรมจากชุดซอฟต์แวร์ bioinformatics 20 EMBOSS (เวอร์ชัน 5.0.0, http://emboss.source-forge.net/what/) กับพารามิเตอร์เริ่มต้น5ที่อยู่ เช่นเปิดช่องว่าง (โทษเพื่อเปิดช่องว่าง): 10.0 ช่องว่างขยาย (โทษเพื่อขยายช่องว่าง): 0.5 และแฟ้มข้อมูล (คะแนนเมตริกซ์แฟ้มรวมอยู่ในแพคเกจ): EDNAFUL ควรสังเกตว่า จุลินทรีย์แก้ไขตามการประดิษฐ์นี้สามารถไม่เพียงได้รับมาจากที่กล่าวไวด์ไทป์-จุลินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งจาก5 Basfia succiniciproducens ต้องใช้ DD1 แต่จากรูปแปรผันของสายพันธุ์เหล่านี้ ในบริบทนี้นิพจน์ประกอบรวมด้วย "รูปแปรผันของต้องใช้" ต้องใช้ทุกมีเดียวกัน หรือเป็นลักษณะเดียวกันเป็นพันธุ์ไวด์ไทป์ ในบริบทนี้ จึงเป็นที่ต้องการโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่rDNA S 16 ของรูปแปรผันมีรหัสประจำตัวอย่างน้อย 99% ทททคืออย่างน้อย 99.5% ที่least 99,6 %, อย่างน้อย 99,7%, อย่างน้อย 99,8%, อย่างน้อย 99.9% or ทททที่สุดคือ อย่างน้อย10 99.9 % with the ไวด์ไทป์ from which the รูปแปรผัน has been derived. Furthermore, it isparticularly preferred that the 23 S rDNA of the รูปแปรผัน has an identity of อย่างน้อย 99 %, ทททคือ อย่างน้อย 99.5 %, อย่างน้อย 99,6 %, อย่างน้อย 99,7%, อย่างน้อย 99,8%, อย่างน้อย 99.9% or ทททที่สุดคือ อย่างน้อย 99.9 % with the ไวด์ไทป์ from which the รูปแปรผัน has been derived. Aรูปแปรผัน of a strain in the sense of this definition can, for example, be obtained by treating the 15 ไวด์ไทป์-strain with a mutagenizing chemical agent, X-rays, or UV light.The modified microorganism according to the การประดิษฐ์นี้ is characterized in that,compared to its ไวด์ไทป์, the expression and/or the activity of the enzyme that is encoded by the a/aD-gene is increased. The term "increased expression and/or activity of the 20 enzyme that is encoded by the alaD-gene", also encompasses a ไวด์ไทป์ microorganism which has no detectable expression and/or activity of the enzyme that is encoded by the alaD-gene. Methods for the detection and determination of the expression and/or activity of the enzyme that is encoded by the alaD-gene can be found, for example, in the Jojima T, Fujii M, Mod E, Inui M, Yukawa H., Engineering of sugar metabolism of Corynebacterium 25 glutamicum for production of amino acid L-alanine under oxygen deprivation (2010) Appl Microbiol Biotechnol. 87, 159-165; in WO 2008119009 A2 (Materials and methods for efficient alanine production); A. Freese, E. Biochim. Biophys. Acta 96, 248-262 (1965) or Sakamoto et al., J. Ferment. Bioeng. 69, 154-158 (1990); Honorat et al. Enzyme Microb. Technol. 12, 515-520 (1990); or Laue, H.; Cook, A.M., Arch. Microbiol. 174, 162-167 30 (2000). Preferred is the method described in Jojima et al. (2010).ในหนึ่งรุรุ the increase of the expression and/or activity of alanine ดีไฮโดรจีเนส (alaD) is an increase of the expression and/or enzymatic activity by อย่างน้อย 110%, compared to the expression and/or activity of said enzyme in the ไวด์ไทป์ of the 35 microorganism, or an increase of the expression and/or enzymatic activity by อย่างน้อย 120%, or ทททกว่าคือ an increase of expression and/or the enzymatic activity by อย่างน้อย 130%, or ทททกว่าคือ an increase of expression and/or the enzymatic activity by at
least 140%, or even ทททกว่าคือ an increase of the expression and/or enzymatic
activity by อย่างน้อย 150% or even ทททกว่าคือ an rincrease of the expression and/or the
40 I enzymatic activity by อย่างน้อย 160%. The expression and/or enzymatic activity of ealanine
ดีไฮโดรจีเนส in the ไวด์ไทป์ is 100% compared to the inc
การแปล กรุณารอสักครู่..

ในบริบทนี้เป็นที่ต้องการโดยเฉพาะอย่างยิ่งว่าไวด์ไทป์จากการที่จุลินทรีย์ที่มีการปรับเปลี่ยนไปตามการประดิษฐ์นี้ได้รับมามี 16S rDNA ของ SEQ ID NO: 1 หรือลำดับซึ่งแสดงให้เห็นความเหมือนของลำดับของ ทททคืออย่างน้อย 96%
อย่างน้อย 97% อย่างน้อย 98% อย่างน้อย 99% อย่างน้อย 99,5% อย่างน้อย 99,6% อย่างน้อย 99,7% อย่างน้อย 5 99,8 % หรืออย่างน้อย 99.9% กับ SEQ ID NO: 1,
เอกลักษณ์เป็นตัวตนในช่วงตลอดความยาวของกรดนิวคลีอิกที่มีSEQ ID NO. 1
ในบริบทนี้เป็นที่ต้องการโดยเฉพาะอย่างยิ่งว่าไวด์ไทป์จากการที่มีการปรับเปลี่ยน
จุลินทรีย์ที่เป็นไปตามการประดิษฐ์นี้ได้รับมามี 23S rDNA 10 SEQ ID NO: 2 หรือลำดับซึ่งแสดงให้เห็นความเหมือนของลำดับทททคือของอย่างน้อย 96%
อย่างน้อย 97% อย่างน้อย 98% , อย่างน้อย 99% อย่างน้อย 99,5% อย่างน้อย 99,6% อย่างน้อย 99,7%
อย่างน้อย 99,8% หรือทททที่สุดคืออย่างน้อย 99.9% กับ SEQ ID NO: 2,
เอกลักษณ์ของการเป็นตัวตนมากกว่าความยาวทั้งหมดของกรดนิวคลีอิกที่มีSEQ ID NO. 2 15 ตัวตนในค่าร้อยละที่อ้างถึงในการเชื่อมต่อกับ polypeptides ต่างๆหรือpolynucleotides ที่จะใช้สำหรับจุลินทรีย์ที่มีการปรับเปลี่ยนไปตามการประดิษฐ์นี้มี ทททคือคำนวณเป็นตัวตนของสารตกค้างในช่วงระยะเวลาที่สมบูรณ์ของลำดับชิดเช่นยกตัวอย่างเช่นตัวตนคำนวณ(สำหรับค่อนข้างคล้ายลำดับ) ด้วยความช่วยเหลือของเข็มโปรแกรมจากแพคเกจซอฟต์แวร์รส 20 นูน (เวอร์ชั่น 5.0.0, http://emboss.source-forge.net/what/) กับค่าเริ่มต้นที่5 ซึ่งเป็นช่องว่างเช่นเปิด (โทษที่จะเปิดช่องว่าง): 10.0 ขยายช่องว่าง (โทษที่จะขยายช่องว่าง) 0.5 และแฟ้มข้อมูล (คะแนนไฟล์เมทริกซ์รวมอยู่ในแพคเกจ). EDNAFUL มันควรจะตั้งข้อสังเกตว่าจุลินทรีย์มีการปรับเปลี่ยนไปตามการประดิษฐ์นี้สามารถไม่เพียง แต่จะได้รับจากที่กล่าวข้างต้นไวด์ไทป์ -microorganisms โดยเฉพาะจาก5 Basfia succiniciproducens ความเครียด DD1 แต่ยังมาจากรูปแปรผันของสายพันธุ์เหล่านี้ ในบริบทนี้การแสดงออก "ซึ่งเป็นรูปแปรผันของสายพันธุ์" ประกอบรวมด้วยทุกสายพันธุ์ที่มีความเหมือนกันหรือเป็นหลักลักษณะเช่นเดียวกับไวด์ไทป์-strain ในบริบทนี้เป็นที่ต้องการโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่16 S rDNA ของรูปแปรผันมีตัวตนของอย่างน้อย 99%, ทททคืออย่างน้อย 99.5% อย่างน้อย99,6% อย่างน้อย 99,7% อย่างน้อย 99 8% อย่างน้อย 99.9% หรือทททที่สุดคืออย่างน้อย10 99.9% กับไวด์ไทป์จากการที่รูปแปรผันได้รับมา นอกจากนี้ยังเป็นที่ต้องการโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ 23 S rDNA ของรูปแปรผันมีตัวตนของอย่างน้อย 99%, ทททคืออย่างน้อย 99.5% อย่างน้อย 99,6% อย่างน้อย 99,7% อย่างน้อย 99 8% อย่างน้อย 99.9% หรือทททที่สุดคืออย่างน้อย 99.9% กับไวด์ไทป์จากการที่รูปแปรผันได้รับมา รูปแปรผันของสายพันธุ์ในแง่ของความหมายนี้สามารถยกตัวอย่างเช่นจะได้รับจากการรักษา 15 ไวด์ไทป์ -strain กับสารเคมี mutagenizing รังสีเอกซ์หรือแสงยูวี. จุลินทรีย์ปรับเปลี่ยนไปตามการ ประดิษฐ์นี้เป็นลักษณะในการที่เมื่อเทียบกับไวด์ไทป์ของการแสดงออกและ/ หรือกิจกรรมของเอนไซม์ที่มีการเข้ารหัสโดยการ/ โฆษณายีนที่เพิ่มขึ้น คำว่า "การแสดงออกที่เพิ่มขึ้นและ / หรือการทำงานของเอนไซม์ที่20 ที่มีการเข้ารหัสโดย alaD ยีน" ยังครอบคลุมไวด์ไทป์จุลินทรีย์ซึ่งไม่มีการตรวจพบการแสดงออกและ/ หรือการทำงานของเอนไซม์ที่มีการเข้ารหัสโดยalaD- ยีน. วิธีการสำหรับการตรวจสอบและความมุ่งมั่นในการแสดงออกและ / หรือการทำงานของเอนไซม์ที่มีการเข้ารหัสโดยalaD ยีนสามารถพบได้เช่นใน Jojima T, ฟูจิอิมมด E, Inui เอ็มเอช Yukawa วิศวกรรม ของการเผาผลาญน้ำตาล Corynebacterium glutamicum 25 สำหรับการผลิตกรดอะมิโน L-อะลานีนภายใต้การกีดกันออกซิเจน (2010) Appl Microbiol Biotechnol 87, 159-165; ใน WO 2008119009 A2 (วัสดุและวิธีการสำหรับการผลิตอะลานีนที่มีประสิทธิภาพ); A. Freese อี Biochim Biophys Acta 96, 248-262 (1965) หรือSakamoto et al., เจ Ferment Bioeng 69, 154-158 (1990); Honorat et al, เอนไซม์จุลชีววิทยา. วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี 12, 515-520 (1990); หรือ Laue, H .; คุก AM ประตูชัย Microbiol 174, 162-167 30 (2000) ที่ต้องการเป็นวิธีการที่อธิบายไว้ใน Jojima et al, (2010). ในหนึ่งรุรุการเพิ่มขึ้นของการแสดงออกและ / หรือกิจกรรมของอะลานีนดีไฮโดรจีเนส(alaD) คือการเพิ่มขึ้นของการแสดงออกและ / หรือเอนไซม์โดยอย่างน้อย 110% เมื่อเทียบกับการแสดงออกและ / หรือกิจกรรมของเอนไซม์กล่าวว่าในไวด์ไทป์ของ35 จุลินทรีย์หรือเพิ่มขึ้นในการแสดงออกและ / หรือเอนไซม์โดยอย่างน้อย 120% หรือทททกว่าคือการเพิ่มขึ้นของการแสดงออกและ / หรือเอนไซม์โดยอย่าง น้อย130% หรือทททกว่าคือการเพิ่มขึ้นของการแสดงออกและ / หรือเอนไซม์โดยอย่างน้อย140% หรือแม้กระทั่งทททกว่าคือการเพิ่มขึ้นของการแสดงออกและ / หรือเอนไซม์กิจกรรมโดยอย่างน้อย150% หรือแม้กระทั่งททท กว่าคือ rincrease ในการแสดงออกและ / หรือ40 ผมเอนไซม์กิจกรรมโดยอย่างน้อย 160% การแสดงออกและ / หรือกิจกรรมของเอนไซม์ ealanine ดีไฮโดรจีเนสในไวด์ไทป์ 100% เมื่อเทียบกับอิงค์
การแปล กรุณารอสักครู่..
