2.4. Molecular studies
Chromosomal DNA extraction was carried out using an isolation kit (Fermentas, Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA). Primers Hdc3F (50AGATGGTATTGTTTCTTATGA30) and Hdc4R (50CAAACACCAGCATCTTC30) were designed for amplification of a 435 bp length part of hdc gene (Coton & Coton, 2005). Oligonucleotides were obtained from Iontek (Istanbul, Turkey). PCR was done in 40 lL of mixture by using Fermentas DNA polymerase, 5 U/lL, and 10 PCR buffer (Amersham, Little Chalfont, UK). Twenty picomoles of each primer were used, and deoxynucleoside triphosphates (dNTPs) (Fermentas) were used at a concentration of 250 lM each. The genomic DNA of S. thermophilus isolates was used as a template. PCR ampli-fications were performed in a DNA thermal cycler with the following thermal cycling program: initial cycle, 2 min at 95 C; next 30 cycles, 1 min at 94 C; 1 min at 65 C, and 2 min at 72 C. Amplified PCR products were run on 1.5% electrophoresis gel (Bio-Rad, Hercules,CA) and analysed under UV light.
2.4 . การศึกษาโครโมโซมดีเอ็นเอโมเลกุล
การสกัดโดยใช้การแยกชุด ( fermentas , เทอร์โมฟิชเชอร์ทางวิทยาศาสตร์ ทัม มา ) ไพรเมอร์ hdc3f ( 50agatggtattgtttcttatga30 ) และ hdc4r ( 50caaacaccagcatcttc30 ) ถูกออกแบบมาสำหรับการเพิ่มความยาว 435 BP ส่วนของยีน HDC ( T T & , 2005 ) โอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ได้จาก iontek ( อิสตันบูล , ตุรกี )PCR ได้ 40 จะผสมโดยใช้ fermentas DNA polymerase 5 U / ll และ 10 วิธี PCR buffer ( ที่น้อย , ริดสีดวงทวาร , UK ) ยี่สิบ picomoles ของแต่ละสีถูกใช้ และ deoxynucleoside ไตรฟ เฟต ( dntps ) ( fermentas ) ใช้ที่ความเข้มข้น 250 โดยแต่ละ ดีเอ็นเอจีโนมของเชื้อ S . สีที่ได้จากธรรมชาติมาใช้เป็นแม่แบบPCR ampli fications แสดงในดีเอ็นเอวงจรความร้อนด้วยโปรแกรมการขี่จักรยานการระบายความร้อน ดังนี้ รอบแรก 2 นาทีที่ 95 C ; ถัดไป 30 รอบ 1 นาทีที่ 94 c ; 1 นาทีที่ 65 C และ 2 นาทีที่ 72 องศาเซลเซียส โดยขยายผลิตภัณฑ์ใช้ 1.5% electrophoresis เจล ( ไบโอ ราด , Hercules , CA ) และวิเคราะห์ภายใต้แสง UV .
การแปล กรุณารอสักครู่..