Mitochondrial DNA analysis. Analyse

Mitochondrial DNA analysis. Analyses of mtDNA in tigers and in
other Panthera species is complicated by the presence of a large 12.8
kb nuclear mtDNA fragment that transposed to chromosome F2 in an
ancestral Panthera species approximately 3 MYA (Johnson et al. 1996;
Lopez et al. 1996; Cracraft et al. 1998; J. H. Kim, A. Antunes, S.-J. Luo,
J. Menninger, W. G. Nash, et al., personal communication). Although
the Numt and Cymt DNA sequences have diverged, primers designed
from conserved regions often coamplify both copies. Fifteen Cymtspecific
primer sets (see Figure 2 and Table 1) were designed on the
basis of sequence differences from the alignments of the complete
tiger Numt and the homologous 12.8-kb Cymt sequences (J. H. Kim,
A. Antunes, S.-J. Luo, J. Menninger, W. G. Nash, et al., personal
communication). These Cymt primers amplified a total of 6,026 bp of
sequence, spanning ten mitochondrial gene segments, including
NADH dehydrogenase subunits 1, 2, 5, and 6 (ND1, ND2, ND5, and
ND6), cytochrome B (CytB), control region (CR), 12S rRNA (12S),
cytochrome C oxidase subunits I and II (COI and COII), and ATPase8
(ATP8) (see Figure 2). The primer sets were tested in 15 individuals
representing tigers from all five traditional subspecies. Five segments
that revealed no variation in the pilot screening were excluded from
further analysis (see Figure 2).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์ดีเอ็นเอที่ยล วิเคราะห์ของ mtDNA ในเสือ และในชนิด Panthera อื่น ๆ มีความซับซ้อน โดยการปรากฏตัวของ 12.8 มีขนาดใหญ่kb นิวเคลียร์ mtDNA fragment ที่แบบสลับแกนให้โครโมโซมที่ F2 ในการชนิด Panthera ของบรรพบุรุษประมาณ 3 เมียะ (จอห์นสัน et al. 1996นิเฟอร์โลเปซ et al. 1996 Cracraft et al. 1998 J. H. Kim, A. Antunes เอสเจ LuoJ. Menninger, W. G. Nash, et al. การสื่อสาร) ถึงแม้ว่าลำดับที่ Numt และ Cymt ดีเอ็นเอได้แยกออก การออกแบบไพรเมอร์จากพื้นที่อนุรักษ์มักจะ coamplify ทั้งสำเนา สิบห้า Cymtspecificชุดรองพื้น (ดูรูปที่ 2 และตารางที่ 1) ออกแบบในการพื้นฐานของลำดับความแตกต่างจากการจัดแนวของสมบูรณ์เสือ Numt และ 12.8 kb เซทจะมีลำดับ Cymt (J. H. KimA. Antunes เอสเจ Luo, J. Menninger วัตต์ G. Nash, et al. ส่วนบุคคลการสื่อสาร) ไพรเมอร์ Cymt เหล่านี้ขยายรวม 6,026 bp ของลำดับ ทอดสิบยีนยลตลาดโปรแกรมพร่อง NADH 1, 2, 5 และ 6 (ND1, ND2, ND5 และND6), cytochrome B (CytB), พื้นที่ควบคุม (CR), 12S rRNA (12S),โปรแกรม cytochrome C oxidase ฉัน และ II (COI และ COII), และ ATPase8(ATP8) (ดูรูปที่ 2) ทดสอบชุดไพรเมอร์ในบุคคล 15เสือที่แสดงจากชนิดย่อยดั้งเดิมห้าทั้งหมด ส่วนที่ห้าที่เปิดเผยไม่ผันแปรในนำร่องตรวจคัดกรองถูกแยกออกจากวิเคราะห์ต่อไป (ดูรูปที่ 2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ดีเอ็นเอยล การวิเคราะห์ mtDNA ในเสือและใน
สายพันธุ์เสืออื่น ๆ ที่มีความซับซ้อนโดยการปรากฏตัวของขนาดใหญ่ 12.8
KB mtDNA นิวเคลียร์ชิ้นส่วนที่ย้ายไปโครโมโซม F2 ใน
บรรพบุรุษเสือสายพันธุ์ประมาณ 3 ม (จอห์นสัน et al, 1996.
Lopez et al, 1996. Cracraft et al, 1998. JH คิมเอตูนส์ S.-J. Luo,
เจนิงเกอร์, WG แนช, et al, การสื่อสารส่วนบุคคล). แม้ว่า
ลำดับ Numt และ Cymt ดีเอ็นเอต้องแยกออกไพรเมอร์ได้รับการออกแบบ
จากภูมิภาคอนุรักษ์มัก coamplify ทั้งเล่ม สิบห้า Cymtspecific
ชุดไพรเมอร์ (ดูรูปที่ 2 และตารางที่ 1) ได้รับการออกแบบบน
พื้นฐานของความแตกต่างจากลำดับการจัดแนวของสมบูรณ์
เสือ Numt และคล้ายคลึงกัน 12.8 กิโลไบต์ลำดับ Cymt (JH คิม
เอตูนส์ S.-J. Luo เจนิงเกอร์, WG แนช, et al., ส่วนบุคคล
การสื่อสาร) เหล่านี้ไพรเมอร์ Cymt ขยายทั้งหมด 6,026 bp ของ
ลำดับทอดสิบกลุ่มยีนยลรวมทั้ง
NADH หน่วยย่อย dehydrogenase 1, 2, 5 และ 6 (ND1, ND2, ND5 และ
ND6) cytochrome b (CytB), เครื่องควบคุมภูมิภาค ( CR) rRNA 12S (12S)
cytochrome oxidase C หน่วยย่อย I และ II (COI และ COII) และ ATPase8
(ATP8) (ดูรูปที่ 2) ชุดไพรเมอร์ได้รับการทดสอบใน 15 บุคคล
ที่เป็นตัวแทนของเสือจากทั้งห้าชนิดย่อยแบบดั้งเดิม ห้าส่วน
ที่เผยให้เห็นการเปลี่ยนแปลงในการตรวจคัดกรองนักบินไม่ได้รับการยกเว้นจาก
การวิเคราะห์ต่อไป (ดูรูปที่ 2)