Polymorphic variants of DNA repair

Polymorphic variants of DNA repair and damage response genes play major role in carcinogenesis. These variants are suspected as predisposition factors to Oral Squamous Cell Carcinoma (OSCC). For identification of susceptible variants affecting OSCC development in Indian population, the “maximally informative” method of SNP selection from HapMap data to non-HapMap populations was applied. Three hundred twenty-five SNPs from 11 key genes involved in double strand break repair, mismatch repair and DNA damage response pathways were genotyped on a total of 373 OSCC, 253 leukoplakia and 535 unrelated control individuals. The significantly associated SNPs were validated in an additional cohort of 144 OSCC patients and 160 controls. The rs12515548 of MSH3 showed significant association with OSCC both in the discovery and validation phases (discovery P-value: 1.43E-05, replication P-value: 4.84E-03). Two SNPs (rs12360870 of MRE11A, P-value: 2.37E-07 and rs7003908 of PRKDC, P-value: 7.99E-05) were found to be significantly associated only with leukoplakia. Stratification of subjects based on amount of tobacco consumption identified SNPs that were associated with either high or low tobacco exposed group. The study reveals a synergism between associated SNPs and lifestyle factors in predisposition to OSCC and leukoplakia.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ซ่อมแซม polymorphic ย่อยของดีเอ็นเอ และยีนที่ตอบสนองต่อความเสียหายเล่นบทบาท carcinogenesis ตัวแปรเหล่านี้ถูกสงสัยว่าเป็น predisposition ปัจจัยการปาก Squamous เซลล์ Carcinoma (OSCC) วิธีเลือก SNP HapMap ข้อมูลประชากรไม่ HapMap "maximally ข้อมูล" นำมาใช้สำหรับการระบุย่อยไวต่อกระทบ OSCC พัฒนาประชากรอินเดีย SNPs สามร้อยยี่สิบห้าจากยีนที่สำคัญ 11 เกี่ยวข้องในการซ่อมแซมแบ่งสาระคู่ ซ่อมไม่ตรงกัน และมนต์ตอบความเสียหายของดีเอ็นเอมี genotyped บนจำนวน 373 OSCC, 253 leukoplakia และบุคคลไม่เกี่ยวข้องควบคุม 535 SNPs สัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญได้ผ่านการตรวจสอบใน cohort เพิ่มเติมของผู้ป่วย OSCC 144 และควบคุม 160 Rs12515548 ของ MSH3 พบความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญกับ OSCC ทั้งระยะค้นหาและตรวจสอบ (ค้นหาค่า P: 1.43E-05 จำลองค่า P: 4.84E-03) สอง SNPs (rs12360870 MRE11A ค่า P: 2.37E-07 และ rs7003908 ของ PRKDC ค่า P: 7.99E-05) พบที่สัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญเท่ากับ leukoplakia สาระของวิชาตามจำนวนปริมาณการใช้ยาสูบระบุ SNPs ที่เชื่อมโยงกับกลุ่มใดสัมผัสยาสูบสูง หรือต่ำ การศึกษาพบว่า ปัจจัย synergism ระหว่าง SNPs และวิถีชีวิตที่เกี่ยวข้องใน predisposition OSCC และ leukoplakia

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สายพันธุ์ polymorphic ของการซ่อมแซมดีเอ็นเอและความเสียหายยีนตอบสนองการเล่นบทบาทสำคัญในการเกิดมะเร็ง สายพันธุ์เหล่านี้จะถูกสงสัยว่าเ​​ป็นปัจจัยจูงใจเพื่อช่องปาก squamous เซลล์ (OSCC) สำหรับบัตรประจำตัวของสายพันธุ์ที่ไวต่อผลกระทบต่อการพัฒนา OSCC ประชากรในอินเดีย, "ที่สุดข้อมูล" วิธีการของการเลือก SNP จากข้อมูล HapMap กับประชากรที่ไม่ HapMap ถูกนำมาใช้ สามร้อยยี่สิบห้า SNPs ตั้งแต่วันที่ 11 ยีนที่สำคัญที่เกี่ยวข้องในสาระคู่ซ่อมแซมแบ่งการซ่อมแซมไม่ตรงกันและความเสียหายของดีเอ็นเอการตอบสนองทางเดินถูก genotyped บนทั้งหมด 373 OSCC 253 leukoplakia และ 535 บุคคลที่ไม่เกี่ยวข้องกับการควบคุม SNPs ที่เกี่ยวข้องอย่างมีนัยสำคัญได้รับการตรวจสอบในการศึกษาเพิ่มเติมจาก 144 ผู้ป่วย OSCC และ 160 ควบคุม rs12515548 ของ MSH3 แสดงให้เห็นความเชื่อมโยงที่สำคัญกับ OSCC ทั้งในขั้นตอนการค้นพบและการตรวจสอบ (ค้นพบ P-value: 1.43E-05, การจำลองแบบ P-value: 4.84E-03) สอง SNPs (rs12360870 ของ MRE11A, P-value: 2.37E-07 และ rs7003908 ของ PRKDC, P-value: 7.99E-05) พบว่ามีการเชื่อมโยงอย่างมีนัยสำคัญเฉพาะกับ leukoplakia การแบ่งชั้นของอาสาสมัครขึ้นอยู่กับปริมาณของการบริโภคยาสูบ SNPs ระบุว่ามีความสัมพันธ์กับทั้งสูงหรือต่ำกลุ่มสัมผัสยาสูบ จากการศึกษาพบเสริมฤทธิ์ระหว่าง SNPs ที่เกี่ยวข้องและปัจจัยการดำเนินชีวิตในการจูงใจ OSCC และ leukoplakia

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จำนวนตัวแปรของการซ่อมแซมดีเอ็นเอและยีนตอบสนองความเสียหายเล่นมีบทบาทสำคัญในมะเร็ง ตัวแปรเหล่านี้จะถูกสงสัยว่า เป็นปัจจัยจูงใจในช่องปาก squamous เซลล์ ( oscc ) ชนิดของตัวแปรที่มีผลต่อการพัฒนา oscc ต่อประชากรในอินเดีย , " ข้อมูล " ที่สุดวิธีการเลือกข้อมูลจาก hapmap SNP ไม่มี hapmap ประชากรที่ใช้สามร้อยยี่สิบห้า snps จาก 11 คีย์ยีนที่เกี่ยวข้องกับคู่เกลียวพังซ่อม , ซ่อมและเส้นทางการตอบสนองดีเอ็นเอไม่ตรงกัน คือ genotyped ในความเสียหายทั้งหมด 373 oscc 253 ลิวโคพลาเกีย , 535 ไม่เกี่ยวข้องและควบคุมบุคคล มีความสัมพันธ์ snps ตรวจสอบความตรงในการติดตามผู้ป่วย oscc เพิ่มเติม 144 และ 160 ควบคุมการ rs12515548 ของ msh3 พบความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญกับ oscc ทั้งในการค้นพบและการตรวจสอบขั้นตอน ( p : 1.43e-05 การค้นพบ , p : 4.84e-03 ) สอง snps ( rs12360870 ของ mre11a , p-value : 2.37e-07 rs7003908 ของ prkdc และร้อยละ : 7.99e-05 ) พบว่ามีความสัมพันธ์แค่เป็นโรคเลือด .การแบ่งชั้นของคน ตามปริมาณการบริโภคยาสูบระบุ snps ที่เกี่ยวข้องกับทั้งสูงหรือต่ำ ยาสูบ เปิดเผย กรุ๊ป จากการศึกษาพบมีการเกื้อกูลระหว่างที่เกี่ยวข้อง snps และปัจจัยวิถีชีวิตและโอนเอียง oscc ลิวโคพลาเกีย .