Evolutionary algorithms have been u

Evolutionary algorithms have been used to optimise the performance of neural network models before. This paper uses a hybrid approach by permanently attaching a genetic algorithm (GA) to a hierarchical clusterer to investigate appropriate parameter values for producing specific tree shaped representations for some gene sequence data. It addresses a particular problem where the size of the data set makes the direct use of a GA too time consuming. We show by using a data set nearly two orders of magnitude smaller in the GA investigation that the results can be usefully translated across to the real, much larger data sets. The data sets in question are gene sequences and the aim of the analysis was to cluster short subsequences that could represent binding sites that regulate the expression of genes.

Published in:

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีการใช้อัลกอริทึมวิวัฒนาการการปรับปรุงประสิทธิภาพของโครงข่ายประสาทรุ่นก่อน เอกสารนี้ใช้วิธีไฮบริด โดยถาวรแนบอัลกอริธึมพันธุกรรม (GA) เพื่อ clusterer ลำดับการตรวจสอบค่าพารามิเตอร์ที่เหมาะสมสำหรับการผลิตเฉพาะต้นไม้รูปแทนสำหรับบางข้อมูลลำดับยีน จะเน้นปัญหาเฉพาะซึ่งขนาดของชุดข้อมูลช่วยการใช้ GA ตรงเกินไปใช้เวลานาน เราแสดง โดยใช้เป็นชุดข้อมูลเกือบสองอันดับของขนาดเล็กในการสืบสวนสอบสวนของ GA ที่ผลประโยชน์สูงสุดแปลทั่วไปจริง ชุดข้อมูลขนาดใหญ่มาก ชุดข้อมูลในคำถามลำดับยีน และจุดมุ่งหมายของการวิเคราะห์คือการ subsequences สั้นที่อาจแสดงถึงการผูกไซต์ที่ควบคุมการแสดงออกของยีน ของคลัสเตอร์ประกาศ:

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขั้นตอนวิธีการวิวัฒนาการได้ถูกนำมาใช้เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของแบบจำลองเครือข่ายประสาทก่อน กระดาษนี้จะใช้วิธีการไฮบริดโดยถาวรติดขั้นตอนวิธีพันธุกรรม (GA) เพื่อ clusterer ลำดับชั้นในการตรวจสอบค่าพารามิเตอร์ที่เหมาะสมสำหรับการผลิตการแสดงต้นไม้ที่มีรูปทรงที่เฉพาะเจาะจงสำหรับบางข้อมูลลำดับยีน มันอยู่ที่ปัญหาเฉพาะที่ขนาดของชุดข้อมูลทำให้การใช้โดยตรงของเวลา GA นานเกินไป เราจะแสดงโดยใช้ข้อมูลที่ตั้งเกือบสองคำสั่งของขนาดที่เล็กกว่าในการสืบสวน GA ว่าผลที่สามารถแปลเป็นประโยชน์ข้ามไปจริงชุดข้อมูลขนาดใหญ่มาก ชุดข้อมูลในคำถามเป็นลำดับยีนและจุดมุ่งหมายของการวิเคราะห์คือการจัดกลุ่ม subsequences สั้น ๆ ที่จะเป็นตัวแทนของเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันที่ควบคุมการแสดงออกของยีน. ตีพิมพ์ใน: