were evaluated (such as CHN and UK:

were evaluated (such as CHN and UK: Fig. 1), the amplification time
was extended, and therefore these sets were considered unsuitable
for further evaluation (data not shown).
To evaluate the performance of the multiplex RT-LAMP assays,
300 FMDV samples were tested and the results were compared
with a real-time RT-PCR assay. The multiplex RT-LAMP assays
demonstrated diagnostic sensitivities of 98.0% (243/248), 97.6%
(242/248), 96.0% (238/248) and 94.8% (235/248) for assay combinations CHN/82, JPN/81, JPN/12 and UK/12, respectively (Table 2).
A comparison between representative data generated by real-time
RT-PCR and a multiplex LAMP assay is shown in Fig. 2. Across the
multiplex panels, the samples that generated a positive real-time
RT-PCR result (with a Ct value less than 32.0) but were negative
using the RT-LAMP comprised 13 different samples: 3 were shared
between JPN/81 and JPN/12 assays, 2 were shared between CHN/82
and UK/12 assays and the remaining were unique to individual
assays. Seventeen samples that generated duplicate Ct values in the
range >32 and

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

were evaluated (such as CHN and UK: Fig. 1), the amplification timewas extended, and therefore these sets were considered unsuitablefor further evaluation (data not shown).To evaluate the performance of the multiplex RT-LAMP assays,300 FMDV samples were tested and the results were comparedwith a real-time RT-PCR assay. The multiplex RT-LAMP assaysdemonstrated diagnostic sensitivities of 98.0% (243/248), 97.6%(242/248), 96.0% (238/248) and 94.8% (235/248) for assay combinations CHN/82, JPN/81, JPN/12 and UK/12, respectively (Table 2).A comparison between representative data generated by real-timeRT-PCR and a multiplex LAMP assay is shown in Fig. 2. Across themultiplex panels, the samples that generated a positive real-timeRT-PCR result (with a Ct value less than 32.0) but were negativeusing the RT-LAMP comprised 13 different samples: 3 were sharedbetween JPN/81 and JPN/12 assays, 2 were shared between CHN/82and UK/12 assays and the remaining were unique to individualassays. Seventeen samples that generated duplicate Ct values in therange >32 and <50 were also assigned as positive (Table 2). Mostof these samples also produced positive results when tested by themultiplex RT-LAMP assays (Table 2). Selected samples that were real-time RT-PCR positive but failed to generate a signal using the RT-LAMP assay were tested further. For example, repeat testing of the two samples that were real-time RT-PCR positive, but negative using the best performing multiplex RT-LAMP combination (CHN and 82 primer sets) generated positive signals for 4/5 replicates of one of the samples (O/SUD/3/2005), while only 2/5 replicates were RT-LAMP positive for the other sample (O/SUD/1/99). Furthermore, the Tp values for these replicates were high (39:12, 49:36,51:00, 56:18 and 53:06, 56:18 for O/SUD/3/2005 and O/SUD/1/99,

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ได้รับการประเมิน (เช่น CHN และสหราชอาณาจักร. รูปที่ 1) เวลาขยาย
ได้ขยายและดังนั้นชุดนี้ได้รับการพิจารณาที่ไม่เหมาะสม
สำหรับการประเมินผลต่อไป (ไม่ได้แสดงข้อมูล).
เพื่อประเมินประสิทธิภาพของชุดตรวจ multiplex RT-โคมไฟ,
300 FMDV กลุ่มตัวอย่างได้รับการทดสอบและผลที่ได้รับเมื่อเทียบ
กับเวลาจริงการทดสอบ RT-PCR ตรวจ multiplex RT-ไฟ
แสดงให้เห็นถึงความเปราะบางของการวินิจฉัย 98.0% (243/248) 97.6%
(242/248) 96.0% (238/248) และ 94.8% (235/248) สำหรับการทดสอบการรวม CHN / 82, JPN / 81, JPN / 12 และสหราชอาณาจักร / 12 ตามลำดับ (ตารางที่ 2).
การเปรียบเทียบระหว่างข้อมูลที่สร้างขึ้นโดยตัวแทนแบบ real-time
RT-PCR และการทดสอบโคมไฟหลายแสดงในรูป 2. ข้าม
แผงหลายตัวอย่างที่สร้างบวกเรียลไทม์
ผล RT-PCR (มีค่าซีทีน้อยกว่า 32.0) แต่เป็นลบ
โดยใช้ RT-13 ประกอบด้วยโคมไฟที่แตกต่างกันตัวอย่าง: 3 ร่วมกัน
ระหว่าง JPN / 81 JPN / 12 การตรวจ 2 ถูกใช้ร่วมกันระหว่าง CHN / 82
และสหราชอาณาจักร / 12 การตรวจและส่วนที่เหลือเป็นเอกลักษณ์ของแต่ละบุคคลที่จะ
ตรวจ เจ็ดตัวอย่างที่สร้างซ้ำค่ากะรัตใน
ช่วง> 32 <50 นอกจากนี้ยังได้รับมอบหมายให้เป็นบวก (ตารางที่ 2) ส่วนใหญ่
ของกลุ่มตัวอย่างเหล่านี้ยังผลิตผลลัพธ์ที่เป็นบวกเมื่อทดสอบโดยการตรวจ themultiplex RT-โคมไฟ (ตารางที่ 2) กลุ่มตัวอย่างที่เลือกที่เป็นเรียลไทม์ RT-PCR บวก แต่ล้มเหลวในการสร้างสัญญาณโดยใช้การทดสอบ RT-โคมไฟมีการทดสอบต่อไป ยกตัวอย่างเช่นการทำซ้ำการทดสอบของทั้งสองกลุ่มตัวอย่างที่เป็นแบบ real-time RT-PCR บวก แต่ในเชิงลบโดยใช้การดำเนินการที่ดีที่สุด multiplex RT-โคมไฟรวมกัน (CHN และ 82 ชุดไพรเมอร์) ที่สร้างสัญญาณในเชิงบวกสำหรับ 4/5 ซ้ำของหนึ่งในตัวอย่าง (O / SUD / 3/2005) ในขณะที่เพียง 2/5 ซ้ำเป็น RT-โคมไฟในเชิงบวกสำหรับตัวอย่างอื่น ๆ (O / SUD / 1/99) นอกจากนี้ค่าสำหรับ Tp ซ้ำเหล่านี้อยู่ในระดับสูง (39:12, 49: 36,51: 00, 56:18 และ 53:06, 56:18 สำหรับ O / SUD / 3/2005 และ O / SUD / 1/99 ,

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตัวอย่างเหล่านี้ยังได้สร้างผลลัพธ์ที่เป็นบวก เมื่อทดสอบโดย themultiplex rt-lamp ) ( ตารางที่ 2 ) ตัวอย่างที่เป็นเรียลไทม์นี้บวกแต่ล้มเหลวในการสร้างสัญญาณที่ใช้ใน rt-lamp ทดสอบเพิ่มเติม ตัวอย่างเช่น ย้ำการทดสอบของทั้งสองตัวอย่างที่เป็นเรียลไทม์นี้บวกประเมิน ( เช่น chn และสหราชอาณาจักร : รูปที่ 1 ) , เวลา (
ถูกขยาย และดังนั้น ชุดเหล่านี้ถูกถือว่าไม่เหมาะสม
การประเมินเพิ่มเติม ( ข้อมูลไม่แสดง ) .
เพื่อประเมินประสิทธิภาพของวิธี rt-lamp multiplex
300 fmdv จำนวนการทดสอบและเปรียบเทียบด้วยวิธี RT-PCR
แบบเรียลไทม์ หรือ rt-lamp multiplex
) วินิจฉัยความไวของ 980 % ( 243 / 248 ) , 97.6 %
( 242 / 0 ) , 96.0 % ( 238 / 248 ) และ 94.8 % ( 235 / 248 ) ใช้ผสม CHN / 82 JPEG / 81 , JPEG / UK / 12 และ 12 ตามลำดับ ( ตารางที่ 2 ) .
เปรียบเทียบระหว่างตัวแทนข้อมูลที่สร้างขึ้น โดยวิธี RT-PCR ) แบบเรียลไทม์ และใช้เป็นโคมไฟมัลติ
แสดงในรูปที่ 2 . ข้าม
แผ่น multiplex RT-PCR ตัวอย่างที่สร้างเรียลไทม์
ผลบวก ( CT มีค่าน้อยกว่า 32ตัวอย่างเหล่านี้ยังได้สร้างผลลัพธ์ที่เป็นบวก เมื่อทดสอบโดย themultiplex rt-lamp ) ( ตารางที่ 2 ) ตัวอย่างที่เป็นเรียลไทม์นี้บวกแต่ล้มเหลวในการสร้างสัญญาณที่ใช้ใน rt-lamp ทดสอบเพิ่มเติม ตัวอย่างเช่น ย้ำการทดสอบของทั้งสองตัวอย่างที่เป็นเรียลไทม์นี้บวก0 ) แต่ถูกลบ
ใช้ rt-lamp จำนวน 13 ตัวอย่างที่แตกต่างกัน : 3 ที่แบ่งปัน
ระหว่าง JPEG / 81 และ JPEG / 12 ) , 2 ) ร่วมกันระหว่าง CHN / 82 และ UK / 12
) และที่เหลือมีเฉพาะบุคคล )

ตัวอย่างที่ 17 ที่สร้างซ้ำ CT ค่าในช่วง >
< 50 32 และยังได้รับมอบหมายให้เป็นบวก ( ตารางที่ 2 )
ที่สุดแต่ลบโดยใช้การแสดงที่ดีที่สุดมัลติ rt-lamp รวมกัน ( CHN และ 82 primer ชุด ) สร้างสัญญาณบวก 4 / 5 ซ้ำหนึ่งในตัวอย่าง ( O / ทรุด / 3 / 2005 ) ในขณะที่เพียง 2 / 5 แบบคือ rt-lamp บวกสำหรับตัวอย่างอื่น ๆ ( O / ทรุด / 1 / 99 ) นอกจากนี้ , TP ค่าซ้ำเหล่านี้สูง ( 39:12 49:36,51:00 56:18 53:06 , , และ , สำหรับ 56:18 O / ทรุด / 3 / 2005 และ O / ทรุด / 1 / 99 ,