after banana and citrus in the world production [1, 2], without exception in Malaysia [2]. There are many
pineapple cultivars available in Malaysia including Maspine, Morris Bentanggur, MD2, Morris Gajah, Gandul,
Sarawak Green Local, Josapine, N36, Yankee and even Malaysia Pineapple Industry Board released MD2
variety product of tissue culture technique in to the market. Each of the cultivar has their own uniqueness and
economic importance. However the identification to distinguish one from the other cultivars remains the main
constraint to date [2].Currently there are no established identification tools at molecular level for Malaysian
pineapple. Existed traditional approach that has been used by the growers to identify the cultivars is solely
based upon morphological characters, which is extremely inconsistent and time consuming.
DNA barcoding is a technique that use standard gene region of DNA or known as DNA Barcode for
identification of organism [3]. It plays vital role in managing species diversity and identification of biological
specimen (Lahaye et al., 2008). The gene region that usually been used for DNA barcoding standard is the
Cyctochrome C Oxidase 1 gene (CO1). This gene is derived from mitochondrial DNA which effectively
works in identifying species of animal [4]. Based on conventional method to study about species,
identification is only based on morphology which could result in incorrect species recognition. However, by
DNA barcoding it allows us to combine morphology and gene sequence together for better and precise
identification [5].
The use of the CO1 in plant has been not effective due to its low nucleotide substitution in plant
mitochondrial genome [4]. Thus, it is proposed the use of the ITS region as the barcode for plant [6]. The
region also proved to be highly effective in distinguishing closely related species in numerous genera [7, 8, 9].
In this research, DNA barcode obtained from the ITS region was used as an alternative approach for
identification the grapevine cultivars. The ITS region is the most commonly sequenced locus used as a
barcode at the species level [10, 11]. However, in this research, the region was used at cultivar level.
หลังจากกล้วยและส้มในโลกผลิต [1, 2], โดยไม่มีข้อยกเว้นในมาเลเซีย [2] มีเป็นจำนวนมากพันธุ์สับปะรดที่มีอยู่ในมาเลเซียรวมถึง Maspine, Bentanggur มอร์ริส MD2 มอร์ริสดีคลับ Gandulซาราวัคกรีนท้องถิ่น Josapine, N36 แยง และ คณะอุตสาหกรรมสับปะรดมาเลเซียแม้ออก MD2ผลิตภัณฑ์หลากหลายเทคนิคเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อในตลาด Cultivar มีเอกลักษณ์ของตนเอง และความสำคัญทางเศรษฐกิจ อย่างไรก็ตาม รหัสที่แตกต่างจากพันธุ์อื่น ๆ ยังคงเป็น หลักข้อจำกัดวัน [2] ปัจจุบันไม่มีรหัสที่สร้างเครื่องมือระดับโมเลกุลในมาเลเซียสับปะรด วิธีการแบบดั้งเดิมอยู่ที่ใช้ โดยเกษตรกรที่ระบุพันธุ์เป็นแต่เพียงผู้เดียวยึดตามอักขระของ ซึ่งจะใช้เวลานาน และไม่สอดคล้องกันมากโค้ดีเอ็นเอเป็นเทคนิคที่ใช้ยีนมาตรฐานภูมิภาคของดีเอ็นเอหรือที่รู้จักกันเป็นดีเอ็นเอบาร์โค้ดสำหรับรหัสของสิ่งมีชีวิต [3] มันเล่นบทบาทสำคัญในการจัดการความหลากหลายชนิดและรหัสของชีวภาพสิ่งส่งตรวจ (Lahaye et al., 2008) ภูมิภาคยีนที่มักถูกใช้เป็นซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอมาตรฐานการCyctochrome C Oxidase 1 ยีน (CO1) ยีนนี้มา mitochondrial DNA ที่มีประสิทธิภาพทำงานในการระบุชนิดของสัตว์ [4] ตามวิธีการปกติเพื่อศึกษาเกี่ยวกับสายพันธุ์รหัสเฉพาะอยู่ในสัณฐานวิทยาซึ่งอาจส่งผลในการรับรู้ชนิดที่ไม่ถูกต้อง อย่างไรก็ตาม โดยโค้ดีเอ็นเอให้เรารวมกันลำดับสัณฐานวิทยาและยีนในดีขึ้น และแม่นยำรหัส [5]ใช้ CO1 ในโรงงานแล้วไม่มีประสิทธิภาพเนื่องจากแทนนิวคลีโอไทด์ที่ต่ำของโรงงานmitochondrial จีโนม [4] ดังนั้น มันจะเสนอการใช้ของภาคเป็นบาร์โค้ดสำหรับพืช [6] ที่ภูมิภาคยังพิสูจน์ให้มีประสิทธิภาพสูงในการแยกความแตกต่างสปีชีส์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดในหลายสกุล [7, 8, 9]ในงานวิจัยนี้ ใช้บาร์โค้ดดีเอ็นเอที่ได้รับจากภูมิภาคของเป็นวิธีการสำรองสำหรับรหัสพันธุ์ grapevine ของภูมิภาคคือ โลกัสโพลตามลำดับมากที่สุดที่ใช้เป็นแบบบาร์โค้ดในระดับสปีชีส์ [10, 11] อย่างไรก็ตาม ในงานวิจัยนี้ ภูมิภาคใช้ระดับ cultivar
การแปล กรุณารอสักครู่..
หลังจากกล้วยและส้มในการผลิตของโลก [1, 2] โดยไม่มีข้อยกเว้นในประเทศมาเลเซีย [2] มีหลาย
สายพันธุ์สับปะรดที่มีอยู่ในประเทศมาเลเซียรวมทั้ง Maspine มอร์ริส Bentanggur, MD2 มอร์ริส Gajah, Gandul,
รัฐซาราวักสีเขียวท้องถิ่น Josapine, N36, แยงกี้และแม้กระทั่งมาเลเซียสับปะรดคณะอุตสาหกรรมการปล่อยตัว MD2
สินค้าที่หลากหลายของเทคนิคการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อในตลาด แต่ละพันธุ์มีเอกลักษณ์ของตัวเองและ
ความสำคัญทางเศรษฐกิจ อย่างไรก็ตามการระบุที่จะแยกแยะความแตกต่างจากพันธุ์อื่น ๆ ยังคงเป็นหลัก
ข้อ จำกัด ถึงวันที่ [2] .Currently มีการจัดตั้งไม่มีเครื่องมือประจำตัวประชาชนในระดับโมเลกุลมาเลเซีย
สับปะรด วิธีการแบบดั้งเดิมที่มีอยู่ถูกใช้โดยเกษตรกรผู้ปลูกเพื่อระบุสายพันธุ์ที่มี แต่เพียงผู้เดียว
ขึ้นอยู่กับลักษณะทางสัณฐานวิทยาซึ่งเป็นอย่างมากที่ไม่สอดคล้องกันและใช้เวลานาน.
barcoding ดีเอ็นเอเป็นเทคนิคที่ใช้ในภูมิภาคยีนมาตรฐานของดีเอ็นเอหรือที่รู้จักกันเป็นดีเอ็นเอบาร์โค้ดสำหรับ
บัตรประจำตัวของสิ่งมีชีวิต [3] มันเล่นบทบาทสำคัญในการจัดการความหลากหลายชนิดและบัตรประจำตัวของทางชีวภาพ
ตัวอย่าง (Lahaye et al., 2008) ภูมิภาคยีนที่มักจะถูกนำมาใช้มาตรฐานดีเอ็นเอบาร์โค้ดเป็น
Cyctochrome C oxidase 1 ยีน (CO1) ยีนนี้ได้มาจากยลดีเอ็นเอที่มีประสิทธิภาพ
การทำงานในการระบุสายพันธุ์ของสัตว์ [4] ขึ้นอยู่กับวิธีการทั่วไปที่จะศึกษาเกี่ยวกับชนิด
ประจำตัวประชาชนเป็นเพียงขึ้นอยู่กับลักษณะทางสัณฐานวิทยาซึ่งอาจส่งผลในการรับรู้ชนิดที่ไม่ถูกต้อง แต่ด้วย
บาร์โค้ดดีเอ็นเอจะช่วยให้เราสามารถรวมสัณฐานวิทยาและลำดับยีนร่วมกันสำหรับการที่ดีกว่าและแม่นยำ
การระบุ [5].
ใช้ CO1 ในโรงงานที่ได้รับไม่ได้มีประสิทธิภาพเนื่องจากการทดแทนเบื่อหน่ายที่ต่ำในโรงงาน
จีโนมยล [4] ดังนั้นจึงมีการเสนอการใช้งานของภูมิภาคที่เป็นบาร์โค้ดสำหรับพืช [6]
ภูมิภาคพิสูจน์ยังมีประสิทธิภาพสูงในลักษณะสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดในหลายจำพวก [7, 8, 9].
ในงานวิจัยนี้ได้รับดีเอ็นเอบาร์โค้ดจากภูมิภาคของใช้เป็นวิธีทางเลือกสำหรับ
การระบุสายพันธุ์องุ่น ภูมิภาค ITS คือสถานที่ติดใจใช้กันมากที่สุดเป็น
บาร์โค้ดในระดับสปีชีส์ [10, 11] แต่ในงานวิจัยนี้ภูมิภาคที่ใช้ในระดับพันธุ์
การแปล กรุณารอสักครู่..
หลังจากกล้วยและส้มในการผลิตโลก [ 1 , 2 ] โดยไม่มีข้อยกเว้นในมาเลเซีย [ 2 ] มีหลายพันธุ์ของมาเลเซีย ได้แก่ สับปะรด
maspine bentanggur md2 มอร์ริสมอร์ริส , ช้าง , gandul
ซาราวัก , สีเขียวท้องถิ่น josapine n36 แยงกี้ , , และแม้กระทั่งมาเลเซียอุตสาหกรรมสับปะรดบอร์ดออก md2
ผลิตภัณฑ์ที่หลากหลายของเทคนิคเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อในตลาดแต่ละพันธุ์มีเอกลักษณ์ของตัวเองและ
ความสำคัญทางเศรษฐกิจ อย่างไรก็ตาม ประชาชนที่จะแยกแยะความแตกต่างจากพันธุ์อื่น ๆ ยังคงเป็นปัญหาหลัก
วันที่ [ 2 ] ขณะนี้ยังไม่มีการระบุเครื่องมือสร้างในระดับโมเลกุลสำหรับสับปะรดมาเลเซีย
มีอยู่ดั้งเดิม วิธีการที่ถูกใช้โดยเกษตรกรผู้ปลูกศึกษาพันธุ์ เป็น แต่เพียงผู้เดียว
ขึ้นอยู่กับลักษณะทางสัณฐานวิทยา ซึ่งเป็นสิ่งที่ไม่สอดคล้องกัน และเวลานาน
barcoding ดีเอ็นเอเป็นเทคนิคที่ใช้มาตรฐานของเขตของดีเอ็นเอหรือที่เรียกว่าดีเอ็นเอบาร์โค้ดสำหรับ
การจำแนกสิ่งมีชีวิต [ 3 ] มันมีบทบาทสำคัญในการจัดการความหลากหลายของชนิดและการจำแนกตัวอย่างทางชีวภาพ
( ลาฮาเยอ et al . , 2008 )ยีนที่มักจะถูกใช้สำหรับภูมิภาคดีเอ็นเอ barcoding มาตรฐาน
cyctochrome ซีออกซิเดส 1 ยีน ( ซีโอ 1 ) ยีนนี้ได้มาจากดีเอ็นเอ ซึ่งมีประสิทธิภาพในการระบุสายพันธุ์ของสัตว์
ผลงาน [ 1 ] ตามวิธีปกติเพื่อศึกษาเกี่ยวกับชนิด
ตัวเป็นหลักเท่านั้นซึ่งอาจส่งผลในลักษณะที่ไม่ถูกต้องชนิดของการรู้จำ อย่างไรก็ตาม โดย
ดีเอ็นเอ barcoding มันช่วยให้เราสามารถรวมโครงสร้างและลำดับยีนด้วยกันได้ดีและแม่นยำ
ตัว [ 5 ] .
ใช้ของซีโอ 1 ในพืชได้ไม่มีประสิทธิภาพเนื่องจากการแทนที่ของนิวคลีโอไทด์ในระดับโรงงาน
ยลจีโนม [ 4 ] ดังนั้นจึงเสนอให้ใช้พื้นที่ของบาร์โค้ดสำหรับพืช [ 6 ]
ภูมิภาคยังพิสูจน์แล้วว่ามีประสิทธิภาพสูงในการแยกชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดในสกุลมากมาย [ 7 , 8 , 9 ] .
ในการวิจัย , บาร์โค้ดดีเอ็นเอที่ได้จากพื้นที่ของตนถูกใช้เป็นทางเลือกสำหรับ
ตัวต้นองุ่นพันธุ์ ภูมิภาคของตนมากที่สุดโดยทั่วไปใช้เป็นลำดับ
บาร์โค้ดที่สายพันธุ์ระดับ [ 10 , 11 ] อย่างไรก็ตาม ในการวิจัยนี้พื้นที่ที่ใช้ในระดับพันธุ์ .
การแปล กรุณารอสักครู่..