Ten-eleven translocation. Methyl ox

Ten-eleven translocation. Methyl oxidation is the first step in the removal of DNA methylation;
however, it is not rate limiting, and hmC is present at detectable levels in vivo. The prediction
that the Tet family of proteins serves to oxidize DNA came from their sequence homology to
parasitic proteins that produce hydroxymethyluracil (base J) (23, 24). There are three mammalian
Tet proteins, each containing a core catalytic region and DNA-binding CXXC domain, with the
exception of Tet2, in which the CXXC domain coding region is detached and inverted into the
separate CXXC4 gene (25). These iron-mediated dioxygenases use α-ketoglutarate (α-KG) to
oxidize mC to hmC by flipping the target mC out and into the active site (Figure 2) (26). The
complimentary cytosine of the CpG site is then detected by three aryl residues [Tyr, Tyr(Phe),
and Trp]. The exact mechanism by which hmC is then converted back into unalkylated cytosine
remains somewhat enigmatic, but there is building evidence that Tets can overoxidize hmC to
5-formylcytosine and even 5-carboxylcytosine, which may then be excised by thymine-DNA gly-
cosylase (15). In any event, hmC can be viewed as a meta-stable intermediate in the erasure of a
methyl mark that itself (hmC) may perform some regulatory effect.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การสับเปลี่ยนสิบเอ็ด ออกซิเดชัน methyl เป็น first ขั้นตอนในการกำจัดปรับอย่างไรก็ตาม ไม่จำกัดอัตรา และ hmC อยู่ในระดับที่สามารถตรวจสอบได้ในสัตว์ทดลอง คำทำนายว่า ที่ครอบครัว Tet โปรตีนทำหน้าที่ออกซิไดซ์ที่ดีเอ็นเอมาจาก homology ลำดับของการเสียงฟู่เหมือนกาฝากโปรตีนที่ผลิต hydroxymethyluracil (ฐานเจ) (23, 24) มีสาม mammalianTet โปรตีน แต่ละประกอบด้วยหลักภูมิภาคตัวเร่งปฏิกิริยาและโดเมน CXXC รวมดีเอ็นเอ การข้อยกเว้นของ Tet2 ซึ่งโดเมน CXXC รหัสภูมิภาคเดี่ยว และกลับเข้าแยกยีน CXXC4 (25) เหล่านี้ dioxygenases mediated เหล็กใช้ด้วยกองทัพ-ketoglutarate (กิโลกรัมด้วยกองทัพ)ออก mC ไป hmC โดย flipping เป้าหมาย mC ออก และ เข้าใช้งานเว็บไซต์ (รูปที่ 2) (26) ที่แล้วมีการตรวจพบ cytosine ฟรีไซต์ประเภทวัสดุสิ้นเปลือง โดยตก aryl สาม [Tyr, Tyr(Phe)ก Trp] กลไกที่แน่นอนที่ hmC แล้วแปลงไว้ unalkylated cytosineยังคงค่อนข้างลึกลับ แต่จะสร้างหลักฐานที่ Tets สามารถ overoxidize hmC เพื่อ5 formylcytosine และแม้แต่ 5-carboxylcytosine ซึ่งอาจจะ excised แล้ว โดย gly ไทมีน-DNA-cosylase (15) ชะดีชะร้าย hmC สามารถใช้เป็นชั้นกลาง meta-มีเสถียรภาพในปลอดภัยของการหมาย methyl นั้นเอง (hmC) อาจทำบางผลกำกับดูแล

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โยกย้ายสิบสิบเอ็ด การเกิดออกซิเดชัน Methyl เป็นไฟขั้นตอนแรกในการกำจัดของดีเอ็นเอ methylation นั้น
แต่ก็ไม่ได้รับการประเมิน จำกัด และ HMC เป็นปัจจุบันอยู่ในระดับที่ตรวจพบในร่างกาย ทำนายว่าครอบครัวเทตของโปรตีนที่ทำหน้าที่ในการออกซิไดซ์ดีเอ็นเอมาจากลำดับที่คล้ายคลึงกันของพวกเขาเพื่อโปรตีนปรสิตที่ผลิตhydroxymethyluracil (ฐาน J) (23 24) มีสามเลี้ยงลูกด้วยนมที่มีโปรตีน Tet แต่ละภูมิภาคเร่งปฏิกิริยาหลักและโดเมนดีเอ็นเอผูกพัน CXXC มีข้อยกเว้นของTet2 ซึ่งในภูมิภาคเข้ารหัสโดเมน CXXC ถูกถอดออกและกลับเข้าไปในยีนCXXC4 แยกต่างหาก (25) เหล่านี้ dioxygenases เหล็กพึ่งใช้α-ketoglutarate (α-KG) เพื่อออกซิไดซ์mC เพื่อ HMC โดยชั้น ipping เป้าหมายพิธีกรออกมาและในเว็บไซต์ที่ใช้งาน (รูปที่ 2) (26) cytosine ฟรีเว็บไซต์ CpG มีการตรวจพบแล้วโดยสามตกค้าง aryl [เทอร์, เทอร์ (เพ) และ Trp] กลไกที่แน่นอนโดยที่ HMC จะถูกแปลงแล้วกลับเข้ามาใน cytosine unalkylated ยังคงลึกลับบ้าง แต่มีหลักฐานว่าสร้าง Tets สามารถ overoxidize HMC จะ5 formylcytosine และแม้กระทั่ง 5 carboxylcytosine ซึ่งอาจจะถูกตัดโดยมีน gly- ดีเอ็นเอcosylase ( 15) ในกรณีใด ๆ HMC สามารถดูเป็นเมตาดาต้าที่มีความเสถียรในการลบกลางของที่เครื่องหมายเมธิลที่ตัวเอง(HMC) อาจดำเนินการบางอย่างมีผลงานกำกับดูแล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สิบสิบเอ็ดโยกย้าย . เมธิลออกซิเดชัน จึงเป็นขั้นตอนแรกในการกำจัด methylation ดีเอ็นเอ ;
แต่มันไม่เท่ากัน จำกัด และ HMC เป็นปัจจุบันที่ระดับที่ตรวจพบในสิ่งมีชีวิต ทำนายว่า ครอบครัวของโปรตีน Tet
บริการออกซิไดส์ดีเอ็นเอมาจากลำดับของตัวพยาธิที่ผลิตโปรตีน
hydroxymethyluracil ( ฐาน J ) ( 23 , 24 ) มี 3 โปรตีน Tet )
,แต่ละที่มีหลักการในภูมิภาค และ cxxc ดีเอ็นเอมัดโดเมนด้วย
3 tet2 ซึ่งใน cxxc โดเมนรหัสภูมิภาคเป็นแฝด และคว่ำลง
cxxc4 แยกยีน ( 25 ) เหล่านี้เพื่อใช้เหล็ก dioxygenases แอลฟา ketoglutarate ( แอลฟากก )
ออกซิไดซ์ MC HMC โดยfl ipping MC เป้าหมายออกมาและเป็นเว็บไซต์ที่ใช้งาน ( รูปที่ 2 ) ( 26 )
ไซโทซีนฟรีของเว็บไซต์คือตรวจพบว่า CPG โดยสามกลืนกันตกค้าง [ tyr , tyr ( เพ ) ,
และ ก ] กลไกที่แน่นอนโดยที่ HMC เป็นแปลงแล้วกลับเข้าไปใน unalkylated ย้ายถิ่น
ยังคงค่อนข้างลึกลับ แต่ไม่มีหลักฐานว่าสร้าง tets สามารถ overoxidize HMC

5-formylcytosine และแม้แต่ 5-carboxylcytosine ซึ่งอาจจะถูกตัดโดยเพลินตาดีเอ็นเอ GLY -
cosylase ( 15 ) ในกรณีใด ๆHMC สามารถดูเป็นเมตาคอกกลางในขั้นสูงของ
เมทิลเครื่องหมายตัวเอง ( HMC ) อาจทำการบางอย่างบังคับ
Effect