การเช่าเครื่องบินในลักษณะเช่าเหมาลำ (Chartered Flight) จากพันธมิตรทางธุรกิจของนกแอร์ ปัจจุบันมีเพียงรายเดียว ณ สิ้นปี 2556 ได้แก่ บริษัท สยาม เจนเนอรัล เอวิเอชั่น จำกัด (“เอสจีเอ”) ซึ่งให้นกแอร์เช่าเหมาลำเครื่องบินแบบ SAAB340 ขนาด 34 ที่นั่ง บริษัทได้ตกลงชำระค่าเช่าเครื่องบินตามจำนวนเที่ยวบินที่ทำการบินจริง การเช่าเครื่องบินในลักษณะดังกล่าวจะทำให้บริษัทสามารถให้บริการเที่ยวบินกับผู้โดยสารในเส้นทางการบินสายรอง และเส้นทางสายย่อยได้ครอบคลุมยิ่งขึ้น เนื่องจากเครื่องบิน SAAB ซึ่งมีขนาดเล็กกว่าเครื่องบินรุ่นอื่นๆ ของบริษัท เหมาะสมกับเส้นทางบินเปิดใหม่ที่อุปสงค์การเดินทางทางอากาศยังไม่สูงมากนัก ทั้งนี้ สามารถสรุปสาระสำคัญของสัญญาเช่าเหมาลำได้ ดังต่อไปนี้