repeated sequence. In each case, th

repeated sequence. In each case, this was traced to the presence
of an insertion sequence (IS). The assemblies were
confirmed by PCR (as described in Ref. [9]) using primers
specifically designed to amplify the region that includes the IS,
and the products were sequenced for a representative of each
group. Three different IS insertions were identified, and the
location of these IS elements are shown in Fig. 1. The isolates
that carry these interrupted forms of OCL1 are listed in
Table 1 together with GenBank accession numbers for one
representative.
Two GC1 isolates, D78 and D81, recovered at Royal North
Shore Hospital, Sydney, Australia in the same year included a
novel IS that interrupted gtrOC6 (Fig. 1). This mutant form
was designated OCL1b. The IS sequence was deposited in
ISFinder (https://www-is.biotoul.fr//is.html) and assigned the
name ISAba23. ISAba23 belongs to the IS5 family, is 1249 bp
in length and is bounded by 16 bp inverted repeats. The
insertion of ISAba23 has created a duplication of the 5 bp
target sequence.
A GC2 isolate, D1, also recovered at Royal North Shore
Hospital in 2006, included OCL1c with ISAba1 in the gtrOC2
glycosyltransferase gene. ISAba1 has previously been shown
to increase expression of genes adjacent to its left end (when
insA/insB genes are shown transcribed to the right). This is due
to the presence of a strong outward-facing promoter (see Fig
S1 in Ref. [12] for references and promoter location). The
ISAba1 is oriented such that it directs transcription in the same
direction as the majority of genes in the OC locus (Fig. 1).
Consequently, it may alleviate polar effects on the transcription
of the genes downstream of the IS in gtrOC2.
Ten GC2 isolates from Prince of Wales Hospital, Sydney,
Australia that were all isolated in 2002 (A74eA82, A84),
carried OCL1 with ISAba1 interrupting the ghy gene. This
gene cluster was designated OCL1d (Fig. 1). ISAba1 is oriented
such that the promoter it provides directly opposes the
transcription of the preceding 5 genes in OCL1. It is therefore
possible that the expression of these genes is prevented or
substantially reduced.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับซ้ำ ในแต่ละกรณี นี้ถูกติดตามไปอยู่ของแทรกลำดับ (IS) แอสเซมบลีได้ยืนยัน โดย PCR (ตามที่อธิบายไว้ในอ้างอิง [9]) โดยใช้ไพรเมอร์ออกแบบมาเพื่อขยายพื้นที่ที่มี ISและผลิตภัณฑ์มีการเรียงลำดับสำหรับตัวแทนของแต่ละกลุ่ม ระบุสามแทรก IS ต่างกัน และแสดงตำแหน่งขององค์ประกอบเหล่านี้ IS ใน Fig. 1 การแยกยกที่ระบุไว้ในแบบฟอร์มเหล่านี้ถูกขัดจังหวะของ OCL1ตารางที่ 1 พร้อมเลขทะเบียน GenBank หนึ่งตัวแทนสอง GC1 ล D78 และ D81 กู้คืนที่ราชเหนือฝั่งโรงพยาบาล ซิดนีย์ ออสเตรเลียในปีเดียวกันรวมเป็นนวนิยายเป็น gtrOC6 ที่ถูกขัดจังหวะ (Fig. 1) แบบฟอร์มนี้กลายพันธุ์ได้กำหนด OCL1b ลำดับ IS ได้ฝากในISFinder (https://www-is.biotoul.fr//is.html) และกำหนดให้การชื่อ ISAba23 ISAba23 เป็นสมาชิกครอบครัว IS5 เป็น 1249 bpความยาว และล้อมรอบ ด้วย 16 bp กลับทำซ้ำ ที่แทรกของ ISAba23 มีสร้างสำเนาของ 5 bpเป้าหมายลำดับนั้นแยกเป็น GC2 ง 1 กู้นอกจากนี้ ที่รอยัลนอร์ธชอร์โรงพยาบาลในปี 2006 รวม OCL1c กับ ISAba1 gtrOC2glycosyltransferase ยีน ISAba1 ได้รับการแสดงก่อนหน้านี้การเพิ่มขึ้นของยีนที่อยู่ติดกับจุดสิ้นสุดซ้าย (เมื่อinsA/insB ยีนมีแสดงทับด้านขวา) ซึ่งจะครบกำหนดการของโปรโมเตอร์ที่หันหน้าไปทางออกด้านนอกแข็งแรง (ดูฟิกS1 ในอ้างอิง [12] การอ้างอิงตำแหน่งโปรโมเตอร์) ที่ISAba1 คือแนวส่ง transcription เดียวทิศทางเป็นส่วนใหญ่ของยีนในโลกัสโพลองศาเซลเซียส (Fig. 1)ดังนั้น มันอาจบรรเทาผลกระทบในขั้วโลกของยีนน้ำของ IS ใน gtrOC2สิบ GC2 แยกจากโรงพยาบาลปรินซ์ออฟเวลส์ ซิดนีย์ออสเตรเลียที่ 2002 แยกในทั้งหมด (A74eA82, A84),ทำ OCL1 กับ ISAba1 รบกวนยีน ghy นี้ยีนคลัสเตอร์ถูกกำหนด OCL1d (Fig. 1) ISAba1 เป็นแนวopposes ที่เสนอเงื่อนไขที่ให้โดยตรงtranscription ของยีน 5 ก่อนหน้านี้ใน OCL1 ดังนั้นนิพจน์ของยีนเหล่านี้จะทำได้ หรือลดลงมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับซ้ำแล้วซ้ำอีก ในแต่ละกรณีนี้ถูกโยงไปถึงการปรากฏตัว
ของลำดับการแทรก (IS) ประกอบได้รับ
การยืนยันโดยวิธี PCR (ตามที่อธิบายไว้ใน Ref. [9]) โดยใช้ไพรเมอร์
ที่ออกแบบมาเพื่อขยายพื้นที่ซึ่งมีความเป็น
และผลิตภัณฑ์มีลำดับขั้นตอนสำหรับตัวแทนของแต่ละ
กลุ่ม สามที่แตกต่างกันคือการแทรกถูกระบุและ
สถานที่ตั้งของเหล่านี้เป็นองค์ประกอบที่แสดงในรูป 1. ไอโซเลท
ที่ดำเนินการเหล่านี้ในรูปแบบของการขัดจังหวะ OCL1 มีการระบุไว้ใน
ตารางที่ 1 ร่วมกับหมายเลขภาคยานุวัติ GenBank หนึ่ง
ตัวแทน.
สองแยก GC1, D78 และ D81, การกู้คืนที่โรงแรมรอยัลนอร์ท
ชอร์โรงพยาบาลนครซิดนีย์ประเทศออสเตรเลียในปีเดียวกันรวม
นวนิยาย คือการที่ขัดจังหวะ gtrOC6 (รูปที่ 1). แบบฟอร์มการกลายพันธุ์นี้
ถูกกำหนด OCL1b ลำดับที่ถูกฝากไว้ใน
ISFinder (https://www-is.biotoul.fr//is.html) และได้รับมอบหมาย
ชื่อ ISAba23 ISAba23 เป็นของครอบครัว IS5 เป็น 1,249 bp
ในความยาวและมีขอบเขตโดย 16 bp ซ้ำคว่ำ
แทรก ISAba23 ได้สร้างความซ้ำซ้อนของ 5 bp
เป้าหมายลำดับ.
GC2 แยก, D1, กู้คืนยังที่ Royal North Shore
โรงพยาบาลในปี 2006 รวม OCL1c กับ ISAba1 ใน gtrOC2
ยีนไกลโคซิ ISAba1 ได้รับก่อนหน้านี้แสดงให้เห็น
ว่าจะเพิ่มขึ้นการแสดงออกของยีนที่อยู่ติดกับปลายด้านซ้ายของมัน (เมื่อ
ยีน Insa / InSb จะแสดงคัดลอกไปทางขวา) เพราะนี่คือ
การปรากฏตัวของโปรโมเตอร์หันหน้าออกไปด้านนอกที่แข็งแกร่ง (ดูรูปที่
S1 ใน Ref. [12] สำหรับการอ้างอิงและสถานที่ตั้งของผู้ก่อการ)
ISAba1 เน้นดังกล่าวว่าจะนำถอดความในเดียวกัน
ทิศทางที่เป็นส่วนใหญ่ของยีนในสถานที OC (รูปที่ 1)..
ดังนั้นมันอาจจะช่วยบรรเทาผลกระทบขั้วในการถอดรหัส
ของยีนที่ล่องอยู่ใน gtrOC2.
สิบ GC2 แยกได้จากเจ้าชายแห่งเวลส์โรงพยาบาล, ซิดนีย์,
ออสเตรเลียที่ถูกแยกออกมาในปี 2002 (A74eA82, A84)
ดำเนิน OCL1 กับ ISAba1 ขัดจังหวะยีน GHY นี้
กลุ่มยีนที่ถูกกำหนด OCL1d (รูปที่ 1). ISAba1 เน้น
ดังกล่าวว่าผู้ก่อการจะให้โดยตรง opposes
ถอดความจากก่อนหน้านี้ 5 ยีนใน OCL1 ดังนั้นจึงเป็น
ไปได้ว่าการแสดงออกของยีนเหล่านี้สามารถป้องกันหรือ
ลดลงอย่างมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทำซ้ำลำดับ ในแต่ละคดี และจากการตรวจสอบ พบการแสดง
ของการแทรกลำดับ ( เป็น ) คริสตจักรถูก
ยืนยันโดยวิธี PCR ( ตามที่อธิบายไว้ในอ้างอิง [ 9 ] ) โดยใช้ไพรเมอร์ที่ออกแบบมาโดยเฉพาะเพื่อขยายเสียง

เป็นเขตที่มี , และผลิตภัณฑ์ถูกลำดับสำหรับตัวแทนแต่ละ
กลุ่ม ทั้งสามต่างถูกแทรกถูกระบุและ
ที่ตั้งของ เหล่านี้เป็นองค์ประกอบที่แสดงในรูปที่ 1 แยกได้
ที่มีเหล่านี้อยู่ในรูปแบบของการขัดจังหวะ ocl1
ตารางที่ 1 ร่วมกับการพบตัวเลขหนึ่ง

สองตัวแทน gc1 สายพันธุ์และ d78 D81 กู้ที่รอยัลนอร์ท
ฝั่งโรงพยาบาล ซิดนีย์ ออสเตรเลีย ในปีเดียวกันรวม
นวนิยายที่ขัดจังหวะ gtroc6 ( รูปที่ 1 ) นี้กลายพันธุ์ฟอร์ม
เป็นเขต ocl1b .เป็นลำดับเป็นฝากใน
isfinder ( https://www-is.biotoul.fr//is.html ) และมอบหมายให้
ชื่อ isaba23 . isaba23 เป็นของครอบครัว is5 , ด้วย BP
ในความยาวและถูกล้อมรอบโดย 16 BP กลับหัว วนกลับมาที่เดิม
แทรก isaba23 ได้สร้างสำเนาของ 5 BP

เป็นเป้าหมายลำดับ gc2 แยก , D1 ยังกู้คืนในโรงพยาบาลฝั่ง
เหนือหลวงในปี 2006รวม ocl1c กับ isaba1 ใน gtroc2
เดกซ์ยีน isaba1 ก่อนหน้านี้ได้ถูกแสดง
เพิ่มการแสดงออกของยีนที่อยู่ซ้ายสุดของ ( ระบบวัดที่สร้างขึ้นเมื่อ
นซา / ยีนแสดงและไปทางขวา ) นี้คือเนื่องจาก
การแสดงตนของแรงภายนอกซึ่งโปรโมเตอร์ ( เห็นรูป
S1 ในอังกฤษ [ 12 ] สำหรับการอ้างอิงและโปรโมเตอร์ที่ตั้ง )
isaba1 เป็นเชิงเช่นที่ซึ่งถอดความในทิศทางเดียวกัน
เป็นส่วนใหญ่ของยีนใน OC โลคัส ( รูปที่ 1 ) .
ดังนั้นมันอาจจะบรรเทาผลกระทบขั้วโลกบน mRNA ของยีน
ท้ายอยู่ใน gtroc2 .
10 gc2 ไอโซเลตจากเจ้าชายแห่งโรงพยาบาล เวลส์ ซิดนีย์ ,
ออสเตรเลีย ทั้งหมดที่แยกได้ใน 2002 ( a74ea82 a84
, )อุ้ม ocl1 กับ isaba1 รบกวน GHY ยีน ยีนกลุ่มนี้
เป็นเขต ocl1d ( รูปที่ 1 ) isaba1 มุ่งเน้น
ที่ส่งเสริมให้โดยตรงต่อต้าน
ถอดความการนำหน้า 5 ยีนใน ocl1 . จึงเป็นไปได้ว่า
การแสดงออกของยีนเหล่านี้ถูกขัดขวางหรือ
ลดลงอย่างมาก