In C. reinhardtii, DNA cytosine met

In C. reinhardtii, DNA cytosine methylation was initially
observed in chloroplast DNA during gametogenesis and implicated
in the uniparental inheritance of mating type plus chloroplast DNA
(Umen and Goodenough, 2001; Nishiyama et al., 2004). Recent
findings indicated that the nuclear genome of this alga is also
methylated at low levels and, similarly to Volvox, CG methylation
is preferentially enriched in transposon sequences and to a much
lower degree in gene bodies (Feng et al., 2010). Intriguingly, CHG
and CHH methylation was also observed uniformly along chromosomes
and showed little enrichment in transposons or repeats
(Feng et al., 2010). However, Chlamydomonas does not appear to
contain CMT or Dnmt3/DRM homologs (Table 1 and Feng et al.,
2010) and the methyltransferase(s) responsible for the later
modifications has not been characterized. DNA methylation has
also been implicated in the transcriptional silencing of introduced
transgenes, particularly tandem repeats, in Chlamydomonas
(Cerutti et al., 1997).
Collectively, the evidence suggests that, as in land plants and
vertebrates, preferential DNA cytosine methylation of transposable
elements and gene bodies has been conserved in some microalgae
(Feng et al., 2010; Zemach et al., 2010). The methylation of transposons
likely suppresses transcription and ensuing self-replication
preserving genome integrity. Additionally, DNA methylation in
promoters correlates negatively with gene expression in a subset
of microalgae (Zemach et al., 2010) but it is not known whether
certain protein genes are regulated by this modification. The pattern
of genomic DNA methylation and the complement of DNA
methyltransferases in species of the genus Chlorella, except for
the lack of a Dnmt3/DRM homolog (Table 1), are similar to those
in land plants. In contrast, C. reinhardtii and V. carteri methylate
preferentially transposable elements, but predominantly in the
CG (rather than the CHG/CHH) context and presumably by a somewhat
different mechanism from that in land plants given the
divergence in DNA methyltransferases (Table 1). Additionally,
O. lucimarinus, M. pusilla, and B. prasinos, which possess DNA methyltransferases
of the diverged Dnmt5 subfamily, exhibit densely
clustered CG methylation in nucleosome linkers, possibly contributing
to nucleosome positioning and proper chromatin compaction
in very small nuclei (Huff and Zilberman, 2014). Thus, the distribution
and function(s) of DNA cytosine methylation in microalgae
appear to be highly varied, making it difficult to extrapolate knowledge
from well-characterized model systems as to its possible
role(s) in the regulation of gene expression

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใน C. reinhardtii, cytosine ปรับเป็นครั้งแรกพบในคลอโรพลาสต์ DNA ระหว่าง gametogenesis และอู๊ดในการสืบทอดของยูนิของผสมพันธุ์ชนิดบวกคลอโรพลาสต์ดีเอ็นเอ(Umen และ Goodenough, 2001 Nishiyama et al., 2004) ล่าสุดผลการวิจัยระบุว่า กลุ่มนิวเคลียร์ของนี้ alga เป็นยังmethylated ในระดับต่ำ และ ในทำนองเดียวกัน กับ Volvox ปรับ CGเป็นโน้ตอุดมไป ในลำดับ transposon และมากมายระดับต่ำกว่าในร่างกายยีน (Feng et al., 2010) Intriguingly, CHGและปรับ CHH ถูกยังตรวจสอบสม่ำเสมอเมื่อเทียบเคียงตาม chromosomesและขอแสดงน้อย transposons หรือทำซ้ำ(Feng et al., 2010) อย่างไรก็ตาม Chlamydomonas ไม่ประกอบด้วย homologs CMT หรือ Dnmt3/DRM (ตารางที่ 1 และเฟิง et al.,2010) และ methyltransferase(s) ชอบในภายหลังแก้ไขได้ไม่ถูกลักษณะ ปรับได้รับเกี่ยวข้องใน silencing transcriptional ของแนะนำtransgenes โดยเฉพาะอย่างยิ่งตัวตามกันไปทำซ้ำ ใน Chlamydomonas(Cerutti et al., 1997)โดยรวม หลักฐานแสดงให้เห็นว่า ในที่ดินพืช และvertebrates ต้อง cytosine ปรับของ transposableยีนและองค์ประกอบร่างกายมีการอาศัยใน microalgae บาง(Feng et al., 2010 Zemach et al., 2010) ปรับของ transposonsมีแนวโน้มไม่ใส่ transcription และจำลองเพราะตนเองรักษาความสมบูรณ์ของจีโนม นอกจากนี้ ปรับก่อส่งคู่กับยีนในชุดย่อยของ microalgae (Zemach et al., 2010) แต่ไม่ทราบว่าบางยีนโปรตีนถูกควบคุม โดยการปรับเปลี่ยนนี้ รูปแบบการของ genomic DNA ปรับและส่วนประกอบของดีเอ็นเอmethyltransferases ในสปีชีส์ของสกุล Chlorella ยกเว้นขาด homolog Dnmt3/DRM (ตาราง 1), จะคล้ายกับในที่ดินพืช ในทางตรง ข้าม C. reinhardtii และ V. carteri methylateองค์ประกอบของโน้ต transposable แต่ส่วนใหญ่ในการCG (แทน CHG/CHH) บริบทและสันนิษฐาน ตามค่อนข้างกลไกต่าง ๆ จากแผ่นดินนั้นในพืชกำหนดdivergence ในดีเอ็นเอ methyltransferases (ตารางที่ 1) นอกจากนี้โอ lucimarinus, M. pusilla และ prasinos เกิด ซึ่งมีดีเอ็นเอ methyltransferasesของ diverged Dnmt5 subfamily แสดงหนาแน่นไปคลัสเตอร์ปรับ CG nucleosome linkers อาจสนับสนุนตำแหน่ง nucleosome และโครมาตินเหมาะสมกระชับข้อมูลในแอลฟาเล็ก ๆ (Huff และ Zilberman, 2014) ดังนั้น การกระจายและฟังก์ชันของ microalgae cytosine ปรับจะเป็นสูงที่แตกต่างกัน ทำให้ยากต่อการ extrapolate รู้จากระบบรุ่น characterized ดีเป็นสุดบทบาทในการควบคุมของยีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในซี reinhardtii, methylation cytosine ดีเอ็นเอในขั้นต้น
พบในดีเอ็นเอ chloroplast ในระหว่างการสร้างเซลล์สืบพันธุ์และมีส่วนเกี่ยวข้อง
ในการรับมรดก uniparental ประเภทผสมพันธุ์บวกดีเอ็นเอ chloroplast
(Umen และ Goodenough 2001;. Nishiyama et al, 2004) ล่าสุด
ผลการวิจัยชี้ให้เห็นว่าจีโนมนิวเคลียร์ของสาหร่ายนี้ยังเป็น
methylated ในระดับต่ำและคล้าย ๆ กับ Volvox, methylation CG
อุดมตัวในลำดับ transposon และมาก
ระดับต่ำในร่างกายของยีน (ฮ et al., 2010) น่าประหลาดใจ CHG
และ methylation CHH ก็ยังตั้งข้อสังเกตอย่างสม่ำเสมอพร้อมโครโมโซม
และแสดงให้เห็นการตกแต่งเล็ก ๆ น้อย ๆ ใน transposons หรือซ้ำ
(ฮ et al., 2010) อย่างไรก็ตาม Chlamydomonas ไม่ปรากฏ
มี CMT หรือ Dnmt3 / DRM homologs (ตารางที่ 1 และฮ et al.,
2010) และใบพัด (s) รับผิดชอบในการภายหลัง
การปรับเปลี่ยนไม่ได้รับการที่โดดเด่น ดีเอ็นเอ methylation ได้
รับการที่เกี่ยวข้องในการยับยั้งการถอดรหัสของการแนะนำ
ยีนโดยเฉพาะอย่างยิ่งซ้ำตีคู่ใน Chlamydomonas
(Cerutti et al., 1997).
รวมหลักฐานแสดงให้เห็นว่าในขณะที่พืชบกและ
สัตว์ที่มีกระดูกสันหลังดีเอ็นเอพิเศษ methylation cytosine ของ transposable
องค์ประกอบ และหน่วยงานของยีนที่ได้รับการอนุรักษ์ในสาหร่ายบาง
(ฮ et al, 2010;.. Zemach et al, 2010) methylation ของ transposons
แนวโน้มยับยั้งการถอดรหัสและการจำลองแบบลีสซิ่งตนเอง
การรักษาความสมบูรณ์ของจีโนม นอกจากนี้ methylation ดีเอ็นเอ
โปรโมเตอร์มีความสัมพันธ์เชิงลบกับการแสดงออกของยีนในกลุ่มย่อย
ของสาหร่าย (Zemach et al., 2010) แต่มันก็ไม่เป็นที่รู้จักไม่ว่าจะเป็น
โปรตีนที่ยีนบางอย่างถูกควบคุมโดยการปรับเปลี่ยนนี้ รูปแบบ
ของ methylation ดีเอ็นเอและส่วนประกอบของดีเอ็นเอ
methyltransferases ในสายพันธุ์ของสาหร่าย Chlorella ประเภทยกเว้น
การขาด Dnmt3 / DRM homolog (ตารางที่ 1), มีความคล้ายคลึงกับ
ในพืชบก ในทางตรงกันข้าม reinhardtii C. และ V. carteri methylate
พิเศษองค์ประกอบ transposable แต่ส่วนใหญ่ใน
การกำกับดูแลกิจการ (มากกว่า CHG / CHH) บริบทและสันนิษฐานโดยค่อนข้าง
กลไกที่แตกต่างจากในพืชบกให้
ความแตกต่างใน methyltransferases ดีเอ็นเอ (ตารางที่ 1 ) นอกจากนี้
ทุม lucimarinus, M. pusilla และบี Prasinos ซึ่งมี methyltransferases ดีเอ็นเอ
ของแยกอนุวงศ์ Dnmt5, จัดแสดงหนาแน่น
คลัสเตอร์ methylation CG ใน Linkers nucleosome อาจจะมีส่วนร่วมใน
การวางตำแหน่งและการบดอัด nucleosome โครมาติที่เหมาะสม
ในนิวเคลียสขนาดเล็กมาก (หอบและ Zilberman, 2014) . ดังนั้นการจัดจำหน่าย
และการทำงาน (s) ของ methylation cytosine ดีเอ็นเอในสาหร่าย
ดูเหมือนจะเป็นที่แตกต่างกันเป็นอย่างมากทำให้มันยากที่จะคาดการณ์ความรู้
จากแบบจำลองระบบที่ดีโดดเด่นในฐานะที่จะเป็นไปได้
บทบาท (s) ในการควบคุมการแสดงออกของยีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

C . reinhardtii methylation ดีเอ็นเอที่พบในไซโทซีนดีเอ็นเอในคลอโรพลาสต์

ในมรดกและการเกิดเซลล์สืบพันธุ์ เช่น uniparental ชนิดบวก
ดีเอ็นเอคลอโรพลาสต์ ( umen ผสมพันธุ์ และดีเพียงพอ , 2001 ; นิชิ et al . , 2004 ) ล่าสุด
พบว่าจีโนมนิวเคลียร์ของสาหร่ายนี่
methylated ในระดับต่ำและพบ volvox CG จาก
,คือ ? ? ? ? ? preferentially อุดมในลำดับและเพื่อลดระดับยีนในร่างกายมาก
( ฟง et al . , 2010 ) ฟังดู chg
, และพบว่าฮอร์โมนร่างกายอย่างสม่ำเสมอตามโครโมโซม พบน้อยใน transposons ค่า

หรือทำซ้ำ ( ฟง et al . , 2010 ) อย่างไรก็ตาม คลาไมโดโมแนสไม่ปรากฏ
ประกอบด้วยข้อคิดเห็นหรือ dnmt3 / DRM โฮโมลอกส์ ( ตารางที่ 1 และฟง et al . ,
2010 ) และ methyltransferase ( s ) รับผิดชอบในการปรับเปลี่ยนในภายหลัง
ไม่ได้มีเพียง ดีเอ็นเอ methylation ได้
ยังถูกพาดพิงในการปกปิดแนะนำให้ลอง
transgenes โดยเฉพาะอย่างยิ่งควบคู่ทำซ้ำในคลาไมโดโมแนส
( Cerutti et al . , 1997 ) .
รวม , หลักฐานที่บ่งบอกว่าเป็นพืชที่ดิน
สัตว์มีกระดูกสันหลังดีเอ็นเอเมทิลเลชันขององค์ประกอบพิเศษไซโทซีนและตรวจร่างกายได้รับการอนุรักษ์
ยีนในสาหร่ายขนาดเล็ก
( ฟง et al . , 2010 ; zemach et al . , 2010 ) ในร่างกายของ transposons
อาจยับยั้งการถอดรหัสและต่อมาตนเองซ้ำ
รักษาโดยสมบูรณ์ นอกจากนี้ ดีเอ็นเอเมทิลเลชั่นใน
โปรโมเตอร์ยีนมีความสัมพันธ์ทางลบกับย่อย
สาหร่ายขนาดเล็ก ( zemach et al . , 2010 ) แต่ก็ไม่เป็นที่รู้จักไม่ว่าจะ
ยีนโปรตีนบางอย่างจะถูกควบคุมโดยการปรับนี้ รูปแบบของ methylation ดีเอ็นเอและ

methyltransferases ส่วนเติมเต็มของดีเอ็นเอในสายพันธุ์ของพืชสาหร่าย ยกเว้น
ขาด dnmt3 / DRM homolog ( ตารางที่ 1 ) มีลักษณะที่คล้ายกับ
ในพืชที่ดิน ในทางตรงกันข้าม , C และ reinhardtii carteri methylate
Vpreferentially องค์ประกอบตรวจ แต่เด่นใน
CG ( มากกว่า chg / CHH ) บริบทและสันนิษฐานโดยกลไกที่แตกต่างกันบ้าง

ในพืชที่ดินให้ความแตกต่างในดีเอ็นเอ methyltransferases ( ตารางที่ 1 ) นอกจากนี้
O lucimarinus M pusilla และพ. prasinos ซึ่งมีดีเอ็นเอ methyltransferases
ของแยกออก dnmt5 subfamily จัดแสดงยิบ
แบบ CG จากในนิวคลีโอโซม linkers อาจมีผลต่อการวางตำแหน่งนิวคลีโอโซมและเหมาะสม

ในการอัดนิวเคลียสขนาดเล็กมาก ( โกรธและ " 2014 ) ดังนั้น การกระจาย
และฟังก์ชัน ( s ) ของ DNA methylation ย้ายถิ่นในสาหร่ายขนาดเล็ก
ดูเหมือนจะแตกต่างกันมาก ทำให้ยากที่จะคาดการณ์ความรู้
จากลักษณะรูปแบบระบบที่เป็นไปได้
บทบาท ( S ) ในการควบคุมการแสดงออกของยีน