21. Genomic and metabolomic fingerp

21. Genomic and metabolomic fingerprinting of Phyllanthus amarus (Schumm & Thonn) hairy root clones
By Abhyankar, Gauri; Rao, K. V.; Reddy, V. D.
From Annals of Phytomedicine (2013), 2(1), 74-88. Language: English, Database: CAPLUS
This study deals with the establishment of hairy root cultures of Phyllanthus amarus, using Agrobacterium rhizogenes
strain ATCC 15834. Genomic and metabolomic profiles of hairy root clones were detd. by employing amplified fragment
length polymorphism (AFLP) and gas chromatog.-mass spectrometry (GC/MS) techniques. Hairy root clones and control
showed ample differences in their AFLP profiles. AFLPs revealed 15-29 plasmid-specific bands and variable no. of
addnl. and/or missing bands of varied size in different clones, suggesting random and multiple integrations of Ri T-DNA.
GC/MS anal. revealed marked differences in the profiles of compds. in various hairy root clones, indicating that the
clones are distinct and dissimilar in their secondary metabolite prodn. These differences in the metabolite profiles of
various clones may be attributed to the random T-DNA integrations resulting in missing and/or addnl. bands as well as
changes in the gene expression pattern of recipient genomes. The hairy root clone Ph19 was found to produce max.
amt. (27 g/100g dry wt.) of a novel compd., Amarone. The overall results amply indicate the genome-wide changes
caused by Ri T-DNA integrations leading to altered gene expression and wide variability in secondary metabolite profiles
of different hairy root clones.
~1 Citing

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

21. จีโนมและพิมพ์ลายนิ้วมือของ metabolomic Phyllanthus amarus (Schumm & Thonn) โคลนรากขน
โดย Abhyankar, Gauri; ราว KV; เรดดี้, VD
จากพงศาวดารของ phytomedicine (2013), 2 (1), 74-88 ภาษา: English, ฐานข้อมูล CAPLUS
นี้ข้อเสนอการศึกษากับสถานประกอบการของรากวัฒนธรรมขนของ Phyllanthus amarus, โดยใช้ Agrobacterium rhizogenes
สายพันธุ์ ATCC 15834. จีโนมและโปรไฟล์ metabolomic ของโคลนรากขนถูก detd โดยการขยายออกเป็นชิ้น
ยาว polymorphism (AFLP) และก๊าซ chromatog. -มวลสาร (GC / MS) เทคนิค โคลนรากขนและการควบคุมการ
แสดงให้เห็นความแตกต่างที่เพียงพอในโปรไฟล์ AFLP ของพวกเขา AFLPs เปิดเผย 15-29 วงดนตรีที่พลาสมิดที่เฉพาะเจาะจงและไม่มีตัวแปร ของ
Addnl และ / หรือวงดนตรีที่มีขนาดแตกต่างกันขาดหายไปในโคลนที่แตกต่างกันบอก integrations สุ่มและหลาย Ri T-DNA.
GC / MS ทางทวารหนัก ความแตกต่างของการทำเครื่องหมายเปิดเผยในโพรไฟล์ของ compds ในโคลนรากขนต่างๆแสดงให้เห็นว่า
โคลนมีความแตกต่างกันและแตกต่างกันใน prodn metabolite ของพวกเขารอง ความแตกต่างเหล่านี้ในโปรไฟล์ metabolite ของ
โคลนต่างๆอาจนำมาประกอบกับการผสานรวมการสุ่ม T-DNA มีผลในการขาดหายไปและ / หรือ Addnl วงดนตรีเช่นเดียวกับ
การเปลี่ยนแปลงในรูปแบบการแสดงออกของยีนของจีโนมของผู้รับ รากขนโคลน Ph19 ถูกพบในการผลิตสูงสุด.
amt (27 กรัม / 100 กรัมน้ำหนักแห้ง.) ของ Compd นวนิยาย. Amarone ผลลัพธ์โดยรวมอย่างพอเพียงบ่งบอกถึงการเปลี่ยนแปลงจีโนมทั้ง
ที่เกิดจากการผสานรวม Ri T-ดีเอ็นเอที่นำไปสู่การเปลี่ยนแปลงการแสดงออกของยีนและความแปรปรวนกว้างในโปรไฟล์ metabolite รอง
ของโคลนรากขนที่แตกต่างกัน.
~ 1 อ้างถึง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

21 . และลายพิมพ์จีโนม metabolomic ของสาร amarus ( ชอม & thonn ) โคลนรากขนโดย abhyankar กาลี ; Rao , K . V ; เรดดี้ , V . D .จากจดหมายเหตุของยาสมุนไพร ( 2013 ) , 2 ( 1 ) 74-88 . ภาษา : ภาษาอังกฤษ : caplus , ฐานข้อมูลการศึกษานี้เกี่ยวข้องกับการขนรากของวัฒนธรรม สาร amarus โดยใช้ Agrobacterium rhizogenesสายพันธุ์ ATCC 15834 . metabolomic โปรไฟล์ของโคลนที่มีรากขนถูก detd . โดยการขยายส่วนความยาวแอลพี ) และ chromatog แก๊ส - แมสสเปกโทรเมทรี ( GC / MS ) เทคนิค โคลน รากขน และการควบคุมพบความแตกต่างทดสอบเล่นในโปรไฟล์ของพวกเขา aflps เปิดเผย 15-29 เฉพาะแถบพลาสมิดและตัวแปรเปล่าaddnl . และ / หรือขาดหายไปและขนาดแตกต่างกันในพันธุ์ที่แตกต่างกันจะสุ่มและหลาย integrations ของริ t-dna .GC / MS ทวารหนัก พบเครื่องหมายความแตกต่างในโปรไฟล์ของ compds . ต่างๆ ขนราก โคลน ที่บ่งชี้ว่าโคลนที่แตกต่างกันและแตกต่างกันในระดับมัธยมศึกษา prodn . ความแตกต่างเหล่านี้ใน โปรไฟล์ ของ อุณหภูมิโคลนต่าง ๆอาจจะเกิดจากการสุ่ม t-dna integrations ส่งผลให้หายไป และ / หรือ addnl . วงรวมทั้งการเปลี่ยนแปลงในการแสดงออกของยีนหารูปแบบของผู้รับ ส่วนขนราก ph19 โคลนพบว่าผลิตสูงสุดมหาชัย . ( 27 กรัม / 100 กรัมน้ำหนักแห้ง ) ของ compd นวนิยาย , าโรเน่ . ผลลัพธ์โดยรวมแยะแสดง genome-wide เปลี่ยนแปลงจากรี t-dna integrations ที่นำไปสู่การเปลี่ยนแปลงการแสดงออกของยีนและการเปลี่ยนแปลงมากมายในรูปแบบการสร้างสารทุติยภูมิโคลน hairy root ที่แตกต่างกัน~ 1 โดย