Several parameters were computed to

Several parameters were computed to estimate the genetic diversity at the population level. We estimated allelic frequencies
using Zhivotovsky's (1999) Bayesian method, with uniform prior distributions and assuming HardyeWeinberg
genotypic proportions. Genetic diversity (He) based on allele frequencies was calculated using the method of Lynch and
Milligan (1994), as implemented in the program AFLP-SURV v. 1.0 (Vekemans et al., 2002). A matrix of pairwise population
FST (the proportion of the total genetic variance contained in a subpopulation (S subscript) relative to the total genetic
variance (T subscript)) values using the FST analogue ФPT was calculated using GENALEX 6.0 (Peakall and Smouse, 2006). To
visualize the pattern of genetic clustering of individuals, we used principal coordinate analysis (PCoA; Orloci, 1978) and
plotted the results on a genetic distance matrix generated from the binary presenceeabsence matrix, as implemented in
GENALEX 6.0. We also examined patterns of population structure using the Bayesian assignment probability test in the program
STRUCTURE 2.2 (Pritchard et al., 2004)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พารามิเตอร์หลายถูกคำนวณเพื่อประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมในระดับประชากร เราประเมินความถี่ allelicใช้ของ Zhivotovsky (1999) ทฤษฎีวิธี มีการกระจายก่อนที่เหมือนกันและสมมติว่า HardyeWeinbergสัดส่วนของจีโนไทป์ พันธุ (เขา) ตามความถี่ของอัลลีถูกคำนวณโดยใช้วิธีการของลินช์ และMilligan (1994), ตามที่นำมาใช้ในโปรแกรม AFLP SURV v. 1.0 (Vekemans et al. 2002) เมทริกซ์ของประชากรแพร์ไวส์FST (สัดส่วนของความแปรปรวนทางพันธุกรรมรวมอยู่ใน subpopulation (ตัวห้อย S) เมื่อเทียบกับผลรวมทางพันธุกรรมค่าความแปรปรวน (ตัวห้อย T)) โดยใช้ ФPT อนาล็อก FST ถูกคำนวณโดยใช้ 6.0 GENALEX (Peakall และ Smouse, 2006) ถึงเห็นรูปแบบของพันธุกรรมของบุคคล เราใช้หลักประสานงานวิเคราะห์ (PCoA Orloci, 1978) และพล็อตผลลัพธ์บนเมทริกซ์ระยะห่างทางพันธุกรรมจากเมตริกซ์ presenceeabsence ไบนารี นำมาใช้ในGENALEX 6.0 นอกจากนี้เรายังตรวจสอบรูปแบบของโครงสร้างประชากรที่ใช้การทดสอบทฤษฎีกำหนดความน่าเป็นในโปรแกรมโครงสร้าง 2.2 (Pritchard et al. 2004)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พารามิเตอร์หลายคนถูกคำนวณเพื่อประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมในระดับประชากร เราประมาณความถี่ allelic
ใช้ (1999) วิธีการคชกรรม Zhivotovsky ด้วยเครื่องแบบกระจายก่อนและสมมติ HardyeWeinberg
สัดส่วนพันธุกรรม ความหลากหลายทางพันธุกรรม (เขา) ตามความถี่อัลลีลที่คำนวณโดยใช้วิธีการของลินช์และ
มัลลิแกน (1994) ในขณะที่การดำเนินการในโปรแกรม AFLP-SURV v. 1.0 (Vekemans et al., 2002) เมทริกซ์ของประชากรจากจำนวน
FST (สัดส่วนของความแปรปรวนทางพันธุกรรมทั้งหมดที่มีอยู่ใน subpopulation (S ห้อย) เทียบกับพันธุกรรมรวม
แปรปรวน (T ห้อย)) ค่าใช้อนาล็อก FST ФPTคำนวณโดยใช้ GENALEX 6.0 (Peakall และ Smouse 2006 ) จะ
เห็นภาพรูปแบบของการจัดกลุ่มทางพันธุกรรมของบุคคลที่เราใช้หลักวิเคราะห์ประสานงาน (PCoA; Orloci, 1978) และ
พล็อตผลในเมทริกซ์ระยะทางพันธุกรรมที่เกิดจากเมทริกซ์ presenceeabsence ไบนารีเช่นการดำเนินการใน
GENALEX 6.0 นอกจากนี้เรายังมีการตรวจสอบรูปแบบของโครงสร้างประชากรโดยใช้การทดสอบที่ได้รับมอบหมายคชกรรมในโปรแกรม
โครงสร้าง 2.2 (Pritchard et al., 2004)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หลายพารามิเตอร์ถูกคำนวณการประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมในระดับประชากร เราคาดว่าความถี่แอลลีลิกการใช้ zhivotovsky ( 1999 ) วิธีแบบเบส์ ที่มีการแจกแจงก่อน hardyeweinberg เครื่องแบบและสมมุติว่าสัดส่วนผู้ป่วย . ความหลากหลายทางพันธุกรรม ( เขา ) ขึ้นอยู่กับความถี่คำนวณโดยใช้วิธี ลินช์ และมิลลิแกน ( 1994 ) ที่ใช้ในโปรแกรม aflp-surv V . 1.0 ( vekemans et al . , 2002 ) เมทริกซ์ของประชากรตอนf ( สัดส่วนของความแปรปรวนทั้งหมดที่มีอยู่ใน subpopulation ( s ตัวห้อย ) สัมพันธ์กับพันธุกรรมทั้งหมดความแปรปรวน ( ไม่ตกลง ) ) ค่าใช้ f อนาล็อกФ PT ถูกคำนวณโดยใช้ genalex 6.0 ( peakall และ smouse , 2006 ) เพื่อเห็นรูปแบบของการจัดกลุ่มทางพันธุกรรมของแต่ละบุคคล เราใช้วิเคราะห์ประสานงานหลัก ( pcoa ; orloci , 1978 ) และวางแผนผลลัพธ์ในทางพันธุกรรมที่เกิดจากระยะทางเมทริกซ์เมทริกซ์ presenceeabsence ไบนารีที่ใช้ในgenalex 6.0 . นอกจากนี้เรายังตรวจสอบรูปแบบโครงสร้างประชากร โดยใช้แบบทดสอบในโปรแกรมงาน ความน่าจะเป็นโครงสร้าง 2.2 ( พริทชาร์ด et al . , 2004 )