identified molecularly, and await m

identified molecularly, and await morphological characterization to solidify their species status [34]. However we include these species because they have been isolated by several groups that have confirmed the genetic distinction as species and ensure their identity doesn't overlap with already named species. Other authors have reported novel malaria species in lemurs [35,36] and African Old World Monkeys [27,37] based on molecularly characterized samples. These species are listed in Table A.1 but we did not consider these as species in host species accumulation calculations, however they were included in group calculations few isolates or few groups have isolated the parasites, and it is unknown whether their identity overlaps with morphologically described species. For example, almost every lemur malaria parasite found has been named a unique Plasmodium species [35,36 , 38], but there is no corresponding molecular and morphological data from most of these parasites.
For each published account, the location, host species name (in the paper), subspecies (if applicable), number of hosts sampled, sampling method, identification method, Plasmodium species found, and any notes of interest were recorded (full data available in Table A.2). Because genus and species names have changed over the century the data was collected, we used locations and descriptions to update host names to the Mammals of the World 2005 nomenclature [39], which we cross-validated with species synonym files [40]. When possible, we contacted authors for missing information from publications to complete database entries.
A prerequisite for the data to be included in the geographic analysis was that a specific country of origin must be known. Occasionally authors utilized samples from zoos with unknown origin, or worked with samples that had been exported without a country of origin specified, so these were excluded from our presence/absence maps. For data to be included in the species accumulation analysis, the surveys they came from had to utilize methods that did not obviously bias species discovery. For example, if specific primers for a sub genus or particular Plasmodium species were used, then these were excluded from species accumulation analyses. These exclusions are identified for each entry in Table A.2.
The methods used to detect and identify malaria parasites in primates vary in their sensitivity and specificity. Historically, Plasmodium was identified by erythrocytic morphological characteristics using microscopy. Malaria parasites can also be identified in blood samples using molecular markers (i.e., a nested PCR protocol with speciesspecific primers). Microscopy has a limit of detection of approximately 40 parasites/μL, meaning well-trained malariologists must check at least 100 fields of thick bloodfilmsto detect parasites in anindividual. Information on screening protocol was rarely given, so we are unable to compare sensitivities among microscopy studies. PCR using DNA isolated from blood is the most sensitive method for detection of active infections [41]. The last method is parasite detection from fecal samples. Although there are benefits to using non-invasively-collected samples, they degrade quickly in the field and range in their sensitivity (30–95%; [42]). Nevertheless, all of these dataare informative for determining relative frequencies of infection, and predicting species richness in primates.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระบุ molecularly และรอการจำแนกสัณฐานจะแข็งชนิดสถานะ [34] อย่างไรก็ตาม เรามีสายพันธุ์เหล่านี้เนื่องจากมีการแยกต่างหากจากกลุ่มต่าง ๆ ที่ได้ยืนยันความแตกต่างทางพันธุกรรมเป็นชนิด และให้แน่ใจว่าตัว ไม่ทับซ้อนกับแล้วชื่อพันธุ์ คนมีรายงานตัวอย่างลักษณะของนวนิยายมาลาเรียชนิดในแอฟริกาโลกเก่าลิง [27,37] ตาม molecularly lemurs [35,36] พันธุ์เหล่านี้อยู่ในตาราง A.1 แต่เราไม่ได้พิจารณาเหล่านี้เป็นสปีชีส์ในโฮสต์ชนิดสะสมคำนวณ แต่พวกเขารวมอยู่ในกลุ่มการคำนวณสามแยกหรือสามกลุ่มได้แยกต่างหากกับ และเป็นไม่ทราบว่าตัวทับซ้อนกับพันธุ์ morphologically อธิบาย ตัวอย่าง เกือบทุกลีเมอร์มาลาเรียพบได้ถูกตั้งชื่อชนิดพลาสโมเดียมเฉพาะ [35,36, 38], แต่มีข้อมูลที่โมเลกุล และสัณฐานไม่เกี่ยวข้องส่วนใหญ่กับเหล่านี้สำหรับแต่ละเผยแพร่บัญชี ตำแหน่ง ชื่อโฮสต์ (ในกระดาษ), ชนิดย่อย (ถ้ามี) หมายเลขของโฮสต์ตัวอย่าง วิธีการ วิธีการระบุ พลาสโมเดียมชนิดพบ การสุ่มตัวอย่าง และบันทึกย่อใด ๆ น่าสนใจถูกบันทึกไว้ (เต็มรูปแบบข้อมูลในตาราง A.2) เนื่องจากมีการเปลี่ยนแปลงชื่อสกุลและสปีชีส์กว่าศตวรรษได้รวบรวมข้อมูล เราใช้สถานและคำอธิบายการปรับปรุงชื่อโฮสต์การเลี้ยงลูกด้วยนมของโลก 2005 ระบบการตั้งชื่อ [39], ซึ่งเราข้ามตรวจสอบกับแฟ้มเหมือนพันธุ์ [40] เมื่อเป็นไปได้ เราติดต่อผู้เขียนข้อมูลหายไปจากสื่อสิ่งพิมพ์เพื่อทำรายการของฐานข้อมูลข้อกำหนดเบื้องต้นสำหรับข้อมูลที่จะรวมในการวิเคราะห์ทางภูมิศาสตร์ถูกว่า ประเทศผู้ผลิตต้องทราบ บางครั้งผู้เขียนใช้ตัวอย่างจากมหาวิทยาลัยโดยไม่ทราบสาเหตุ หรือทำงานกับตัวอย่างที่มีการส่งออก โดยประเทศผู้ผลิตที่ระบุไว้ ดังนั้นเหล่านี้ถูกแยกออกจากสถานะ/ขาดงานแผนที่ของเรา สำหรับข้อมูลที่จะรวมในการวิเคราะห์รวบรวมสายพันธุ์ สำรวจพวกเขามาจากมีการใช้วิธีการที่ได้ไม่แน่นอนตั้งสปีชีส์ค้นพบ ตัวอย่าง ถ้าใช้ไพรเมอร์เฉพาะสกุลย่อยหรือเฉพาะชนิดพลาสโมเดียม แล้วเหล่านี้ถูกแยกออกจากการวิเคราะห์รวบรวมพันธุ์ Exclusions เหล่านี้ได้รับการระบุสำหรับแต่ละรายการในตาราง A.2วิธีที่ใช้ในการตรวจสอบ และระบุปรสิตมาลาเรียใน primates แตกต่างกันไปในความไวและ specificity ประวัติ พลาสโมเดียมที่ระบุ โดยลักษณะสัณฐาน erythrocytic ใช้ microscopy นอกจากนี้ยังสามารถระบุมาลาเรียปรสิตในตัวอย่างเลือดโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุล (เช่น ซ้อน PCR โพรโทคอกับไพรเมอร์ speciesspecific) Microscopy จำนวนประมาณ 40 กับ/μL หมายถึง การตรวจสอบฝึกฝน malariologists bloodfilmsto หนาน้อย 100 เขตตรวจหาปรสิตใน anindividual ตรวจสอบได้ ข้อมูลเกี่ยวกับโพรโทคอลการตรวจคัดกรองไม่ค่อยให้ ดังนั้นเราจึงไม่สามารถเปรียบเทียบรัฐระหว่างศึกษา microscopy การ PCR โดยใช้ดีเอ็นเอแยกต่างหากจากเลือดเป็นวิธีสำคัญที่สุดสำหรับตรวจหาการติดเชื้อใช้งาน [41] วิธีสุดท้ายคือ ตรวจหาปรสิตจากตัวอย่าง fecal แม้ว่าจะมีประโยชน์ในการใช้ไม่ใช่-invasively-เก็บรวบรวมตัวอย่าง พวกเขาลดลงอย่างรวดเร็วในฟิลด์และช่วงในความไวของพวกเขา (30-95% [42]) . อย่างไรก็ตาม ทั้งหมดของ dataare เหล่านี้ข้อมูลสำหรับกำหนดความถี่สัมพัทธ์ของการติดเชื้อ และความรุ่มรวยของสปีชีส์ใน primates คาดการณ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ระบุโมเลกุลและลักษณะทางสัณฐานวิทยารอคอยที่จะแข็งชนิดสถานะของพวกเขา [34] อย่างไรก็ตามเรารวมสายพันธุ์เหล่านี้เพราะพวกเขาได้รับการแยกจากหลายกลุ่มที่ได้รับการยืนยันทางพันธุกรรมแตกต่างสายพันธุ์และตรวจสอบตัวตนของพวกเขาไม่ทับซ้อนกับสายพันธุ์ชื่อแล้ว เขียนคนอื่น ๆ ได้มีการรายงานโรคมาลาเรียสายพันธุ์ใหม่ในการค่าง [35,36] และแอฟริกันลิงโลกเก่า [27,37] ตามตัวอย่างลักษณะโมเลกุล สายพันธุ์เหล่านี้จะถูกระบุไว้ในตาราง A.1 แต่เราไม่คิดว่าเหล่านี้เป็นสายพันธุ์ในการคำนวณการสะสมสายพันธุ์เจ้าภาพอย่างไรก็ตามพวกเขาก็ถูกรวมอยู่ในการคำนวณกลุ่มไม่กี่สายพันธุ์หรือไม่กี่กลุ่มได้แยกปรสิตและมันเป็นที่รู้จักว่าตนคาบเกี่ยวกับสัณฐาน อธิบายชนิด ยกตัวอย่างเช่นเกือบทุกมาลาเรียพบลิงได้รับเสนอชื่อเป็นสายพันธุ์ที่ไม่ซ้ำกัน Plasmodium [35,36, 38] แต่ไม่มีข้อมูลที่สอดคล้องกันในระดับโมเลกุลและลักษณะทางสัณฐานวิทยาจากส่วนใหญ่ของปรสิตเหล่านี้.
สำหรับบัญชีการเผยแพร่ในแต่ละสถานที่ชื่อสปีชีส์เป็นเจ้าภาพ (ในกระดาษ) ชนิดย่อย (ถ้ามี), จำนวนของโฮสต์ตัวอย่างวิธีการสุ่มตัวอย่างวิธีการระบุชนิด Plasmodium พบและบันทึกใด ๆ ที่น่าสนใจที่ถูกบันทึกไว้ (ข้อมูลเต็มรูปแบบที่มีอยู่ใน A.2 ตาราง) เพราะประเภทและมีการเปลี่ยนแปลงชื่อสปีชีส์ในช่วงศตวรรษข้อมูลที่ถูกเก็บรวบรวมเราใช้สถานที่และรายละเอียดในการปรับปรุงชื่อเจ้าภาพเลี้ยงลูกด้วยนมของศัพท์โลก 2005 [39] ซึ่งเราข้ามการตรวจสอบกับสายพันธุ์ไวพจน์ไฟล์ [40] เมื่อเป็นไปได้ที่เราจะติดต่อผู้เขียนข้อมูลที่หายไปจากสื่อสิ่งพิมพ์จะเสร็จสมบูรณ์ในรายการฐานข้อมูล.
จำเป็นสำหรับข้อมูลที่จะรวมอยู่ในการวิเคราะห์ทางภูมิศาสตร์คือการที่ประเทศใดประเทศแหล่งกำเนิดสินค้าจะต้องรู้จัก ผู้เขียนใช้เป็นครั้งคราวตัวอย่างจากสวนสัตว์ที่มีต้นกำเนิดที่ไม่รู้จักหรือทำงานร่วมกับกลุ่มตัวอย่างที่ได้รับการส่งออกโดยไม่ต้องประเทศต้นทางที่ระบุเหล่านี้จึงได้รับการยกเว้นจากการแสดงตนของเรา / แผนที่ขาด สำหรับข้อมูลที่จะรวมอยู่ในการวิเคราะห์การสะสมสายพันธุ์การสำรวจที่พวกเขามาจากมีการใช้วิธีการที่ไม่ได้เห็นได้ชัดว่าการค้นพบสายพันธุ์ที่มีอคติ ตัวอย่างเช่นถ้าไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจงสำหรับประเภทย่อยหรือชนิด Plasmodium โดยเฉพาะอย่างยิ่งถูกนำมาใช้แล้วเหล่านี้ได้รับการยกเว้นจากการวิเคราะห์การสะสมสายพันธุ์ ยกเว้นเหล่านี้จะมีการระบุสำหรับแต่ละรายการในตาราง A.2.
วิธีการที่ใช้ในการตรวจสอบและระบุปรสิตมาลาเรียในบิชอพที่แตกต่างกันไวและความจำเพาะของพวกเขา อดีต Plasmodium ถูกระบุลักษณะทางสัณฐานวิทยา erythrocytic ใช้กล้องจุลทรรศน์ ปรสิตมาลาเรียยังสามารถระบุได้ในตัวอย่างเลือดโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุล (เช่นโปรโตคอล PCR ที่ซ้อนกันกับไพรเมอร์ speciesspecific) กล้องจุลทรรศน์มีขีด จำกัด ของการตรวจสอบประมาณ 40 ปรสิต / ไมโครลิตรความหมาย malariologists มีการฝึกอบรมจะต้องตรวจสอบอย่างน้อย 100 สาขาหนา bloodfilmsto ตรวจพบปรสิตใน anindividual ข้อมูลเกี่ยวกับโปรโตคอลการตรวจคัดกรองได้รับไม่ค่อยได้ดังนั้นเราจึงไม่สามารถที่จะเปรียบเทียบความเปราะบางในหมู่การศึกษากล้องจุลทรรศน์ PCR โดยใช้ดีเอ็นเอที่แยกได้จากเลือดเป็นวิธีที่สำคัญที่สุดสำหรับการตรวจหาการติดเชื้อที่ใช้งาน [41] วิธีสุดท้ายคือการตรวจหาปรสิตจากตัวอย่างอุจจาระ แม้ว่าจะมีประโยชน์ในการใช้ตัวอย่างไม่ invasively-เก็บรวบรวมพวกเขาลดลงอย่างรวดเร็วในสนามและในช่วงความไวของพวกเขา (30-95% [42]) แต่สิ่งเหล่านี้ dataare ข้อมูลสำหรับการกำหนดความถี่สัมพัทธ์ของการติดเชื้อและการทำนายความร่ำรวยชนิดนี้ในบิชอพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การระบุโมเลกุลและสัณฐานวิทยาการรอคอยของสายพันธุ์สถานะของแข็ง [ 34 ] แต่เรารวมสายพันธุ์เหล่านี้ เพราะพวกเขาถูกแยกจากหลายกลุ่มที่ได้รับการยืนยันความแตกต่างทางพันธุกรรมเป็นชนิดและให้แน่ใจว่าพวกเขาจะไม่ทับซ้อนกับตนแล้ว ชื่อ ชนิด ผู้เขียนอื่น ๆมีรายงานนวนิยายชนิดมาลาเรียลิงลม [ 35[ 36 ] และลิงโลกเก่าแอฟริกา 27,37 ] ขึ้นอยู่กับลักษณะโมเลกุลของตัวอย่าง ชนิดเหล่านี้มีการระบุไว้ในโต๊ะ a.1 แต่เราไม่ได้พิจารณาเหล่านี้เป็นชนิดในสปีชีส์ที่โฮสต์สะสมการคำนวณ อย่างไรก็ตามพวกเขาถูกรวมอยู่ในกลุ่มการคำนวณไม่กี่สายพันธุ์หรือกลุ่มน้อยมีแยกปรสิตและไม่รู้ว่าตัวตนของตนกับทับซ้อนจากอธิบายชนิด ตัวอย่างเช่น เกือบทุกบ่างปรสิตมาลาเรียชนิด พลาสโมเดียม พบถูกตั้งชื่อกัน 35,36 [ 38 ] แต่ไม่มีที่ระดับโมเลกุลและข้อมูลลักษณะทางสัณฐานวิทยาจากส่วนใหญ่ของปรสิตเหล่านี้ .
สำหรับแต่ละหัวข้อชนิดบัญชี ที่ตั้ง ชื่อโฮสต์ ( ในกระดาษ ) , สตีฟ แนช ( ถ้ามี )จำนวนโฮสต์ตัวอย่าง วิธีการกำหนดวิธีการ สุ่มตัวอย่าง พลาสโมเดียม ชนิดที่พบและบันทึกใด ๆที่น่าสนใจที่ถูกบันทึกไว้ ( ข้อมูลมีอยู่เต็มโต๊ะ a.2 ) เพราะ ชื่อ สกุล และชนิดมีการเปลี่ยนแปลงกว่าศตวรรษ เก็บข้อมูล เราใช้สถานที่และรายละเอียดการปรับปรุงชื่อโฮสต์ไปยังสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมของโลก 2005 ระบบการตั้งชื่อ [ 39 ]ที่เราข้ามการตรวจสอบกับชนิดแฟ้มคำที่เกี่ยวข้อง [ 40 ] ถ้าเป็นไปได้ เราติดต่อผู้เขียนสำหรับข้อมูลที่หายไปจากสิ่งพิมพ์ที่จะเสร็จสมบูรณ์รายการฐานข้อมูล
จําเป็นสําหรับข้อมูลจะรวมอยู่ในการวิเคราะห์ทางภูมิศาสตร์ที่เฉพาะประเทศต้นทางต้องรู้จักกัน บางครั้งผู้เขียนใช้ตัวอย่างจากสวนสัตว์ที่ไม่ทราบที่มาหรือทำงานกับตัวอย่างที่ถูกส่งออกโดยประเทศที่ระบุไว้ ดังนั้นเหล่านี้ถูกแยกออกจากแผนที่มี / ไม่มีของเรา สำหรับข้อมูลที่จะถูกรวมอยู่ในสายพันธุ์การสะสมการวิเคราะห์การสำรวจพวกเขามาจาก ต้องใช้วิธีการที่ไม่แน่ชัด อคติ ชนิด การค้นพบ ตัวอย่างเช่น ถ้าส่วนของดีเอ็นเอย่อยสกุลหรือชนิดโดยเฉพาะการใช้แล้วเหล่านี้ได้รับการยกเว้นจากการสะสมการวิเคราะห์ชนิด . ส่วนขยายเหล่านี้จะถูกระบุไว้สำหรับรายการในแต่ละโต๊ะ a.2 .
วิธีที่ใช้ในการตรวจหาและระบุไข้มาลาเรียปรสิตในสัตว์ที่แตกต่างกันในความไวและความจำเพาะ . ในอดีต การระบุลักษณะทาง erythrocytic โดยใช้กล้องจุลทรรศน์ .ไข้มาลาเรียปรสิตยังสามารถระบุในเลือดโดยใช้โมเลกุลเครื่องหมาย ( เช่น เป็นแบบซ้อนกันด้วยวิธี PCR ( speciesspecific ) กล้องจุลทรรศน์มีขีดจำกัดของการตรวจหาปรสิต / μประมาณ 40 ลิตร ความหมาย malariologists ฝึกปรือต้องตรวจสอบอย่างน้อย 100 สาขา bloodfilmsto หนาตรวจหาพยาธิใน anindividual . ข้อมูลเกี่ยวกับโพรโทคอลคือการไม่ค่อยให้ดังนั้นเราจึงไม่สามารถเปรียบเทียบความไวของจุลทรรศน์ศาสตร์ วิธี PCR โดยใช้ DNA ที่แยกได้จากเลือดเป็นวิธีที่ไวที่สุดในการตรวจหางานเชื้อ [ 41 ] วิธีสุดท้ายคือ การตรวจหาพยาธิจากตัวอย่างอุจจาระ . แม้ว่าจะมีประโยชน์ในการใช้ไม่ invasively เก็บตัวอย่างก็ลดลงอย่างรวดเร็วในฟิลด์ และหลากหลายในความไวของพวกเขา ( 30 – 95 % ; [ 42 ] ) อย่างไรก็ตามทั้งหมดนี้ dataare ข้อมูลเพื่อกำหนดความถี่ของการติดเชื้อ และทำนายความอุดมสมบูรณ์ใน
ชนิดสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม