Figure 3. Comparative genomics acro

Figure 3. Comparative genomics across the insects.The phylogeny is based on maximum likelihood analyses of a concatenated alignment of
197 widespread, single-copy proteins. The tree was rooted using chordates as the most external out group. Bars represent a comparison of the gene
content of all species included in the analysis (scale on the top). Bars are subdivided to indicate different types of homology relationships; black:
widespread genes that are found with a one-to-one orthology in at least 16 of the 17 species; blue: widespread genes that can be found in at least 16
of the 17 species and are sometimes present in more than one copy; red: widespread but insect-specific genes present in at least 12 of the 13 insect
species; yellow: non-widespread insect-specific genes (present in less than 12 insect species); green: genes present in insects and other groups but
with a patchy distribution; white: species-specific genes with no (detectable) homologs in other species (striped fraction corresponds to speciesspecific genes present in more than one copy). The thin red line under each bar represents the percentage ofA. pisumgenes that have homologs in
the given species (scale across the bottom of the figure). The fractions of single genes (grey) and duplicated genes (black) for some of the species are
represented as pie charts.
doi:10.1371/journal.pbio.1000313.g003

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รูปที่ 3 ฟังก์ชั่นการเปรียบเทียบข้ามเชื้อชาติ insects.the อยู่บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ความน่าจะเป็นสูงสุดของการจัดตำแหน่งการตัดแบ่งจาก 197
แพร่หลายโปรตีนเดียวสำเนา ต้นไม้ที่หยั่งรากลึกโดยใช้ chordates เป็นกลุ่มออกภายนอกมากที่สุด แถบแสดงการเปรียบเทียบของยีน
เนื้อหาของทุกชนิดรวมอยู่ในการวิเคราะห์ (ขนาดที่ด้านบน)บาร์แบ่งเพื่อแสดงให้เห็นความแตกต่างของความสัมพันธ์ที่คล้ายคลึงกัน; สีดำ:
ยีนอย่างกว้างขวางว่าจะพบกับแบบหนึ่งต่อหนึ่ง orthology อย่างน้อย 16 จาก 17 ชนิด; สีน้ำเงิน: ยีนอย่างกว้างขวางว่าสามารถพบได้ในอย่างน้อย 16
จาก 17 ชนิดและบางครั้งก็นำเสนอในกว่าหนึ่งสำเนา; สีแดง: ยีนแพร่หลาย แต่แมลงที่เฉพาะเจาะจงนำเสนออย่างน้อย 12 จาก 13 แมลงชนิด
สีเหลือง:ไม่แพร่หลายยีนแมลงเฉพาะ (ปัจจุบันในเวลาน้อยกว่า 12 ชนิดแมลง); สีเขียว: ยีนนำเสนอในแมลงและกลุ่มอื่น ๆ แต่
มีการกระจายเป็นหย่อม; สีขาว: ยีนชนิดที่เฉพาะเจาะจงกับไม่มีโฮโมลอก (พบ) ในสายพันธุ์อื่น (ลาย เศษสอดคล้องกับยีน speciesspecific นำเสนอมากกว่าหนึ่งสำเนา) เส้นสีแดงบางใต้แถบแต่ละ OFA ร้อยละpisumgenes ที่มีโฮโมลอกใน
ขยายพันธุ์ (ขนาดที่ด้านล่างของรูป) เศษส่วนของยีนเดียว (สีเทา) และยีนซ้ำ (สีดำ) สำหรับบางสายพันธุ์ที่มี
แสดงเป็นแผนภูมิวงกลม
ดอย:. 10.1371/journal.pbio.1000313.g003

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปที่ 3 Genomics เปรียบเทียบระหว่างแมลงPhylogeny ขึ้นอยู่กับการวิเคราะห์ความเป็นไปได้สูงสุดของตำแหน่งต่อของ
197 แพร่ สำเนาเดียวของโปรตีน ต้นไม้มีรากใช้ chordates ภายนอกออกกลุ่มที่มากที่สุด แถบแสดงการเปรียบเทียบยีน
เนื้อหาของสปีชีส์ทั้งหมดที่รวมอยู่ในการวิเคราะห์ (สเกลด้านบน) บาร์มีปฐมภูมิเพื่อระบุชนิดของความสัมพันธ์ homology สีดำ:
แพร่ยีนที่พบกับ orthology แบบหนึ่งต่อหนึ่งในอย่างน้อย 16 ชนิด 17 สีน้ำเงิน: แพร่ยีนที่สามารถพบได้ในอย่างน้อย 16
17 ชนิดและมีบางครั้งอยู่ในมากกว่าหนึ่งสำเนา สีแดง: แสดงยีนอย่างแพร่หลาย แต่ เฉพาะแมลงน้อย 12 ของแมลง 13
พันธุ์ สีเหลือง: ไม่ใช่แพร่หลายเฉพาะแมลงยีน (อยู่ในสายพันธุ์แมลงต่ำกว่า 12); สีเขียว: แสดงยีนในแมลงกลุ่มอื่น ๆ แต่
กับกระจายรำลึก สีขาว: ยีน species-specific กับ homologs ไม่ (อาสา) ในชนิดอื่น ๆ (เศษส่วนลายตรงกับยีน speciesspecific ในมากกว่าหนึ่งสำเนา) เดอะทินเรดไลน์ภายใต้แต่ละแถบแสดงเสิร์ฟเปอร์เซ็นต์ pisumgenes ที่มี homologs
ชนิดกำหนด (มาตราส่วนด้านล่างของภาพ) บางส่วนของยีนเดี่ยว (สีเทา) และซ้ำยีน (สีดำ) สำหรับบางสายพันธุ์มี
แสดงเป็นพาย charts.
doi:10.1371/journal.pbio.1000313.g003

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปที่ 3 . genomics ความได้เปรียบเชิงเปรียบเทียบกับแมลงที่. phylogeny ที่อยู่บนพื้นฐานการวิเคราะห์ความเป็นไปของการจัดตำแหน่งสูงสุดของ
ซึ่งจะช่วยค่าใช้จ่ายเป็น SMS แบบต่อเนื่องที่ 197 โปรตีนแบบ Single - คัดลอกอย่างกว้างขวาง ทรีที่มีรากติดอยู่โดยใช้ chordates มากที่สุดเป็นกลุ่มออกมา ภายนอก ได้ บาร์เป็นการเปรียบเทียบที่ของยีน
เนื้อหาของสายพันธุ์ทั้งหมดที่รวมอยู่ในการวิเคราะห์ที่(อยู่ทางด้านบน)มีบาร์แบ่งย่อยพื้นที่เพื่อแสดงแตกต่างตาม ประเภท ของลักษณะซึ่งเทียบเคียงกันได้ความสัมพันธ์;สีดำ:
อย่างแพร่หลายยีนที่พบได้ด้วยแบบหนึ่งต่อหนึ่ง orthology ในที่อย่างน้อย 16 แห่งที่ 17 สายพันธุ์;สีฟ้า:อย่างแพร่หลายยีนที่สามารถพบได้ในที่อย่างน้อย 16
ของ 17 สายพันธุ์และมีบางครั้งในมากกว่าหนึ่งสำเนา;สีแดง:แมลงอย่างแพร่หลายแต่เฉพาะในยีนที่อย่างน้อย 12 แห่งที่ 13 และแมลง
สายพันธุ์;สีเหลือง:ไม่มีแมลงอย่างแพร่หลาย - เฉพาะยีน(มีอยู่ในไม่น้อยกว่า 12 ชนิดแมลง);สีเขียว:ยีนในแมลงและกลุ่มอื่นๆแต่
พร้อมด้วยแผ่นกระจาย;สีขาว:สายพันธุ์ - เฉพาะยีนที่ไม่มี(สามารถตรวจพบ) homologs ในสายพันธุ์อื่นๆ(ลายเศษตรงกับ speciesspecific ยีนในมากกว่าหนึ่งสำเนา) สายสีแดงบางตามบาร์แต่ละแห่งจะแสดงถึงแหล่งรวมพรรณเปอร์เซ็นต์pisumgenes ที่มี homologs ใน
ซึ่งจะช่วยให้ได้รับสายพันธุ์(อยู่ด้านล่างของ ภาพ ) เพียงเศษเสี้ยววินาทีที่ของยีนเดี่ยว(สีเทา)และยีนซ้ำ(สีดำ)สำหรับสายพันธุ์ที่มี
แสดงเป็น แผนภูมิ ฉบับพาย.
ดอย: 10.1371 /. pbio.1000313 . g EXPS .003