For genome-wide association data an

For genome-wide association data analysis, two genes in any pathway, two SNPs in the two linked gene regions respectively or in the two linked exons respectively within one gene are often correlated with each other. We therefore proposed the concept of gene-gene co-association, which refers to the effects not only due to the traditional interaction under nearly independent condition but the correlation between two genes. Furthermore, we constructed a novel statistic for detecting gene-gene co-association based on Partial Least Squares Path Modeling (PLSPM). Through simulation, the relationship between traditional interaction and co-association was highlighted under three different types of co-association. Both simulation and real data analysis demonstrated that the proposed PLSPM-based statistic has better performance than single SNP-based logistic model, PCA-based logistic model, and other gene-based methods

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลสมาคมทั้งจีโนม ยีนสองในทางเดินใด ๆ SNPs สองในสองภูมิภาคยีนที่เชื่อมโยงตามลำดับ หรือใน exons เชื่อมโยงสองตามลำดับภายในยีนหนึ่งมัก correlated กัน เราจึงนำเสนอแนวคิดของยีนยีนร่วมสมาคม ซึ่งหมายถึงผลกระทบไม่เพียงแต่เนื่อง จากการโต้ตอบแบบดั้งเดิมภายใต้เงื่อนไขเกือบอิสระแต่ความสัมพันธ์ระหว่างยีนทั้งสอง นอกจากนี้ เราสามารถสร้างสถิตินวนิยายสำหรับการตรวจสอบยีนยีนร่วมสมาคมโดยในบางส่วนกำลังสองน้อยสุดเส้นทางการสร้างโมเดล (PLSPM) ด้วยการจำลองสถานการณ์ ความสัมพันธ์ระหว่างสมาคมร่วมและโต้ตอบแบบดั้งเดิมที่เน้นภายใต้สมาคมร่วมสามประเภท การวิเคราะห์ข้อมูลจำลองและจริงแสดงว่า สถิติใช้ PLSPM นำเสนอมีประสิทธิภาพที่ดีกว่าโดย SNP เดียวแบบโลจิสติก สมาคมตามแบบจำลอง logistic และอื่น ๆ วิธีใช้ยีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการวิเคราะห์ข้อมูลของสมาคมจีโนมทั้งสองยีนในทางเดินใด ๆ สอง SNPs ในสองภูมิภาคท​​ี่เชื่อมโยงกับยีนหรือตามลำดับในสองเชื่อมโยง exons ตามลำดับภายในหนึ่งยีนมักจะมีความสัมพันธ์กับคนอื่น ๆ ดังนั้นเราจึงนำเสนอแนวคิดของยีนที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมร่วมสมาคมซึ่งหมายถึงผลกระทบไม่เพียง แต่เนื่องจากการมีปฏิสัมพันธ์แบบดั้งเดิมภายใต้เงื่อนไขที่เป็นอิสระเกือบ แต่ความสัมพันธ์ระหว่างสองยีน นอกจากนี้เรายังสร้างสถิติใหม่สำหรับการตรวจหายีนที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมร่วมสมาคมขึ้นอยู่กับสองน้อยบางส่วนเส้นทางการสร้างแบบจำลอง (PLSPM) ผ่านการจำลองความสัมพันธ์ระหว่างการมีปฏิสัมพันธ์แบบดั้งเดิมและร่วมสมาคมเป็นไฮไลต์ภายใต้สามประเภทที่แตกต่างกันของเพื่อนร่วมสมาคม ทั้งจำลองและการวิเคราะห์ข้อมูลจริงแสดงให้เห็นว่าที่เสนอ PLSPM สถิติที่ใช้มีประสิทธิภาพที่ดีขึ้นกว่ารุ่นเดียวโลจิสติก SNP ตามรูปแบบโลจิสติก PCA-based และวิธีการแสดงออกของยีนที่ใช้อื่น ๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สมาคมเพื่อการวิเคราะห์ข้อมูล genome-wide สองยีนในทางเดิน สอง snps ในสองเชื่อมโยงยีนภูมิภาคตามลำดับ หรือในที่มีสองเชื่อมโยงตามลำดับภายในยีน มักมีความสัมพันธ์กับแต่ละอื่น ๆ เราจึงได้เสนอแนวคิดของสมาคมโคยีน ยีนซึ่งหมายถึงผลกระทบไม่เพียง แต่เนื่องจากการปฏิสัมพันธ์แบบดั้งเดิมในสภาวะอิสระเกือบ แต่ความสัมพันธ์ระหว่างสองยีน นอกจากนี้ เราได้สร้างสถิติใหม่ในการตรวจหายีนยีนบางส่วน สมาคม Co ตามเส้นทางแบบกำลังสองน้อยที่สุด ( plspm ) ผ่านการจำลองความสัมพันธ์ระหว่างสมาคมการปฏิสัมพันธ์แบบดั้งเดิมและ Co มีจุดภายใต้สามประเภทที่แตกต่างกันของสมาคมจำกัด ทั้งการจำลองและการวิเคราะห์ข้อมูล สถิติที่ใช้จริงพบว่ามีสมรรถนะที่ดีกว่าเสนอ plspm SNP เดี่ยวตามแบบโลจิสติก , โลจิสติกโมเดลพื้นฐาน PCA และยีนอื่น ๆตามวิธีการ