Dry peptide mixtures were dissolved

Dry peptide mixtures were dissolved with 0.1% HCOOH and subjected to nano-LC-MS analysis using aC18 nanocolumn connected in-line with a QTOF2MSsystem (Micromass). The peptides were eluted in a linear gradient of 50% CH3CN,1%HCOOH. Analysis was performed by using the BioLynx package (Micromass), and database searches were performed with the Mascot package (Matrix Science) and BLAST. Partial sequencing of the peptides viaMS–MSwas used to construct the following degenerative primers: GAP 65 DGF (5-ATGATGGTNGAYTGGGGNT TY-3) and GAP 65 DGR (5-AARTANCCIGANGTRAARTG-3), used in a RT-PCR with gastrolith epithelial disk RNA. The entire GAP 65 sequence was obtained through rapid amplification of 5 and 3 cDNA ends (RACE; Clontech SMART RACE; BD Biosciences).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผสมเปปไทด์แห้งถูกละลาย 0.1% HCOOH และขึ้นอยู่กับนาโน-LC-MS วิเคราะห์ด้วย aC18 nanocolumn เชื่อมต่อในบรรทัด QTOF2MSsystem (Micromass) เปปไทด์ถูก eluted ในการไล่ระดับสีเชิงเส้น 50% CH3CN, 1% HCOOH ทำการวิเคราะห์ โดยใช้แพคเกจ BioLynx (Micromass), และค้นหาฐานข้อมูลดำเนินการกับแพคเกจมิ่งขวัญ (เมทริกซ์วิทยาศาสตร์) และระเบิด ลำดับบางส่วนของเปปไทด์ viaMS – MSwas ใช้ในการสร้างไพรเมอร์เสื่อมที่ต่อไปนี้: 65 ช่องว่าง DGF (5 - ATGATGGTNGAYTGGGGNT TY-3) และช่องว่าง 65 DGR (5 - AARTANCCIGANGTRAARTG-3), ใช้ใน RT-PCR ด้วย gastrolith เยื่อบุผิวดิสก์ RNA ลำดับ 65 ช่องว่างทั้งหมดที่ได้รับผ่านการขยายอย่างรวดเร็วของปลาย cDNA 5 และ 3 (การแข่งขัน การแข่งขันสมาร์ท Clontech ออก BD)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เปปไทด์ผสมแห้งละลายกับ 0.1% HCOOH และเป็นไป Nano-LC-MS วิเคราะห์โดยใช้ aC18 nanocolumn เชื่อมต่อในสายการผลิตที่มี QTOF2MSsystem (Micromass) เปปไทด์ที่ถูกชะในลาดเชิงเส้นของ 50% CH3CN, 1% HCOOH วิเคราะห์ได้ดำเนินการโดยใช้ชุด BioLynx (Micromass) และการค้นหาฐานข้อมูลได้รับการดำเนินการกับแพคเกจมิ่งขวัญ (Matrix วิทยาศาสตร์) และระเบิด ลำดับบางส่วนของเปปไทด์ viaMS-MSwas ใช้ในการสร้างไพรเมอร์ต่อไปนี้เสื่อม: GAP 65 DGF และ GAP 65 DGR, ใช้ใน RT-PCR ด้วย (5 -ATGATGGTNGAYTGGGGNT TY-3?) (5 -AARTANCCIGANGTRAARTG-3?) gastrolith RNA ดิสก์เยื่อบุผิว ทั้ง GAP 65 ลำดับที่ได้รับผ่านการขยายตัวอย่างรวดเร็วของ 5? และ 3 หรือไม่? ยีนปลาย (แข่ง; Clontech SMART RACE; BD ชีววิทยาศาสตร์)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผสมเปปไทด์แห้งละลายกับ 0.1% hcooh และภายใต้การวิเคราะห์โดยใช้นาโน LC MS ใน ac18 nanocolumn เชื่อมต่อกับ qtof2mssystem ( micromass ) โดยมีตัวอย่างในการไล่ระดับเส้นเปปไทด์ 50% ch3cn 1% hcooh . วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ biolynx แพคเกจ ( micromass ) , และการค้นหาในฐานข้อมูลได้ด้วยสำหรับแพคเกจ ( Matrix Science ) และระเบิด ลำดับบางส่วนของเปปไทด์ viams – mswas ใช้สร้างไพรเมอร์เสื่อมต่อไปนี้ : dgf 65 ( 5-atgatggtngaytggggnt ty-3 ช่องว่างและช่องว่าง ( DGR ) 65 5-aartanccigangtraartg-3 ) ที่ใช้ในวิธีที่มีกึ๋นบุดิสก์ RNA ช่องว่างทั้งหมด 65 ลำดับผ่านการขยายอย่างรวดเร็วของ 5 และ 3 cDNA Ends ( การแข่งขัน clontech สมาร์ทแข่ง ; BD BIOSCIENCES )