Data analysisAssuming that each RAP

Data analysis
Assuming that each RAPD band represents a single diallelic locus in Hardy–Weinberg (H–W) equilibrium, the p/a data set can be converted into allele frequencies (e.g. Apostol et al., 1996; Lu & Rank, 1996). However, because RAPDs behave as dominant markers (i.e. 1=AA or Aa and 0=aa), allele frequency estimates are less accurate than with codominant markers (Lynch & Milligan, 1994). Using the fraction of double-recessive genotypes (x) (i.e. band absence at a given locus), the biased frequency of the null allele is q=x1/2 and its unbiased estimate is given by eqn (2a) in Lynch & Milligan (1994).
Unbiased allele frequencies were calculated by hand and were subsequently entered into the program biosys-1 (Swofford & Selander, 1989) to compute heterozygosity levels (H). Unbiased H-values for the ith locus and jth population were obtained according to Lynch & Milligan (1994) (i.e. eqns 4a and 2b). However, because unbiased and biased allele frequencies and H estimates only differed very slightly (Table 1) and as the available software [ rapdfst (Apostol et al., 1996) and popgene v. 1.1 (Yeh & Boyle, 1996)] did not allow entering unbiased allele frequencies, all further analyses used biased allele frequency and H estimates.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวิเคราะห์ข้อมูลสมมติว่าแต่ละวงการอาร์เอพีดีแทนโลกัสโพล diallelic เดียวในสมดุล Hardy – Weinberg (H – W) ชุดข้อมูล p/a สามารถแปลงความถี่ของ allele (เช่น Apostol และ al., 1996 ลูและอันดับ 1996) อย่างไรก็ตาม เนื่องจาก RAPDs ที่ทำงานเป็นเครื่องหมายหลัก (เช่น 1 = AA หรือ Aa และ 0 = aa), ประเมินความถี่ของ allele ถูกต้องน้อยกว่า มีเครื่องหมาย codominant (Lynch และ Milligan, 1994) ใช้เศษของ double recessive (x) (เช่นวงขาดที่โลกัสโพลกำหนด), ความถี่ของ allele เป็น null biased เป็น q = x 1/2 และเป็นคนประเมินได้ โดย eqn (2a) ใน Lynch Milligan (1994)ความถี่ของ allele คนคำนวณด้วยมือ และได้มาป้อนลงในโปรแกรม biosys-1 (Swofford & Selander, 1989) การคำนวณระดับ heterozygosity (H) H-ค่าคนสำหรับระยะโลกัสโพลและ jth ประชากรได้รับตาม Lynch และ Milligan (1994) (เช่น eqns 4a และ 2b) อย่างไรก็ตาม เนื่องจากประเมินความถี่ของ allele คน และ biased และ H เท่านั้นแตกต่างเล็กน้อย (ตารางที่ 1) และ เป็นที่ที่มีซอฟต์แวร์ [rapdfst (Apostol et al., 1996) และ popgene v. 1.1 (Yeh และบอยล์ 1996)] ไม่อนุญาตการป้อนความถี่ของ allele คน การวิเคราะห์ทั้งหมดใช้ความถี่ของ biased allele และประเมิน H

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ข้อมูลสมมติว่าวง RAPD แต่ละแสดงให้เห็นถึงความเชื่ออำนาจ diallelic เดียวใน Hardy-Weinberg (H-W) สมดุลพี / ชุดข้อมูลที่สามารถแปลงเป็นความถี่อัลลีล (เช่น Apostol et al, 1996;. Lu & Rank, 1996) .
แต่เนื่องจาก RAPDs ประพฤติเครื่องหมายที่โดดเด่นเป็น (เช่น 1 = AA หรือ Aa และ 0 = AA) ประมาณการความถี่อัลลีลมีความถูกต้องน้อยกว่าที่มีเครื่องหมาย codominant (ลินช์และมัลลิแกน, 1994) การใช้ส่วนของยีนดับเบิลถอย (x) (เช่นกรณีที่ไม่มีวงดนตรีที่สถานที่ที่กำหนด) ความถี่ลำเอียงของอัลลีลเป็นโมฆะเป็นคิว = x1 / 2 และประมาณการที่เป็นกลางที่จะได้รับจากสมการ (2a) ในลินช์และมัลลิแกน ( 1994).
ความถี่อัลลีลเป็นกลางจะถูกคำนวณด้วยมือและต่อมาถูกป้อนเข้าสู่โปรแกรมไบโอ-1 (Swofford และ Selander, 1989) ในการคำนวณระดับ heterozygosity (H) เป็นกลาง H-ค่าสำหรับสถานที่ที่ i และจำนวนประชากรที่ได้รับ jth ตามลินช์และมัลลิแกน (1994) (เช่น eqns 4a และ 2b) แต่เนื่องจากความถี่อัลลีลที่เป็นกลางและลำเอียงและ H ประมาณการแตกต่างกันเพียงเล็กน้อย (ตารางที่ 1) และในขณะที่ซอฟแวร์ที่มีอยู่ [rapdfst (Apostol et al., 1996) และ popgene v. 1.1 (Yeh & บอยล์, 1996)] ไม่อนุญาตให้ เข้าความถี่อัลลีลที่เป็นกลางต่อทุกการวิเคราะห์ที่ใช้ความถี่อัลลีลลำเอียงและ H ประมาณการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข้อมูลสมมุติว่าแต่ละวงแสดงตนด้วย diallelic เดียวใน Hardy Weinberg ) ( H ) w ) P / สมดุล ชุดข้อมูลจะถูกเปลี่ยนให้เป็นความถี่ ( เช่นสาวกคนอื่นๆ et al . , 1996 ; ลู่&อันดับ , 1996 ) อย่างไรก็ตาม เนื่องจาก rapds ทำตัวเป็นเด่นเครื่องหมาย ( เช่น 1 = 0 = AA หรือ AA และ aa ) , ประมาณการความถี่อัลลีลจะน้อยกว่าที่ถูกต้องกว่ากับ codominant เครื่องหมาย& มิลลิแกน ( ลินช์ ,1994 ) การใช้เศษเสี้ยวของคู่ 1 พันธุ์ ( X ) ( เช่น วง ไม่มีที่ให้ความเชื่อ ) , ความถี่ของอัลลีลในลำเอียงคือ q = x1 / 2 และแบบประเมินให้โดย eqn ( 2A ) ใน ลินซ์ & มิลลิแกน ( 1994 ) .
ความถี่อัลลีลเป็นกลางคำนวณด้วยมือ และต่อมาเข้า เป็นโปรแกรม biosys-1 ( สวอฟฟอร์ด& selander , 1989 ) จะคำนวณเฉพาะที่ระดับ ( H )h-values เป็นกลางสำหรับ ith ความเชื่อและประชากร jth ได้ตามรุมประชาทัณฑ์& มิลลิแกน ( 1994 ) ( เช่น eqns 4A และ 2b ) อย่างไรก็ตาม เนื่องจากความถี่อัลลีลเป็นกลางและอคติและ H ประมาณเท่านั้นแตกต่างเล็กน้อย ( ตารางที่ 1 ) และเป็น rapdfst ซอฟต์แวร์ [ ใช้ได้ ( สาวกคนอื่นๆ et al . , 1996 ) และ popgene v . 1.1 ( Yeh &บอยล์ , 1996 ) ] ไม่อนุญาตให้ป้อนความถี่อัลลีลเป็นกลาง ,การวิเคราะห์เพิ่มเติมใช้อคติในความถี่และ H ประมาณการ