2.4. DGGE and phylogeny The 233 bp-

2.4. DGGE and phylogeny
The 233 bp-long pufM fragments from the water and sediment samples were separated in a 45-70% and 40-60% (w/v) denaturing gradient, respectively into a 0.8% (w/v) polyacrylamide gel. The electrophoresis was performed at 80 V, and 60 oC for 16 h. After electrophoresis, the polyacrylamide gel was stained using the SYBR Gold nucleic acid stain for 20 min. The images were detected and captured on a UV transilluminator. The pufM fragments were cut from the gel using Gel Cutting Tips (Cleaver Scientific, England) and re-amplified with the pufM forward and pufM750-AT-M13 primers. The PCR products were purified using the Gel/PCR DNA fragment extraction kit (Geneaid, Taiwan) according to the manufacturer's instructions and then sequenced with pufM750-AT-M13 as sequencing primers using the 1st BASE Laboratories Sdn Bhd (Malaysia) and were compared with the GenBank database in the NCBI website. Phylogenetic analysis was con structed by neighbor-joining using the free software MEGA 5.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.4. DGGE และส่วน เศษ pufM bp ยาว 233 จากตัวอย่างน้ำและตะกอนแยกตัว 45-70% และ 40-60% (w/v) denaturing ไล่ระดับสี ตามลำดับเป็น 0.8% (w/v) การตรวจสอบวิเคราะห์เจล อิการดำเนินการที่ 80 V และ 60 oC สำหรับ 16 ชม หลังจากอิ เจตรวจสอบวิเคราะห์ถูกย้อมโดยใช้สีย้อมกรดนิวคลีอิก SYBR ทอง 20 นาที ภาพถูกตรวจพบ และจับบนที่ transilluminator UV เศษ pufM ถูกตัดจากเจลใช้เจลหัวตัด (ปังตอวิทยาศาสตร์ อังกฤษ) และการขยาย ด้วย pufM ไปข้างหน้า และ pufM750-AT-M13 ไพรเมอร์ ผลิตภัณฑ์ PCR ได้บริสุทธิ์ใช้ชุดส่วนสกัดดีเอ็นเอ เจล/PCR (Geneaid ไต้หวัน) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต และจากนั้น เรียงลำดับกับ pufM750-AT-M13 เป็นไพรเมอร์ลำดับ 1 ฐานห้องปฏิบัติ Sdn Bhd (มาเลเซีย) ใช้ และเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลในเว็บไซต์ NCBI GenBank ผลวิเคราะห์แก้ไขปรับ structed โดยใช้ซอฟต์แวร์ฟรี 5 ล้านเพื่อนบ้านร่วม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.4 DGGE และเชื้อชาติ
233 BP-ยาวเศษ pufM จากน้ำและดินตะกอนตัวอย่างที่ถูกแยกออกจากกันใน 45-70% และ 40-60% (w / v) denaturing การไล่ระดับสีตามลำดับเป็น 0.8% (w / v) เจลอะคริเลต electrophoresis ได้ดำเนินการที่ 80 V และ 60 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 16 ชั่วโมง หลังจาก electrophoresis, เจลอะคริเลตที่ถูกย้อมสีโดยใช้ SYBR ทองกรดนิวคลีคราบสำหรับ 20 นาที ภาพที่ถูกตรวจพบและบันทึกบน transilluminator รังสียูวี เศษ pufM ถูกตัดออกจากเจลใช้เคล็ดลับการตัดเจล (Cleaver วิทยาศาสตร์อังกฤษ) และ re-ขยายกับ pufM ไปข้างหน้าและไพรเมอร์ pufM750-at-M13 ผลิตภัณฑ์ PCR บริสุทธิ์โดยใช้เจล / PCR ดีเอ็นเอชุดสกัดชิ้นส่วน (Geneaid ไต้หวัน) ตามคำแนะนำของผู้ผลิตแล้วติดใจกับ pufM750-at-M13 เป็นไพรเมอร์ลำดับโดยใช้วันที่ 1 ฐานห้องปฏิบัติการ Sdn Bhd (มาเลเซีย) และเมื่อเทียบกับ ฐานข้อมูล GenBank ในเว็บไซต์ NCBI วิเคราะห์ phylogenetic ถูก structed Con โดยเพื่อนบ้านเข้าใช้ซอฟต์แวร์ฟรี MEGA 5

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.4 . และการทดลองระบบเชื้อชาติส่วนที่ BP นาน pufm เศษจากน้ำและดินตะกอนแยกใน 45-70 ร้อยละ 40-60 % ( w / v ) ี่ไล่ระดับ ตามลำดับเป็น 0.8 % ( w / v ) โพลีอะคริลาไมด์เจล ส่วนวิธีทำที่ 80 V , และ 60 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 16 ชั่วโมง หลังจาก electrophoresis , polyacrylamide gel มีเปื้อนใช้ SYBR ทองกรดนิวคลีอิกคราบ 20 นาที ภาพที่ถูกตรวจพบและจับบน UV transilluminator . การ pufm ชิ้นส่วนถูกตัดออกจากเจล การใช้เจลเคล็ดลับตัด ( ปังตอ วิทยาศาสตร์ อังกฤษ ) และกำลังขยายกับ pufm ไปข้างหน้าและ pufm750-at-m13 รองพื้น ที่เพิ่มปริมาณบริสุทธิ์ใช้เจล / ชุดสกัดดีเอ็นเอชิ้นส่วนดีเอ็นเอ ( geneaid , ไต้หวัน ) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต จากนั้นทำการ pufm750-at-m13 เป็นลำดับด้วยไพรเมอร์โดยใช้ฐาน 1 ห้องปฏิบัติการ Sdn Bhd ( มาเลเซีย ) และเปรียบเทียบกับขนาดฐานข้อมูลในเว็บไซต์ ncbi . ซึ่งถูกต่อต้านจากการวิเคราะห์โดยเพื่อนบ้านร่วมโดยใช้ซอฟต์แวร์ฟรีร็อค 5