We propose an analytical substitute

We propose an analytical substitute to the geometrical construction that is commonly used in calculating the protein surface area that is accessible to the solvent. A statistical approach leads to an expression of accessible surface areas as a function of distances between pairs of atoms or of residues in the protein structure, assuming only that these atoms or residues are randomly distributed in space but not penetrating each other. This function gives good estimates of the accessible surface area and of the area buried in subunit contacts for a number of proteins. Its evaluation is very fast, and the function can be differentiated, which opens the way to new applications of accessibility measurements in the study of proteins. As an example, we show that the presence of domains is easily detected by an automatic procedure based on surface areas only.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราเสนอทดแทนการวิเคราะห์เพื่อการก่อสร้าง geometrical ที่ใช้ทั่วไปในการคำนวณพื้นที่ผิวโปรตีนที่สามารถเข้าถึงตัวทำละลาย วิธีการทางสถิตินำไปสู่ค่าของพื้นผิวต่าง ๆ เข้าเป็นฟังก์ชันของระยะทางระหว่างคู่อะตอม หรือตกค้างในโครงสร้างของโปรตีน โดยเฉพาะที่อะตอมหรือตกค้างเหล่านี้จะสุ่มกระจายในพื้นที่ แต่ไม่เจาะกัน ฟังก์ชันนี้ช่วยให้ประเมินได้ดีสามารถเข้าถึงพื้นที่ และบริเวณที่ฝังอยู่ในติดต่อย่อยจำนวนโปรตีน การประเมินเป็นอย่างรวดเร็ว และสามารถ แยกแยะฟังก์ชัน ซึ่งเปิดไปโปรแกรมใหม่ถึงวัดในการศึกษาของวิลเลียม เป็นตัวอย่าง เราแสดงว่า สถานะของโดเมนได้พบ โดยกระบวนการโดยอัตโนมัติตามพื้นผิวต่าง ๆ เท่านั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เรานำเสนอการวิเคราะห์แทนการก่อสร้างทางเรขาคณิตที่เป็นที่นิยมใช้ในการคำนวณโปรตีนพื้นที่ผิวที่สามารถเข้าถึงตัวทำละลาย วิธีการทางสถิติที่นำไปสู่​​การแสดงออกของพื้นที่ผิวที่สามารถเข้าถึงได้เป็นฟังก์ชันของระยะทางระหว่างคู่ของอะตอมหรือตกค้างในโครงสร้างโปรตีนสมมติเท่านั้นที่อะตอมเหล่านี้หรือสารตกค้างที่มีการกระจายแบบสุ่มในพื้นที่ แต่ไม่ทะลุกัน ฟังก์ชั่นนี้จะช่วยให้การประเมินที่ดีของพื้นที่ผิวที่สามารถเข้าถึงและพื้นที่ฝังอยู่ในรายชื่อของหน่วยย่อยสำหรับจำนวนของโปรตีน การประเมินผลของมันมีความรวดเร็วและการทำงานจะแตกต่างซึ่งจะเปิดทางไปสู่​​การใช้งานใหม่ของการวัดการเข้าถึงในการศึกษาของโปรตีน เป็นตัวอย่างที่เราแสดงให้เห็นว่าการปรากฏตัวของโดเมนที่มีการตรวจพบได้อย่างง่ายดายด้วยขั้นตอนโดยอัตโนมัติขึ้นอยู่กับพื้นที่ผิวเท่านั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราเสนอแทนการวิเคราะห์การก่อสร้างทางเรขาคณิตที่ใช้กันทั่วไปในการคำนวณพื้นที่ผิวโปรตีนที่สามารถเข้าถึงได้ในตัวทำละลาย เป็นวิธีการทางสถิติที่จะนำไปสู่การแสดงออกของพื้นที่ผิวได้เป็นฟังก์ชันของระยะทางระหว่างคู่ของอะตอม หรือ ของที่ตกค้างอยู่ในโครงสร้างโปรตีนสมมติว่าอะตอมเหล่านี้หรือตกค้างจะกระจายแบบสุ่มในพื้นที่ แต่ไม่เจาะแต่ละอื่น ๆ ฟังก์ชันนี้จะช่วยให้การประมาณการที่ดีของพื้นที่ที่สามารถเข้าถึงได้ และบริเวณที่ฝังอยู่ในรายชื่อหน่วยย่อยสำหรับจำนวนของโปรตีน ประเมินเป็นไปอย่างรวดเร็วมาก และฟังก์ชั่นต่างๆ ได้ ,ซึ่งจะเปิดเส้นทางใหม่การประยุกต์ใช้การวัดการเข้าถึงการศึกษาของวิลเลียม ตัวอย่าง เราแสดงให้เห็นว่า สถานะของโดเมนจะถูกตรวจพบได้อย่างง่ายดายโดยกระบวนการอัตโนมัติขึ้นอยู่กับพื้นที่ผิวเท่านั้น