The dramatic transformation of the

The dramatic transformation of the Zika virus (ZIKV) from a relatively unknown
virus to a pathogen generating global-wide panic has exposed the dearth of
detailed knowledge about this virus Decades of research in the related Dengue
virus (DENV), finally culminating in a vaccine registered for use in endemic
regions (CYD-TDV), provides key insights in developing strategies for tackling
ZIKV. The previously established MEPP methodology compares two
conformations of the same protein and identifies residues with significant
spatial and electrostatic perturbations. In the current work, MEPP analyzed the
pre-and post-fusion DENV type 2 envelope (E) protein, and identified several
known epitopes (His317, Tyr299, Glu26, Arg188, etc.) (MEPPitope). These
residues are overwhelmingly conserved in ZIKV and all DENV serotypes.
Characterization of α-helices in E-proteins show that α1 is not conserved in the
sequence space of ZIKV and DENV. Furthermore, perturbation of α1 in the
post-fusion DENV structure includes a known epitope Asp215, a residue
absent in the pre-fusion α1. A cationic β-sheet in the GAG-binding domain that
is stereochemically equivalent in ZIKV and all DENV serotypes is also
highlighted due to a residue pair (Arg286-Arg288) that has a significant
electrostatic polarity reversal upon fusion. Finally, two highly conserved
residues (Thr32 and Thr40), with little emphasis in existing literature, are found
to have significant electrostatic perturbation. Thus, a combination of different
computational methods enable the rapid and rational detection of critical
residues that can be made the target of small drugs, or as epitopes in the
search for an elusive therapy or vaccine that neutralizes multiple members of
the Flaviviridae family.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การเปลี่ยนแปลงอย่างมากของภาค (ZIKV) จากค่อนข้างรู้จักไวรัสกับเชื้อโรคที่ผลิตทั่วโลกตื่นตระหนกได้สัมผัสกับการขาดแคลนของความรู้เกี่ยวกับไวรัสนี้งานวิจัยในไข้เลือดออกที่เกี่ยวข้องไวรัส (DENV), สูงสุดสุด ในวัคซีนลงทะเบียนสำหรับใช้ในเฉพาะถิ่นภูมิภาค (CYD TDV), ให้ข้อมูลเชิงลึกที่สำคัญในการพัฒนากลยุทธ์ในการแก้ปัญหาZIKV เปรียบเทียบวิธี MEPP ผลดีสองconformations ของโปรตีนเดียว และระบุตกค้างกับอย่างมีนัยสำคัญชิ้นเชิงพื้นที่ และไฟฟ้าสถิต ในการทำงานปัจจุบัน MEPP วิเคราะห์การก่อน- และหลังฟิวชั่น DENV ชนิดโปรตีนซองจดหมาย (E) 2 ระบุหลายรู้จัก epitopes (His317, Tyr299, Glu26, Arg188 ฯลฯ) (MEPPitope) เหล่านี้ตกค้างเป็นแบบแอคทีฟอยู่ใน ZIKV และทั้งหมด DENV serotypesแสดงสมบัติของα helices ในโปรตีน E αเปรี้ยว 1 ที่ไม่มีอยู่ในตัวลำดับพื้นที่ ZIKV และ DENV นอกจากนี้ perturbation ของαเปรี้ยว 1 ในการโครงสร้าง DENV ฟิวชั่นหลังมี epitope ที่รู้จักกันเป็น Asp215 มีสารตกค้างในαเปรี้ยว 1 ฟิวชั่นล่วงหน้า Βแผ่น cationic ในโดปิดปากผูกที่stereochemically เท่ากับ ZIKV และทั้งหมด DENV serotypes ยังเป็นเน้นคู่ตกค้าง (Arg286 Arg288) ที่มีความสำคัญเนื่องจากกลับขั้วไฟฟ้าสถิตเมื่อฟิวชั่น ในที่สุด สองสูงอนุรักษ์พบการตกค้าง (Thr32 และ Thr40), กับน้อยในวรรณคดีที่มีอยู่มี perturbation ไฟฟ้าสถิตที่สำคัญ ดังนั้น การรวมกันของแตกต่างกันวิธีการคำนวณเปิดใช้งานการตรวจสอบอย่างรวดเร็ว และมีเหตุผลความสำคัญตกค้างที่สามารถทำเป้าหมาย ของยาเล็ก หรือ เป็น epitopes ใน การค้นหาให้ยากรักษาหรือวัคซีนที่เป็นกลางสมาชิกหลายตัวของครอบครัว Flaviviridae

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การเปลี่ยนแปลงที่น่าทึ่งของไวรัส Zika (ZIKV) จากความไม่รู้จัก
ไวรัสเชื้อโรคสร้างโลกกว้างตื่นตระหนกได้สัมผัสความขาดแคลนของ
ความรู้รายละเอียดเกี่ยวกับเรื่องนี้ทศวรรษไวรัสของการวิจัยในไข้เลือดออกที่เกี่ยวข้อง
ไวรัส (DENV) ในที่สุดก็ปิดท้ายด้วยการฉีดวัคซีน การลงทะเบียนสำหรับการใช้งานในถิ่น
ภูมิภาค (CYD-TDV) ให้ข้อมูลเชิงลึกที่สำคัญในการพัฒนากลยุทธ์สำหรับการแก้ปัญหา
ZIKV ที่จัดตั้งขึ้นก่อนหน้านี้ MEPP วิธีการเปรียบเทียบสอง
conformations ของโปรตีนเดียวกันและระบุตกค้างอย่างมีนัยสำคัญ
เยี่ยงอย่างเชิงพื้นที่และไฟฟ้าสถิต ในการทำงานในปัจจุบัน MEPP วิเคราะห์
ก่อนและหลังฟิวชั่นประเภท DENV 2 ซอง (E) โปรตีนและระบุหลาย
epitopes ที่รู้จักกัน (His317, Tyr299, Glu26, Arg188 ฯลฯ ) (MEPPitope) เหล่านี้
ตกค้างป่าสงวนขาดลอยใน ZIKV และทุกสายพันธุ์ DENV.
ลักษณะของαเอนริเก้ใน E-โปรตีนแสดงให้เห็นว่าα1ไม่ได้รับการอนุรักษ์ใน
พื้นที่ลำดับของ ZIKV และ DENV นอกจากนี้การก่อกวนของα1ใน
โครงสร้างการโพสต์ฟิวชั่น DENV รวมถึงเป็นที่รู้จักกัน epitope Asp215, กาก
ขาดในα1ล่วงหน้าฟิวชั่น ประจุบวกβแผ่นในโดเมนปิดปากผูกที่
เป็น stereochemically เทียบเท่า ZIKV และทุกสายพันธุ์ DENV นอกจากนี้ยังมี
ไฮไลต์เนื่องจากคู่ตกค้าง (Arg286-Arg288) ที่มีอย่างมีนัยสำคัญ
สลับขั้วไฟฟ้าสถิตเมื่อฟิวชั่น ในที่สุดทั้งสองป่าสงวน
ตกค้าง (Thr32 และ Thr40) โดยเน้นเล็ก ๆ น้อย ๆ ในวรรณคดีที่มีอยู่จะพบว่า
จะมีการก่อกวนไฟฟ้าสถิตอย่างมีนัยสำคัญ ดังนั้นการรวมกันของที่แตกต่างกัน
วิธีการคำนวณเปิดใช้งานการตรวจสอบอย่างรวดเร็วและมีเหตุผลที่สำคัญของ
สารตกค้างที่สามารถทำเป้าหมายของยาเสพติดที่มีขนาดเล็กหรือเป็น epitopes ใน
การค้นหาสำหรับการรักษาที่เข้าใจยากหรือวัคซีนที่เป็นกลางหลายสมาชิกของ
ครอบครัว Flaviviridae

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การเปลี่ยนแปลงที่น่าทึ่งของไวรัส zika ( zikv ) จากที่ไม่รู้จักค่อนข้างไวรัสเชื้อโรคสร้างความตื่นตระหนกมากมายทั่วโลกได้สัมผัสขาดแคลนรายละเอียดความรู้เกี่ยวกับไวรัสนี้ทศวรรษของการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับโรคไข้เลือดออกไวรัส ( denv ) ในที่สุด culminating ในวัคซีนที่ลงทะเบียนเพื่อใช้ในโรคภูมิภาค ( cyd-tdv ) ให้ข้อมูลเชิงลึกที่สำคัญในการพัฒนากลยุทธ์สำหรับการแก้ปัญหาzikv . ที่จัดตั้งขึ้นก่อนหน้านี้ mepp วิธีการเปรียบเทียบสองโครงสร้างของโปรตีนเดียวกันและระบุตกค้างมาก )อวกาศและไฟฟ้าสถิตได้ . ในงานปัจจุบัน mepp วิเคราะห์ก่อนและหลังการ denv ประเภท 2 ซอง ( E ) โปรตีน และระบุว่าหลาย ๆรู้จักจาก ( his317 tyr299 glu26 arg188 , , , , ฯลฯ ) ( meppitope ) เหล่านี้ตกค้างอยู่ใน zikv ขาดลอย และอนุรักษ์ภูมิ denv ทั้งหมดลักษณะสมบัติของแอลฟา helices ใน e-proteins แสดงให้เห็นว่าα 1 ไม่ใช่ป่าสงวน ในพื้นที่และลำดับของ zikv denv . นอกจากนี้ ความยุ่งเหยิงของα 1 ในโครงสร้างการโพสต์ denv รวมถึงรู้จักไวรัส asp215 , กากไม่อยู่ในการ Pre α 1 บีตา - แผ่นประจุบวกใน Gag ผูกโดเมนเป็น stereochemically เทียบเท่าใน zikv ( denv ทั้งหมด นอกจากนี้ยังมีและเน้นเนื่องจากสารตกค้างคู่ ( arg286-arg288 ) ที่ได้พบไฟฟ้าสถิตขั้วกลับเมื่อฟิวชั่น ในที่สุด สองอย่างอนุรักษ์( thr32 ตกค้าง และ thr40 ) ที่มีความสำคัญน้อยในวรรณกรรมที่มีอยู่ พบว่ามีความยุ่งเหยิงสถิตที่สำคัญ ดังนั้นการรวมกันของต่าง ๆวิธีการคำนวณการตรวจจับอย่างรวดเร็วและการวิจารณ์ตกค้างที่สามารถทำให้เป้าหมายของยาขนาดเล็ก หรือ เป็นจากในค้นหาที่เข้าใจยาก การรักษาหรือวัคซีนที่เป็นกลาง สมาชิกหลาย ๆครอบครัว flaviviridae .