Alkaliphilic strains characterized

Alkaliphilic strains characterized by optimal growth at pH 9.0 and 5% (w/v) NaCl designated
K1-25T and H3-93 were isolated from extremely shallow soda ponds located in Hungary. Cells of
both strains were Gram-stain-positive, non-motile, straight rods and formed central, ellipsoidal
endospores with swollen sporangia. The isolates were aerobic, catalase-positive, oxidasenegative
and contained a peptidoglycan of type A1c based on meso-diaminopimelic acid. In both
strains, menaquinone-7 (MK-7) was the predominant isoprenoid quinone and the major cellular
fatty acids were anteiso-C15 : 0 and iso-C15 : 0. The DNA G+C contents of strains K1-25T and
H3-93 were 39.0 and 36.3 mol%, respectively. 16S rRNA gene sequence-based phylogenetic
analysis revealed 99.2% similarity between strains K1-25T and H3-93 and the novel isolates had
the highest similarities to Bacillus akibai 1139T (97.8 and 98.3 %, respectively), Bacillus
wakoensis N-1T (97.0 and 97.4 %), Bacillus okhensis Kh10-101T (97.1 and 97.4 %) and
Bacillus krulwichiae AM31DT (96.9 and 97.1 %). DNA–DNA hybridization between our strains
and the type strains of closely related Bacillus species was lower than 70 %. Although DNA–DNA
hybridization between strains K1-25T and H3-93 was 27 %, the phenotypic and chemotaxonomic
data did not support the differentiation of these two strains into separate species. Therefore, they
represent genomovars of a novel species, for which the name Bacillus alkalisediminis sp. nov. is
proposed. The type strain is K1-25T (5DSM 21670T 5NCAIM B02301T).
Several obligately and facultatively alkaliphilic Bacillus
species have been isolated since Vedder (1934) described
the species Bacillus alcalophilus, the first reported aerobic,
alkaliphilic, Gram-positive, endospore-forming bacterium.
In recent years, studies of alkaliphilic Bacillus strains have
increased greatly not only to examine their taxonomy and
physiology but because of their potential industrial
applications resulting from the production of alkalineactive
enzymes (Horikoshi, 1999; Nogi et al., 2005).
Alkaliphilic Bacillus species show very different NaCl
requirements; halotolerant to halophilic species have been
reported from very different origins (e.g. Nielsen et al.,
1995; Fritze, 1996; Yumoto et al., 2003, 2005; Nowlan et al.,
2006; Wang et al., 2007). The water and sediment of soda
lakes across the world harbour a wide phylogenetic
diversity of both alkaliphilic and halophilic micro-organisms,
including isolates related to various species of
Bacillus. In the last few years, many novel alkaliphilic and
halophilic or halotolerant Bacillus species have been
described, e.g. Bacillus arseniciselenatis and B. selenitireducens
from Mono Lake, CA, USA (Switzer Blum et al., 1998),
Bacillus bogoriensis from Bogoria soda lake in Kenya
(Vargas et al., 2005), Bacillus chagannorensis from Lake
Chagannor, in the Inner Mongolia Autonomous Region,
China (Carrasco et al., 2007), and Bacillus aurantiacus from
soda ponds in the Kiskunsa´g National Park, Hungary
(Borsodi et al., 2008). It seems that alkaliphilic and
halophilic Bacillus species described from very similar
The GenBank/EMBL/DDBJ accession numbers for the 16S rRNA gene
sequences of strains K1-25T and H3-93 are AJ606037 and
AM051268, respectively.
Three supplementary figures are available with the online version of this
paper.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2011), 61, 1880–1886 DOI 10.1099/ijs.0.019489-0
1880 019489

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สายพันธุ์ alkaliphilic ลักษณะการเจริญเติบโตที่ดีที่สุดที่พีเอช 9.0 และ 5% (w / v) โซเดียมคลอไรด์ที่ได้รับมอบหมาย
k1-25t และ h3-93 ที่แยกได้จากบ่อโซดาตื้นมากตั้งอยู่ในฮังการี เซลล์ของ
สายพันธุ์ทั้งสอง-คราบบวกกรัม, ไม่ใช่เคลื่อนที่แท่งตรงและเกิดขึ้นกลางรูปวงรี
เอนโดสปออับสปอร์ที่มีการบวม สายพันธุ์ที่มีแอโรบิก, catalase บวก oxidasenegative
และมี peptidoglycan ประเภท A1C อยู่บนพื้นฐานของกรด Meso-diaminopimelic ทั้งในสายพันธุ์
, menaquinone-7 (mk-7) เป็น quinone isoprenoid เด่นและโทรศัพท์มือถือ
กรดไขมันที่สำคัญสรุปได้ anteiso-c15: 0 และ iso-c15: 0 เนื้อหา dna GC สายพันธุ์ k1-25t และ
h3-93 เป็น 39.0 และ 36.3 โมเลกุล% ตามลำดับ ยีน 16s rRNA ลำดับตามสายวิวัฒนาการ
วิเคราะห์เผย 992% ความคล้ายคลึงกันระหว่างสายพันธุ์ k1-25t และ h3-93 และนวนิยายแยกมี
ความคล้ายคลึงกันมากไปบาซิลลัส 1139t akibai (97.8 และ 98.3% ตามลำดับ) บาซิลลัส
wakoensis n-1t (97.0 และ 97.4%) kh10 บาซิลลัส okhensis -101t (97.1 และ 97.4%) และบาซิลลัส
krulwichiae am31dt (96.9 และ 97.1%) พันธุ์ dna-dna ระหว่างสายพันธุ์ของเรา
และชนิดของสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิดบาซิลลัสต่ำกว่า 70% แม้ว่า dna-dna
การผสมข้ามพันธุ์ระหว่างสายพันธุ์ k1-25t และ h3-93 เป็น 27%, ฟีโนไทป์และเคมี
ข้อมูลไม่สนับสนุนความแตกต่างของทั้งสองสายพันธุ์เป็นสายพันธุ์ที่แยกจากกัน ดังนั้นพวกเขาเป็นตัวแทนของ
genomovars ของสปีชีส์ใหม่ที่ชื่อบาซิลลัส alkalisediminis เอสพี พฤศจิกายน เป็น
เสนอสายพันธุ์ชนิดเป็น k1-25t (5dsm 21670t 5ncaim b02301t).
หลาย obligately และ alkaliphilic facultatively บาซิลลัส
สายพันธุ์ได้รับการแยกออกตั้งแต่เว็ด (1934) อธิบาย
alcalophilus บาซิลลัสชนิดแรกที่มีการรายงานแอโรบิก
alkaliphilic กรัมบวก endospore ขึ้นรูปแบคทีเรีย.
ในปีที่ผ่านมาการศึกษาของสายพันธุ์บาซิลลัส alkaliphilic มี
เพิ่มขึ้นอย่างมากไม่เพียง แต่จะตรวจสอบอนุกรมวิธานและสรีรวิทยา
ของพวกเขา แต่เป็นเพราะอุตสาหกรรม
การใช้งานที่มีศักยภาพของพวกเขาที่เกิดจากการผลิตของเอนไซม์ alkalineactive
(Horikoshi, 1999;. Nogi et al, 2005).
alkaliphilic ชนิดบาซิลลัสแสดง nacl
ความต้องการที่แตกต่างกันมาก ; สายพันธุ์ทนเค็มที่ชอบเกลือได้รับการ
รายงานจากต้นกำเนิดที่แตกต่างกันมาก (เช่น nielsen และคณะ, 1995
.Fritze 1996. Yumoto และคณะ, 2003, 2005. NOWLAN et al,,
2006. วัง et al, 2007) น้ำและตะกอนของโซดา
ทะเลสาบทั่วโลกท่าเรือสายวิวัฒนาการ
ความหลากหลายกว้างของทั้งสอง alkaliphilic และชอบเกลือจุลินทรีย์
รวมทั้งสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ต่างๆของ
บาซิลลัส ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมาจำนวนมากและนวนิยาย alkaliphilic
ชอบเกลือหรือทนเค็มสายพันธุ์บาซิลลัสได้รับ
อธิบายเช่น arseniciselenatis บาซิลลัสและข selenitireducens
จากทะเลสาบโมโนแคลิฟอร์เนีย, usa (สวิตเซอร์บลัมและอัล., 1998),
บาซิลลัส bogoriensis จาก Bogoria ทะเลสาบโซดาในเคนยา
(vargas และคณะ. 2005), บาซิลลัส chagannorensis จากทะเลสาบ
chagannor ในปกครองตนเองมองโกเลีย ภูมิภาค
จีน (Carrasco et al,. 2007) และบาซิลลัส aurantiacus
โซดาจากบ่อในสวนสาธารณะแห่งชาติ kiskunsa'g, ฮังการี
(Borsodi และคณะ. 2008) ดูเหมือนว่า alkaliphilic และ
สายพันธุ์บาซิลลัสชอบเกลือจากที่อธิบายคล้ายกันมาก
genbank / EMBL / ddbj เข้าหมายเลข 16s ยีน rrna
ลำดับของสายพันธุ์ k1-25t และ h3-93 เป็น aj606037 และ
am051268 ตามลำดับ.
สามตัวเลขเสริม จะสามารถใช้ได้กับรุ่นออนไลน์ของกระดาษนี้
.
วารสารนานาชาติของระบบและจุลชีววิทยาวิวัฒนาการ (2011), 61, 1880-1886 ดอย 10.1099/ijs.0.019489-0
1880 019489

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สายพันธุ์ Alkaliphilic ลักษณะเจริญเติบโตดีที่สุดที่ pH 9.0 และ 5% (w/v) NaCl กำหนด
K1-25T และ H3-93 ถูกแยกจากบ่อน้ำตื้นมากโซดาในฮังการี เซลล์ของ
ทั้งสองสายพันธุ์มีก้านเป็น บวกคราบกรัม ไม่ใช่ motile ตรง และเกิดขึ้นกลาง ellipsoidal
endospores กับ sporangia บวม Isolates การได้เต้นแอโรบิก catalase- บวก oxidasenegative
และประกอบด้วยเปบทิโดไกลแคนชนิด A1c ตามกรดเมโสหน้า diaminopimelic ทั้ง
สายพันธุ์ menaquinone-7 (MK-7) เป็น quinone isoprenoid กันและมือถือหลัก
กรดไขมันได้ anteiso-C15: 0 และ iso-C15: 0. เนื้อหา C G ดีเอ็นเอของสายพันธุ์ K1-25T และ
H3-93 มีการ 39.0 และโมล 36.3% ตามลำดับ 16S rRNA ยีนตามลำดับ phylogenetic
99 เปิดเผยวิเคราะห์2% ความคล้ายระหว่าง strains K1 25T และ H3-93 และ isolates นวนิยายมี
ความเหมือนสูงสุดเพื่อคัด akibai 1139T (97.8 และ 98.3% ตามลำดับ), คัด
wakoensis N-1T (97.0 และ 97.4%), คัด okhensis Kh10 101T (97.1 และ 97.4%) และ
คัด krulwichiae AM31DT (96.9 และ 97.1%) DNA–DNA hybridization ระหว่างสายพันธุ์ของเรา
และสายพันธุ์ชนิดพันธุ์คัดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดไม่ต่ำกว่า 70% แม้ว่า DNA–DNA
hybridization ระหว่างสายพันธุ์ K1-25T H3-93 ได้ 27% ไทป์ และ chemotaxonomic
ข้อมูลไม่ได้สนับสนุนการสร้างความแตกต่างของสายพันธุ์ที่สองเหล่านี้เป็นสายพันธุ์ที่แยก ดังนั้น พวกเขา
แทน genomovars พันธุ์นวนิยาย ที่ชื่อคัด alkalisediminis sp. nov เป็น
เสนอ K1-25T (5DSM 21670T 5NCAIM B02301T) เป็นชนิดพันธุ์
หลาย obligately และ facultatively alkaliphilic คัด
ชนิดได้แยกตั้งแต่ Vedder (1934) อธิบาย
พันธุ์คัด alcalophilus แรกรายงานแอโรบิก,
alkaliphilic แบคทีเรียแกรมบวก ขึ้น รูป endospore แบคทีเรีย.
ในปีที่ผ่านมา มีการศึกษาสายพันธุ์คัด alkaliphilic
เพิ่มขึ้นอย่างมากไม่เพียงแต่การตรวจสอบระบบของพวกเขา และ
สรีรวิทยาแต่เนื่อง จากอุตสาหกรรมของพวกเขามีศักยภาพ
โปรแกรมประยุกต์ที่เกิดจากการผลิตของ alkalineactive
เอนไซม์ (โฮะริโคะชิ 1999 Nogi et al., 2005) .
Alkaliphilic คัดพันธุ์แสดง NaCl แตกต่างกันมาก
ความต้องการ การทนเกลือเพื่อใช้กับพันธุ์ที่ชอบเกลือ
รายงานจากต้นกำเนิดที่แตกต่างกันมาก (เช่นนีลเอ็ด al.,
1995 Fritze, 1996 ยูโมโตะและ al., 2003, 2005 Nowlan et al.,
2006 วัง et al., 2007) น้ำและตะกอนของโซดา
ทะเลสาบทั่วโลกฮาร์เบอร์ phylogenetic กว้าง
หลากหลาย alkaliphilic และไมโครชอบเกลือชีวิต,
รวม isolates กับพันธุ์ต่าง ๆ
คัด ในไม่กี่ปี alkaliphilic ในนวนิยาย และ
ชอบเกลือ หรือทนเกลือเพื่อใช้คัดพันธุ์ได้
อธิบาย เช่นคัด arseniciselenatis และ selenitireducens เกิด
จากทะเลสาบโมโน CA, USA (Switzer สุ่มและ al., 1998),
bogoriensis คัดจากโซดา Bogoria ในเคนยา
(วาร์ et al., 2005), chagannorensis คัดจาก
Chagannor ในภูมิภาคปกครองตนเองมองโกเลียใน,
จีน (Carrasco et al., 2007), และ aurantiacus คัดจาก
บ่อโซดา Kiskunsa´g อุทยานแห่งชาติ ฮังการี
(Borsodi et al., 2008) เหมือนที่ alkaliphilic และ
ชอบเกลือคัดพันธุ์อธิบายจากคล้าย
GenBank/EMBL/DDBJ หมายเลขทะเบียน 16S rRNA ยีน
ลำดับสายพันธุ์ K1-25T และ H3-93 มี AJ606037 และ
AM051268 ตามลำดับ.
เสริมเลขสามอยู่รุ่นออนไลน์
กระดาษ
สมุดรายวันระบบ และวิวัฒนาการจุล (2011), 61, 1880–1886 ดอย 10.1099/ijs.0.019489-0
1880 019489 นานาชาติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

alkaliphilic พันธุ์โดยการขยายตัวได้ดีที่สุดที่ pH 9.0 และ 5% ( v w /) NaCl ที่กำหนด
K 1-25 T และ H 3-93 ก็ถูกแยกออกจากบ่อโซดาน้ำตื้นเป็นอย่างมากตั้งอยู่ในประเทศฮังการี เซลล์ในด้านพันธุ์
ทั้งสองเป็นก้านตรงไม่ใช่ - motile กรัม - ทำให้เกิดรอยด่างบน - ในทางบวกและจัดตั้งศูนย์กลาง ellipsoidal
endospores ด้วย sporangia บวม แยกเป็นแอโรบิก catalase - บวก oxidasenegative
ตามมาตรฐานและที่อยู่ C peptidoglycan ของ ประเภท ที่ 1 ที่ใช้น้ำกรด meso - diaminopimelic ใน
พันธุ์ทั้ง menaquinone - 7 ( MK - 7 )เป็น quinone isoprenoid ความโดดเด่นและกรดไขมันโอเซลลูลาร์
หลักคือ anteiso - C 150 และมาตรฐาน ISO - C 150 . ดีเอ็นเอ G C เนื้อหาของพันธุ์ K 1-25 T และ
H 3-93 เป็น 39.0 และ Website : www . mol ขนาดพื้นที่ 36.3% ตามลำดับ การวิเคราะห์ phylogenetic
ซึ่งใช้ 16 S rrna ยีนเปิดเผยว่า 992% อย่างเดียวกันระหว่างพันธุ์ K 1-25 T และ H 3-93 และที่แปลกแยกมี
ซึ่งจะช่วยให้ความคล้ายคลึงกับเชื้อ akibai 1139 T ( 97.8 และ 98.3% ตามลำดับ),เชื้อ
wakoensis n - 1 T ( 97.0 และ 97.4% ),เชื้อ okhensis KH 10-101 T ( 97.1 และ 97.4% )และ
เชื้อ krulwichiae เช้า 31 DT ( 96.9 และ 97.1% ) hybridization ดีเอ็นเอ - ดีเอ็นเอระหว่างพันธุ์
ตามมาตรฐานของเราและพันธุ์ ประเภท ของสายพันธุ์เชื้ออย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องอยู่ในระดับต่ำกว่า 70% . แม้ว่าดีเอ็นเอ - ดีเอ็นเอ
hybridization ระหว่างพันธุ์ K 1-25 T และ H 3-93 เป็น 27% ข้อมูล phenotypic และ chemotaxonomic
ไม่ได้การสนับสนุนความแตกต่างของสองพันธุ์นี้เข้าไปในสายพันธุ์แบบแยกพื้นที่ ดังนั้นพวกเขา
ซึ่งจะช่วยเป็นตัวแทน genomovars ของสายพันธุ์ใหม่ที่เชื้อชื่อ alkalisediminis sp .พ.ย.)มี
เสนอให้พิมพ์ความเมื่อยล้ามี K 1-25 T ( 5 dsm 21670 T 5 ncaim B 02301 T )..
หลาย obligately และ facultatively alkaliphilic เชื้อ
สายพันธุ์ที่มีการแยกออกมาคลัสเวดเดอร์( 1934 )อธิบายไว้
ที่สายพันธุ์เชื้อ alcalophilus ,ที่เป็นครั้งแรกรายงานแอโรบิก,
alkaliphilic ,กรัมบวก, endospore - สร้างแบคทีเรีย.
มาเป็นเวลาหลายปี,การศึกษา alkaliphilic เชื้อพันธุ์มี
เพิ่มขึ้นอย่างมากไม่เพียงเฉพาะในการตรวจสอบของตน Taxonomy ,และ
สรีรศาสตร์แต่เป็นเพราะเขามี ศักยภาพ อุตสาหกรรม
ซึ่งจะช่วยส่งผลให้แอปพลิเคชันจากการผลิตของ alkalineactive
เอ็นไซม์( horikoshi , 1999 ,นายพลโน - กิ et al ., 2005 )..
alkaliphilic เชื้อพันธุ์แสดงที่แตกต่างอย่างมาก NaCl
ข้อกำหนด; halotolerant เพื่อ halophilic สายพันธุ์ที่มีการรายงานว่า
จากที่แตกต่างอย่างมากแหล่งกำเนิด(เช่น นีลเซ่น et al . N 1995fritze , 1996 ; Yumoto Station et al ., 2003 , 2005 , nowlan et al .,
2006 ;วัง et al ., 2007 ) ตะกอนและน้ำของ Harbor โซดา
ทะเลสาบในโลกที่กว้าง phylogenetic
ซึ่งจะช่วยความหลากหลายของทั้ง alkaliphilic halophilic และ Micro - สิ่งมีชีวิต
รวมถึงแยกที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ที่หลากหลายของ
เชื้อ. ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมาสายพันธุ์ alkaliphilic นวนิยายและ
halophilic หรือเชื้อ halotolerant จำนวนมากได้รับการตอบแทน
ตามที่อธิบายไว้,เช่นเชื้อ arseniciselenatis และพ. selenitireducens
จากโมโน Lake , CA ,สหรัฐอเมริกา( switzer รายคือ Blum Capital et al ., 1998 ),
เชื้อ bogoriensis จาก bogoria โซดา Lake ในประเทศเคนยา
(ชาวเป et al ., 2005 ),เชื้อ chagannorensis จากทะเลสาบ
chagannor ,ในมองโกเลียในเขตพื้นที่,
จีน( Carrasco et al ., 2007 ),และเชื้อ aurantiacus จาก
โซดาสระน้ำใน kiskunsa ' G National Park ,ฮังการี
( borsodi et al . 2008 ) ดูเหมือนกับว่า alkaliphilic และ
halophilic เชื้อพันธุ์ไม้ตามที่อธิบายไว้จากความคล้ายคลึงกันมาก
ซึ่งจะช่วยให้เลี้ยงดู/ embl / ddbj ภาค ยานุวัติตัวเลขที่ 16 S rrna ยีน
ลำดับของพันธุ์ K 1-25 T และ H 3-93 มี AJ 606037 และ
am051268 ,ตามลำดับ.
สามเสริมได้รับการจัดให้บริการด้วยตัวเลขแบบออนไลน์เวอร์ชั่นนี้
กระดาษ.
ระหว่างประเทศของงบประมาณอย่างเป็นระบบและวิวัฒนาการจุลชีววิทยา( 2011 ) 61 1880-1886 ดอย 10.1099 / ijs. 0.019489-0
1880019489