One hundred and twenty-two new hepa

One hundred and twenty-two new hepatitis B virus (HBV) preC/C sequences and three complete genomes from three major countries in West Africa were analysed. The majority of sequences were of genotype E and the only other genotype found was genotype A. Although for genotype E sequences, the genetic diversity of the preC/C gene was about two to three times higher than that of the preS/S gene, it was still considerably lower than that for genotype A sequences. The HBV/E preC/C gene was related most closely to subgenotype D1 and D2 sequences. Evidence of recombination was found in two strains that were of genotype A in the preS/S gene and of genotype E in the preC/C gene. The genotype A strains from Cameroon, Mali and Nigeria could be divided phylogenetically into three subtypes, A3 and two new subtypes, tentatively designated A4 and A5. Each subtype presented a genetic diversity of 2·19–3·85 % and intersubtype distances of 4·47–5·97 %. Interestingly, one sample from Nigeria showed evidence of a triple recombination of genotypes E/D and A, separated by a genotype G-specific insert of 36 bp. Of 110 patients, 19 (17·3 %) showed a coinfection of genotypes A and E, mostly in human immunodeficiency virus-positive children from Cameroon. Thus, in Cameroon, where both genotypes coexist, 37 % of all individuals tested had mixed infections. The low genetic variability in the preC/C gene of genotype E supports our previous speculation about a relatively short evolutionary history of this genotype, in contrast to the subtype-rich African genotype A strains.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หนึ่งร้อย และยี่สิบ - 2 ใหม่โรคไวรัส(ด้วยขั้น) preC/C ลำดับและ genomes สมบูรณ์สามจากสามประเทศที่สำคัญในแอฟริกาตะวันตกได้ analysed ส่วนใหญ่ลำดับที่ของลักษณะทางพันธุกรรม E และอ.ลักษณะทางพันธุกรรมเป็นการเฉพาะอื่น ๆ ลักษณะทางพันธุกรรมพบ แม้ว่าลักษณะทางพันธุกรรม E ลำดับ ความหลากหลายทางพันธุกรรมของยีน preC/C ได้ประมาณสองถึงสามเท่ามากกว่าของยีน เค้น/S มันก็ยังคงมากที่ต่ำกว่าในลำดับลักษณะทางพันธุกรรม A ยีน preC/C/E ด้วยขั้นเกี่ยวข้องกับ subgenotype ง 1 และ D2 ลำดับสุด พบหลักฐานของ recombination ในสองสายพันธุ์ที่มีลักษณะทางพันธุกรรม A ในยีน เค้น/S และลักษณะทางพันธุกรรมอีในยีน preC/C สามารถแบ่งสายพันธุ์ A ลักษณะทางพันธุกรรมจากแคเมอรูน มาลี และไนจีเรีย phylogenetically เป็น 3 subtypes, A3 และสอง subtypes ใหม่ กำหนดอย่าง A4 และ A5 แต่ละชนิดย่อยแสดงพันธุกรรม 2·19 – 3·85% และ intersubtype มีระยะห่างของ 4·47-5·97% เป็นเรื่องน่าสนใจ ตัวอย่างหนึ่งจากไนจีเรียพบหลักฐานของ recombination สามของ E/D และ A คั่น ด้วยการแทรกลักษณะทางพันธุกรรมเฉพาะ G 36 bp ของผู้ป่วย 110, 19 (17·3%) พบว่า coinfection ของ A และ E ส่วนใหญ่ในเด็กบวกมนุษย์ไวรัสเอชไอวีจากแคเมอรูน ดังนั้น ประเทศแคเมอรูน ซึ่งทั้งสองการศึกษาจีโนไทป์เริ่ม 37% ของผู้เข้าทดสอบได้ผสมเชื้อ ความแปรผันทางพันธุกรรมต่ำในยีน preC/C ของลักษณะทางพันธุกรรมอีสนับสนุนการเก็งกำไรของเราก่อนหน้านี้เกี่ยวกับประวัติวิวัฒนาการค่อนข้างสั้นของนี้ลักษณะทางพันธุกรรม ตรงข้ามสายพันธุ์ย่อยริชแอฟริกาลักษณะทางพันธุกรรม A

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หนึ่งร้อยยี่สิบสองไวรัสตับอักเสบบีใหม่ (HBV) prec / C และลำดับจีโนมที่สมบูรณ์สามจากสามประเทศที่สำคัญในแอฟริกาตะวันตกถูกนำมาวิเคราะห์ ส่วนใหญ่เป็นลำดับของ E จีโนไทป์และมีเพียงพันธุ์อื่น ๆ ที่พบเป็นพันธุ์ A. แม้ว่าสำหรับลำดับจีโนไทป์ E, ความหลากหลายทางพันธุกรรมของยีน prec / C ประมาณสองถึงสามครั้งสูงกว่าที่ปธน. / ยีน S มัน ก็ยังคงต่ำกว่าที่จีโนไทป์ลำดับ ไวรัสตับอักเสบบี / E prec / C ของยีนที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดเพื่อ subgenotype D1 และ D2 ลำดับ หลักฐานของการรวมตัวกันอีกก็พบว่าในสองสายพันธุ์ที่มีลักษณะทางพันธุกรรมของใน pres / ยีน S และ E จีโนไทป์ใน prec / ยีน C สายพันธุ์พันธุ์จากแคเมอรูน, มาลีและไนจีเรียสามารถแบ่งออกเป็นสาม phylogenetically เชื้อ, A3 และสองชนิดย่อยใหม่ที่กำหนดแน่นอน A4 และ A5 แต่ละชนิดย่อยที่นำเสนอความหลากหลายทางพันธุกรรมของ 2 · 19-3 · 85% และระยะทางของ intersubtype 4 · 47-5 · 97% ที่น่าสนใจตัวอย่างหนึ่งที่แสดงให้เห็นจากไนจีเรียหลักฐานของการรวมตัวกันอีกสามของยีน E / D และการแยกจากกันโดย genotype แทรก G-ที่เฉพาะเจาะจงของ 36 bp 110 ผู้ป่วย 19 (17 · 3%) แสดงให้เห็น coinfection ของยีนและอีส่วนใหญ่ในเด็กเอดส์ไวรัสในเชิงบวกจากแคเมอรูน ดังนั้นในแคเมอรูนที่ทั้งยีนร่วมกัน 37% ของประชาชนทุกคนได้ผ่านการทดสอบการติดเชื้อผสม ความแปรปรวนทางพันธุกรรมในระดับต่ำใน prec / ยีนของอีจีโนไทป์สนับสนุนเก็งกำไรก่อนหน้านี้เกี่ยวกับประวัติศาสตร์วิวัฒนาการอันสั้นของยีนนี้ในทางตรงกันข้ามกับชนิดย่อยที่อุดมไปด้วยพันธุ์แอฟริกันสายพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หนึ่งร้อยยี่สิบสองใหม่ไวรัสตับอักเสบบี ( HBV ) ที่ต้องการ / C ลำดับสามจีโนมที่สมบูรณ์จากสามประเทศหลักในแอฟริกาตะวันตกวิเคราะห์ . ส่วนใหญ่ของลำดับของจีโนไทป์ E เท่านั้นและ จีโนไทป์ อื่น ๆที่พบ คือ ยีโนไทป์ A กับ E แม้ว่าลำดับ ความหลากหลายทางพันธุกรรมของยีนที่ต้องการ / C ประมาณสองถึงสามครั้งสูงกว่าของพยาบาล / s ยีนมันเป็นยังต่ำกว่าที่ พันธุกรรม เป็นลำดับ จากการศึกษายีนที่ต้องการ / E / C มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดที่สุดกับ D1 และ D2 subgenotype ดังนี้ หลักฐานการพบใน 2 สายพันธุ์มีจีโนไทป์ในการถนอมอาหาร / s ยีนและพันธุกรรมในยีนที่ต้องการ E / C . ทางพันธุกรรมเป็นสายพันธุ์จากแคเมอรูน , มาลีและไนจีเรีย สามารถแบ่งออกเป็น 3 ชนิดย่อย phylogenetically ,A3 และสองชนิดย่อยใหม่ ช่วงเขต A4 และ A5 . แต่ละกลุ่มนำเสนอความหลากหลายของ 2 ด้วย 19 – 3 ด้วย  85 % และ intersubtype ระยะทาง 4 ด้วย 47 – 5 ด้วย  97 % ที่น่าสนใจคือตัวอย่างหนึ่งจากไนจีเรีย พบหลักฐานของการสามของจีโนไทป์ E / D และคั่นด้วยพันธุกรรม g-specific ใส่ 36   BP . 110 รายที่ 19 ( 17 ด้วย 3  เปอร์เซ็นต์ ) พบว่ามีเชื้อไวรัสชนิดของ A และ Eส่วนใหญ่ในเด็กเป็นบวกเอชไอวี จากแคเมอรูน ดังนั้น ในคาเมรูน ซึ่งทั้งสองชนิดอยู่ร่วมกัน 37   % ของบุคคลทุกคนทดสอบได้เชื้อผสม ความแปรปรวนทางพันธุกรรมต่ำในยีนของจีโนทัยป์ E / C ที่ต้องการสนับสนุนการเก็งกำไรก่อนหน้านี้ของเราเกี่ยวกับประวัติวิวัฒนาการของพันธุกรรมที่ค่อนข้างสั้นนี้ ในทางตรงกันข้ามกับทั้งรวยแอฟริกัน พันธุกรรม เป็นสายพันธุ์