A sugary mutant with low total star

A sugary mutant with low total starch and high sugar contents was compared with its wild type Sindongjin for grain-filling caryopses. In the present study, developing seeds of Sindongjin and sugary mutant from the 11th day after flowering (DAF) were subjected to RNA sequencing (RNA-Seq). A total of 30,385 and 32,243 genes were identified in Sindongjin and sugary mutant. Transcriptomic change analysis showed that 7713 differentially expressed genes (DEGs) (log2 fold change ≥ 1, false discovery rate (FDR) ≤ 0.001) were identified based on our RNA-Seq data, with 7239 genes up-regulated and 474 down-regulated in the sugary mutant. A large number of DEGs were found related to metabolic, biosynthesis of secondary metabolites, plant-pathogen interaction, plant hormone signal transduction and starch/sugar metabolism. Detailed pathway dissection and quantitative real time PCR (qRT-PCR) demonstrated that most genes involved in sucrose to starch synthesis are up-regulated, whereas the expression of the ADP-glucose pyrophosphorylase small subunit (OsAGPS2b) catalyzing the first committed step of starch biosynthesis was specifically inhibited during the grain-filling stage in sugary mutant. Further analysis suggested that the OsAGPS2b is a considerable candidate gene responsible for phenotype of sugary mutant.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Mutant ไพเราะต่ำรวมแป้งและน้ำตาลสูงเนื้อหาถูกเปรียบเทียบกับป่าชนิด Sindongjin สำหรับบรรจุเมล็ด caryopses ในปัจจุบันการศึกษา พัฒนาเมล็ดพันธุ์ของ Sindongjin และ mutant ไพเราะจาก 11 วันหลังจากดอก (เยอรมัน) ถูกต้องลำดับเบส (อาร์เอ็นเอลำดับ) อาร์เอ็นเอ ของยีน 30,385 และ 32,243 ได้ระบุไว้ใน Sindongjin และไพเราะ mutant วิเคราะห์การเปลี่ยนแปลง Transcriptomic แสดงให้เห็นว่า ยีน 7713 differentially แสดง (DEGs) (log2 พับเปลี่ยน≥ 1 ค้นหาเท็จอัตรา (FDR) ≤ 0.001) ระบุตามข้อมูลลำดับอาร์เอ็นเอ ยีน 7239 ขึ้นควบคุมและ 474 ระเบียบลงใน mutant ไพเราะ จำนวน DEGs พบเกี่ยวข้องกับการเผาผลาญ การสังเคราะห์ของ metabolites รอง โต้ตอบศึกษาพืช ฮอร์โมนพืชสัญญาณ transduction และแป้ง/น้ำตาลเผาผลาญ ทางเดินที่ละเอียดชำแหละและเชิงปริมาณจริงเวลา PCR (qRT-PCR) แสดงยีนเกี่ยวข้องกับซูโครสแป้งสังเคราะห์ส่วนใหญ่ขึ้นควบคุม โดยนิพจน์ของการ ADP กลูโคส pyrophosphorylase เล็กย่อย (OsAGPS2b) catalyzing มุ่งมั่นขั้นแรกของการสังเคราะห์แป้งถูกห้ามในช่วงระยะเมล็ดบรรจุใน mutant ไพเราะโดยเฉพาะ วิเคราะห์เพิ่มเติมแนะนำว่า OsAGPS2b ยีนผู้สมัครจำนวนมากชอบ phenotype ของ mutant ไพเราะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กลายพันธุ์หวานแป้งรวมต่ำและปริมาณน้ำตาลสูงเมื่อเทียบกับป่าประเภทของ Sindongjin สำหรับ caryopses เม็ดเติม ในการศึกษาการพัฒนาเมล็ดพันธุ์ของ Sindongjin และกลายพันธุ์หวานตั้งแต่วันที่ 11 หลังดอกบาน (DAF) ถูกยัดเยียดให้ลำดับอาร์เอ็นเอ (RNA-Seq) รวมเป็น 30,385 และ 32,243 ยีนที่ถูกระบุใน Sindongjin และกลายพันธุ์หวาน การวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลง transcriptomic แสดงให้เห็นว่า 7713 ยีนแสดงออกแตกต่างกัน (degs) (log2 พับเปลี่ยนแปลง≥ 1 อัตราการค้นพบที่ผิดพลาด (FDR) ≤ 0.001) ถูกระบุขึ้นอยู่กับข้อมูล RNA-Seq เราด้วย 7239 ยีนขึ้นควบคุมและ 474 ควบคุมลงใน กลายพันธุ์หวาน จำนวนมากของ degs ถูกค้นพบที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญอาหารของสารสังเคราะห์รองปฏิสัมพันธ์เชื้อโรคพืชฮอร์โมนพืชสัญญาณและแป้ง / การเผาผลาญน้ำตาล ผ่าทางเดินละเอียดเชิงปริมาณและเวลา PCR จริง (qRT-PCR) แสดงให้เห็นว่ายีนส่วนใหญ่มีส่วนร่วมในน้ำตาลซูโครสในการสังเคราะห์แป้งจะขึ้นควบคุมในขณะที่การแสดงออกของ ADP-กลูโคส pyrophosphorylase หน่วยย่อยขนาดเล็ก (OsAGPS2b) เร่งขั้นตอนความมุ่งมั่นที่แรกของการสังเคราะห์แป้ง ถูกยับยั้งโดยเฉพาะในระยะข้าวกรอกข้อมูลในกลายพันธุ์หวาน การวิเคราะห์เพิ่มเติมชี้ให้เห็นว่า OsAGPS2b เป็นผู้สมัครมากยีนที่รับผิดชอบในการฟีโนไทป์ของมนุษย์กลายพันธุ์ที่มีน้ำตาล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไพเราะกลายพันธุ์ที่มีแป้งและน้ำตาลสูง เนื้อหารวมต่ำเมื่อเทียบกับ sindongjin ชนิดของป่าสำหรับข้าวบรรจุ caryopses . ในการศึกษาการพัฒนาของเมล็ดและหวาน sindongjin กลายพันธุ์จากวันที่ 11 หลังจากดอกบาน ) ถูกลำดับ RNA ( RNA seq ) รวม 30385 32243 และยีนระบุใน sindongjin และหวานที่กลายพันธุ์การวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลง transcriptomic 7713 แสดงออกแตกต่างกัน พบว่า ยีน ( degs ) ( LOG พับเปลี่ยน≥ 1 อัตราการค้นพบเท็จ ( FDR ) ≤ 0.001 ) ถูกระบุจากข้อมูล seq อาร์เอ็นเอของเรากับ 7239 ยีน และถ้าสามารถลงระเบียบในหวานที่กลายพันธุ์ ตัวเลขขนาดใหญ่ของ degs พบเกี่ยวข้องกับการเผาผลาญ การสังเคราะห์สาร secondary metabolites ปฏิสัมพันธ์ของเชื้อโรคพืชฮอร์โมนพืชสัญญาณพลังงานและแป้ง / น้ำตาล การเผาผลาญ ชำแหละเส้นทางรายละเอียดและปริมาณเวลา PCR จริง ( ข้าพเจ้า PCR ) พบว่า ยีนที่เกี่ยวข้องในการสังเคราะห์ส่วนใหญ่สามารถใช้แป้ง ,ส่วนการแสดงออกของ ADP กลูโคส pyrophosphorylase เล็ก subunit ( osagps2b ) และมุ่งมั่นก้าวแรกของวิถีการสังเคราะห์แป้งในเมล็ดข้าวที่ถูกเฉพาะยับยั้งขั้นตอนไส้หวานที่กลายพันธุ์ การวิเคราะห์เพิ่มเติมพบว่า osagps2b เป็นจํานวนมาก ผู้ที่มียีนที่รับผิดชอบของหวานที่กลายพันธุ์