In total, 231,944 small RNA sequences (15 < length < 29-nt) were obtained. The initial local nucleotide BLAST (BLASTn) search (BioEdit program) against all virus reference genomes available
in the GenBank, identified 87 “hits” (E value cut-off 0.01, Supplementary Table 1) to the CYDV-RPS genome (NC 002198). Additional screening against all CYDV genome sequences in the GenBank (NC 002198, NC 004751, EF521827, EF521830, EF521839, and EF521848) revealed 289 putative CYDV vsiRNAs
(Supplementary Table 1) representing several regions in the CYDV genomes (Fig. 1)
โดยรวมแล้ว 231,944 ลำดับ RNA ขนาดเล็ก (15 <ยาว <29 NT) ที่ได้รับ เริ่มต้นเบื่อหน่าย BLAST ท้องถิ่น (ดังกล่าวหา) ค้นหา (โปรแกรม BioEdit) กับทุกจีโนมของการอ้างอิงไวรัสที่มีอยู่
ใน GenBank ระบุ 87 "ฮิต" (ค่า E cut-off 0.01, เสริมตารางที่ 1) เพื่อ CYDV-RPS จีโนม (NC 002198) . การตรวจคัดกรองเพิ่มเติมกับทุกลำดับจีโนม CYDV ใน GenBank (NC 002,198, NC 004751, EF521827, EF521830, EF521839 และ EF521848) เปิดเผย 289 สมมุติ CYDV vsiRNAs
(เสริมตารางที่ 1) เป็นตัวแทนของหลายภูมิภาคในจีโนม CYDV (รูปที่ 1).
การแปล กรุณารอสักครู่..
