3.2. Analysis of conserved domains

3.2. Analysis of conserved domains in the citrus Hsf proteins
The MEME motif search tool was used to identify the conserved
domains in CcHsf proteins. Thirty corresponding consensus motifs
were detected (Table 3). The majority of CcHsfs, contained motifs 1, 2,
3, 4 and 5, which correspond to the highly conserved regions including
the DBD and HR-A/B region domains. Motif 4 was detected in all A and
C-type group members, but did not appear in B-type group members. In
addition, the analysis revealed that some motifs were only present in
specific classes of the CcHsf family. For example, motif 7 was representative
of A-type Hsf members such as CcHsfA1a, CcHsfA1b, CcHsfA4a,
CcHsfA4b, CcHsfA6 and CcHsfA8, and it contained the signature
domains corresponding to NES sequences. Similarly, motif 6 containing
the AHA sequence was detected in the C-terminal parts of many A-type
CcHsf proteins. Furthermore, 12 members, namely CcHsfA1a, CcHsfA1b,
CcHsfA2, CcHsfA4a, CcHsfA4b, CcHsfA5, CcHsfA6, CcHsfA7, CcHsfB1,
CcHsfB3, CcHsfB4 and CcHsfC1, were characterized by the presence of
motif 9, which contained the NLS domains (Fig. 2).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.2 การวิเคราะห์โดเมนนำในโปรตีน Hsf ส้มเครื่องมือค้นหาแปลน MEME ถูกใช้เพื่อระบุการนำโดเมนใน CcHsf โปรตีน สามสิบลงมติที่เกี่ยวข้องถูกตรวจพบ (ตาราง 3) ส่วนใหญ่ของ CcHsfs ความมี 1, 23, 4 และ 5 ซึ่งสอดคล้องกับภูมิภาคที่นำสูงรวมถึงDBD และ HR-A/B พื้นที่โดเมน สาระสำคัญ 4 พบใน A ทั้งหมด และสมาชิกของกลุ่มประเภท C แต่ไม่ปรากฏในประเภท B กลุ่มสมาชิก ในนอกจากนี้ การวิเคราะห์เปิดเผยบางลงได้เฉพาะในเรียนเฉพาะตระกูล CcHsf ตัวอย่าง แปลน 7 เป็นตัวแทนชนิด A Hsf สมาชิกเช่น CcHsfA1a, CcHsfA1b, CcHsfA4aCcHsfA4b, CcHsfA6 และ CcHsfA8 และประกอบด้วยลายเซ็นโดเมนที่สอดคล้องกับลำดับ NES ในทำนองเดียวกัน แปลน 6 ประกอบด้วยลำดับลเอพบใน C-เทอร์มินัลชนิด A มากCcHsf โปรตีน นอกจากนี้ สมาชิก 12 ได้แก่ CcHsfA1a, CcHsfA1bCcHsfA2, CcHsfA4a, CcHsfA4b, CcHsfA5, CcHsfA6, CcHsfA7, CcHsfB1CcHsfB3, CcHsfB4 และ CcHsfC1 มีลักษณะของแปลน 9 ซึ่งประกอบด้วยโดเมน NLS (Fig. 2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.2 การวิเคราะห์ของโดเมนอนุรักษ์ในโปรตีนส้ม HSF
เครื่องมือค้นหามาตรฐานมส์ถูกนำมาใช้เพื่อระบุป่าสงวนโดเมนโปรตีน CcHsf
สามสิบลวดลายฉันทามติที่สอดคล้องกันถูกตรวจพบ (ตารางที่ 3)
ส่วนใหญ่ของ CcHsfs, มีลวดลายที่ 1, 2,
3, 4 และ 5 ซึ่งสอดคล้องกับภูมิภาคป่าสงวนรวมทั้ง
DBD และ HR-A / B โดเมนภูมิภาค Motif 4
ถูกตรวจพบในทั้งหมดและสมาชิกในกลุ่มC-ประเภท แต่ไม่ได้ปรากฏขึ้นในสมาชิกในกลุ่ม B-ประเภท ในนอกจากนี้การวิเคราะห์พบว่าลวดลายบางอย่างอยู่ในปัจจุบันเพียงแต่ในชั้นเรียนที่เฉพาะเจาะจงของครอบครัวCcHsf ยกตัวอย่างเช่นบรรทัดฐาน 7 เป็นตัวแทนของสมาชิกประเภทHSF เช่น CcHsfA1a, CcHsfA1b, CcHsfA4a, CcHsfA4b, CcHsfA6 และ CcHsfA8 และมันมีลายเซ็นโดเมนที่สอดคล้องกับลำดับนินเทน ในทำนองเดียวกันบรรทัดฐาน 6 ที่มีลำดับAHA ถูกตรวจพบในส่วน C ขั้วของหลายประเภทโปรตีนCcHsf นอกจากนี้ 12 คน ได้แก่ CcHsfA1a, CcHsfA1b, CcHsfA2, CcHsfA4a, CcHsfA4b, CcHsfA5, CcHsfA6, CcHsfA7, CcHsfB1, CcHsfB3, CcHsfB4 และ CcHsfC1, โดดเด่นด้วยการปรากฏตัวของบรรทัดฐานที่9 ที่มีโดเมน NLS (รูปที่. 2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2 . การวิเคราะห์เพื่อโดเมนในส้ม hsf โปรตีน
meme แม่ลายเครื่องมือค้นหาใช้เพื่อระบุป่าสงวน
โดเมนโปรตีน cchsf . สามสิบที่เอกฉันท์ลวดลาย
ตรวจพบ ( ตารางที่ 3 ) ส่วนใหญ่ของ cchsfs ที่มีอยู่ลวดลาย
1 , 2 , 3 , 4 และ 5 ซึ่งสอดคล้องกับที่มีการอนุรักษ์ภูมิภาค ได้แก่ กรมพัฒนาธุรกิจการค้า และ hr-a
/ B โดเมนภูมิภาคแม่ลาย 4 ที่ตรวจพบในทั้งหมดและ
สมาชิกกลุ่มคาร์บอน แต่ไม่ปรากฏในกลุ่มสมาชิก กรุ๊ปบี ใน
และวิเคราะห์ พบว่า มีลวดลายเป็นปัจจุบันใน
ชนชั้นเฉพาะของครอบครัว cchsf . ตัวอย่างเช่นแรงจูงใจ 7 ตัวแทน
ของเอ hsf สมาชิก เช่น cchsfa1a cchsfa1b cchsfa4a cchsfa4b
, , , , และ cchsfa6 cchsfa8 และมันมีลายเซ็น
โดเมนที่ไม่ ลำดับ ในทำนองเดียวกันที่มีแม่ลาย 6
AHA ลำดับที่ตรวจพบในส่วนของหลายประเภทซึ่ง
cchsf โปรตีน มี 12 สมาชิก ได้แก่ cchsfa1a cchsfa1b cchsfa2 cchsfa4a
, , , , cchsfa4b cchsfa5 cchsfa6 cchsfa7 , , , ,
cchsfb3 cchsfb1 , และ , cchsfb4 cchsfc1 เป็นลักษณะการปรากฏตัวของ
5 9 ซึ่งมี NLS โดเมน ( รูปที่ 2 )