The w100 kDa-bands detected in all

The w100 kDa-bands detected in all individual environmental
isolates and reference strains were digested with trypsin and the
mass spectra of tryptic peptides were compared to evaluate similarities
and differences. MALDI TOF MS peptide profiles verified
that all of the environmental strains had similar mass spectra for
this protein, with an abundant and unique peptide being located
at 1840.9 m/z (see Fig. 1). Using the NCBI database within the
MASCOT search engine, commonly used for identifying proteins
based on mass spectral data, the w100 kDa protein was identified
as aconitate hydratase. Each environmental isolate was analyzed
a minimum of twice, followed by processing the data using
MASCOT. In total, 75 MALDI TOF MS analyses were subjected to
MASCOT searches on the 22 environmental isolates. Although the
spectra were remarkably similar, only 3 of the 75 mass spectra were
identified as aconitate hydratase with a MOWSE score, but the
valuewas less than the identification confidence level. Previously, it
was noted that MASCOT only identified aconitate hydratase in some
of the environmentally isolated staphylococcal strains [6], consistent
with the results presented here for Micrococcus.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

KDa-วง w100 ที่ตรวจพบในสิ่งแวดล้อมบุคคลทั้งหมดแยกและสายพันธุ์อ้างอิงถูกต้องกับทริปซินและแรมสเป็คตรามวลของเปปไทด์ tryptic ได้เปรียบเทียบเพื่อประเมินความเหมือนและความแตกต่าง ส่วนกำหนดค่าเพปไทด์ MALDI TOF MS ที่ตรวจสอบทั้งหมดของสายพันธุ์สิ่งแวดล้อมมีแรมสเป็คตราโดยรวมคล้ายกันสำหรับโปรตีนนี้ มีการเพปไทด์มากมาย และไม่ซ้ำกันที่ถูกตั้งอยู่ที่ 1840.9 m/z (ดู Fig. 1) ใช้ NCBI ฐานข้อมูลภายในเครื่องมือค้นหาแมสคอท ใช้สำหรับการระบุโปรตีนตามข้อมูลสเปกตรัมจำนวนมาก โปรตีน kDa w100 ระบุเป็น aconitate hydratase แยกแต่ละสิ่งแวดล้อมได้วิเคราะห์อย่างน้อยสอง ตาม ด้วยการประมวลผลข้อมูลโดยใช้แมสคอท รวม 75 MALDI TOF MS วิเคราะห์ถูกต้องแมสคอทค้นหาในสิ่งแวดล้อม 22 แยกได้ แม้ว่าการแรมสเป็คตรามีเหมือน 3 เท่าของแรมสเป็คตรามวล 75 ได้ระบุเป็น aconitate hydratase ด้วยคะแนน MOWSE แต่valuewas น้อยกว่าระดับความเชื่อมั่นรหัส ก่อนหน้านี้ มันถูกตั้งข้อสังเกตว่า มาสค็อทระบุ hydratase aconitate ในบางส่วนเท่านั้นของการแยกสิ่งแวดล้อม staphylococcal สายพันธุ์ [6], สอดคล้องกันมีผลลัพธ์ที่แสดงที่นี่สำหรับรำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วง kDa-W100 ตรวจพบในสิ่งแวดล้อมของแต่ละบุคคลทุก
สายพันธุ์และสายพันธุ์อ้างอิงถูกย่อยด้วย trypsin และ
สเปกตรัมมวลของเปปไทด์ tryptic ถูกเมื่อเทียบกับการประเมินความคล้ายคลึง
และความแตกต่าง MALDI TOF MS โปรไฟล์เปปไทด์ที่ตรวจสอบแล้ว
ว่าทุกสายพันธุ์สิ่งแวดล้อมมีสเปกตรัมมวลที่คล้ายกันสำหรับ
โปรตีนนี้มีเปปไทด์ที่อุดมสมบูรณ์และเป็นเอกลักษณ์ที่ตั้งอยู่
ที่ 1,840.9 เมตร / Z (ดูรูปที่ 1). การใช้ฐานข้อมูล NCBI ภายใน
เครื่องมือค้นหา MASCOT นิยมใช้สำหรับการระบุโปรตีน
อยู่บนพื้นฐานของข้อมูลสเปกตรัมมวลโปรตีน W100 กิโลดาลตันถูกระบุว่า
เป็น aconitate hydratase แต่ละแยกสิ่งแวดล้อมได้รับการวิเคราะห์
อย่างน้อยสองครั้งตามด้วยการประมวลผลข้อมูลโดยใช้
MASCOT ทั้งหมด 75 MALDI TOF MS วิเคราะห์ถูกยัดเยียดให้
ค้นหา MASCOT ใน 22 สายพันธุ์สิ่งแวดล้อม แม้ว่า
สเปกตรัมมีความคล้ายคลึงกันอย่างน่าทึ่งเพียง 3 ของ 75 สเปกตรัมมวลถูก
ระบุว่าเป็น hydratase aconitate ด้วยคะแนน MOWSE แต่
valuewas น้อยกว่าระดับความเชื่อมั่นประชาชน ก่อนหน้านี้ก็
ถูกตั้งข้อสังเกตว่า MASCOT ระบุเพียง aconitate hydratase ในบาง
สายพันธุ์ของ staphylococcal แยกสิ่งแวดล้อม [6] สอดคล้อง
กับผลลัพธ์ที่ได้นำเสนอที่นี่สำหรับ Micrococcus

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ w100 ) วงดนตรีที่ตรวจพบในแต่ละสายพันธุ์และสายพันธุ์
สิ่งแวดล้อมทั้งหมดอ้างอิงที่ถูกย่อยด้วยเอนไซม์ และมวลของอาหารเปปสเปกตรัม

เปรียบเทียบเพื่อประเมินความคล้ายคลึงกันและแตกต่างกัน มา ดิ tof MS เปปไทด์โปรไฟล์ยืนยัน
ทั้งหมดของสายพันธุ์ที่สิ่งแวดล้อมมีสเปกตรัมมวลที่คล้ายกันสำหรับ
โปรตีนนี้มีชุกชุม และเป็นเอกลักษณ์ของเปปไทด์ถูกตั้งอยู่
ที่ 1840 .9 M / Z ( ดูรูปที่ 1 ) การใช้ฐานข้อมูลภายใน ncbi
สำหรับเครื่องมือค้นหาโดยทั่วไปจะใช้สำหรับการระบุโปรตีน
ขึ้นอยู่กับมวลสเปกตรัมข้อมูล w100 kDa และโปรตีนที่ถูกระบุว่าเป็นอะโคนิเตต hydratase
. แต่ละด้านแยกวิเคราะห์
อย่างน้อยสองครั้ง ตามด้วยการประมวลผลข้อมูลโดยใช้
Mascot ทั้งหมด 75 มา ดิ tof MS วิเคราะห์ถูก

สำหรับการค้นหาบน 22 สิ่งแวดล้อมเชื้อ แม้ว่า
Spectra คล้ายกันอย่างน่าทึ่ง เพียง 3 ของ 75 มวลสเปกตรัมที่ถูกระบุว่าเป็นอะโคนิเตต hydratase ด้วย

กัน mowse คะแนน แต่น้อยกว่าตัวที่ระดับความเชื่อมั่น . ก่อนหน้านี้ , มันเป็นข้อสังเกตว่ามิ่งขวัญระบุเฉพาะ

อะโคนิเตต hydratase ในบางส่วนของสายพันธุ์ที่แยกกับสิ่งแวดล้อม staphylococcal [ 6 ]สอดคล้องกับผลการทดลอง
ที่นี่ Micrococcus .