real-time PCR and real-time RT-PCR. Both techniques are powerful
methods that can be practically used to detect and quantify both bacterial
and viral shrimp pathogens such as Vibrio parahaemolyticus, Salmonella
spp., infectious hypodermal and hematopoietic virus (IHHNV),
Monodon baculovirus (MBV), white spot syndrome virus (WSSV), yellow
head virus (YHV), and Taura syndrome virus (TSV) (Durand and
Lightner, 2002; Tang and Lightner, 2001; Yan et al., 2009). Currently,
the specific real-time reverse transcription loop-mediated isothermal
amplification (RT-LAMP) was developed to detect CMNV in Litopenaeus
vannamei shrimp(Zhang et al., 2015). This assay is rapid and higher sensitive
than nested RT-PCR but requires complicated processes for optimizing
the reactions and restricts to the availability of reagents,
specific primer and instruments. However, to quantify the target virus,
the real-time PCR technique requires a fluorescent-oligonucleotide
probe specific for viral species which is not available for CMNV. In this
study, we thus aimed to develop a TaqMan probe-based real-time RTPCR
technique in order to establish amore efficient technique for detection
of CMNV infection in shrimp.
real-time PCR and real-time RT-PCR. Both techniques are powerfulmethods that can be practically used to detect and quantify both bacterialand viral shrimp pathogens such as Vibrio parahaemolyticus, Salmonellaspp., infectious hypodermal and hematopoietic virus (IHHNV),Monodon baculovirus (MBV), white spot syndrome virus (WSSV), yellowhead virus (YHV), and Taura syndrome virus (TSV) (Durand andLightner, 2002; Tang and Lightner, 2001; Yan et al., 2009). Currently,the specific real-time reverse transcription loop-mediated isothermalamplification (RT-LAMP) was developed to detect CMNV in Litopenaeusvannamei shrimp(Zhang et al., 2015). This assay is rapid and higher sensitivethan nested RT-PCR but requires complicated processes for optimizingthe reactions and restricts to the availability of reagents,specific primer and instruments. However, to quantify the target virus,the real-time PCR technique requires a fluorescent-oligonucleotideprobe specific for viral species which is not available for CMNV. In thisstudy, we thus aimed to develop a TaqMan probe-based real-time RTPCRtechnique in order to establish amore efficient technique for detectionof CMNV infection in shrimp.
การแปล กรุณารอสักครู่..
PCR แบบเรียลไทม์และ RT-PCR แบบเรียลไทม์ เทคนิคทั้งสองที่มีประสิทธิภาพวิธีที่สามารถจะใช้เพื่อตรวจสอบและวัดทั้งแบคทีเรียกุ้ง เช่น ไวรัส และเชื้อโรค Vibrio parahaemolyticus , Salmonellaspp . ) และไวรัส ( hypodermal เม็ดโลหิต ihhnv )monodon baculovirus ( MBV ) , ไวรัสดวงขาว ( ี ) , สีเหลืองหัว ( หัว ) และไวรัสทอร่าซินโดรมไวรัส ( TSV ) ( ดูรันด์ และดวงไฟ , 2002 ; ถัง และดวงไฟ , 2001 ; ยัน et al . , 2009 ) ในปัจจุบันถอดความโดยเฉพาะเวลาจริงกลับห่วงคงที่( ( rt-lamp ) ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อตรวจสอบ cmnv ในงกุ้ง vannamei ( Zhang et al . , 2015 ) การทดสอบนี้เป็นอย่างรวดเร็วและความไวสูงกว่ากัน แต่ต้องใช้กระบวนการที่ซับซ้อนสำหรับการเพิ่มประสิทธิภาพ 4 .ปฏิกิริยาและจำกัดการใช้สารเคมีไพรเมอร์จำเพาะ และเครื่องดนตรี อย่างไรก็ตาม ปริมาณไวรัสเป้าหมายเทคนิค PCR แบบเรียลไทม์ ซึ่งจะเรืองแสงตรวจสอบเฉพาะสำหรับไวรัสชนิดที่ไม่สามารถใช้ได้กับ cmnv . ในนี้การศึกษา เราจึงมุ่งพัฒนา taqman สอบสวนตาม rtpcr แบบเรียลไทม์เทคนิคในการสร้างเทคนิคที่มีประสิทธิภาพสำหรับการตรวจหามอร์ของ cmnv โรคติดเชื้อในกุ้ง
การแปล กรุณารอสักครู่..