Genetic evaluation of beef cattle a

Genetic evaluation of beef cattle accounting for uncertain paternity

A hierarchical Bayes (HIER) model for the quantitative genetic analysis of performance data was compared to a model based on the use of Henderson's average numerator relationship matrix (ANRM) when some pedigrees are characterized by uncertain paternity. A simulation study consisted of ten datasets characterized by 30% of animals having uncertain paternity for each of two traits: one having moderate heritabilities for direct and maternal genetic effects on weaning weight (WWT) and another having a high heritability for direct genetic effects on postweaning gain (PWG). Posterior inference on the variance components was very similar between the two models. In an application to WWT and PWG data from Brazilian Herefords, posterior inference on variance components was also very similar between ANRM and HIER. Furthermore, rank correlations on posterior means for genetic effects between the two models exceeded 0.90. Nevertheless, large differences in posterior means between these two models were observed for some animals. Furthermore, animals with uncertain paternity had generally larger posterior standard deviations of genetic effects using the HIER model compared to the ANRM model, likely because the HIER model infers upon sire assignment probabilities. Bayesian model choice criteria consistently favored the HIER model over the ANRM model in both simulation and Hereford data analysis studies.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การประเมินผลทางพันธุกรรมของโคเนื้อคิดเป็นพ่อที่ไม่แน่นอนแบบลำดับชั้นเบส์ (ที่นี่) แบบจำลองสำหรับการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมเชิงปริมาณของข้อมูลประสิทธิภาพเมื่อเทียบกับรูปแบบขึ้นอยู่กับการใช้งานของเฮนเดอร์แมทริกซ์ความสัมพันธ์เศษเฉลี่ย (ANRM) เมื่อ pedigrees บางส่วนมีลักษณะการเป็นพ่อแม่ลูกมีความไม่แน่นอน . การศึกษาแบบจำลองประกอบด้วยสิบชุดข้อมูลที่โดดเด่นด้วย 30% ของสัตว์ที่มีพ่อแม่ลูกมีความไม่แน่นอนสำหรับแต่ละสองลักษณะหนึ่งที่มีพันธุกรรมในระดับปานกลางสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงและมารดาในหย่านมน้ำหนัก (WWT) และอื่น ๆ ที่มีพันธุกรรมสูงสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงต่อ postweaning ได้รับ (PWG) อนุมานหลังกับองค์ประกอบความแปรปรวนเป็นอย่างมากที่คล้ายกันระหว่างทั้งสองรุ่น ในการประยุกต์ใช้ในการ WWT และข้อมูลจาก PWG Herefords บราซิลอนุมานหลังในองค์ประกอบความแปรปรวนก็ยังคล้ายกันมากระหว่าง ANRM และที่นี่ นอกจากนี้ความสัมพันธ์ในตำแหน่งหลังหมายความว่าสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมระหว่างสองรุ่นเกิน 0.90 แต่แตกต่างกันมากในหลังหมายถึงระหว่างทั้งสองรุ่นถูกตั้งข้อสังเกตสำหรับสัตว์บางชนิด นอกจากนี้สัตว์ที่มีพ่อแม่ลูกมีความไม่แน่นอนหลังมีขนาดใหญ่โดยทั่วไปค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของผลกระทบทางพันธุกรรมโดยใช้แบบจำลองที่นี่เมื่อเทียบกับรูปแบบ ANRM, อาจเป็นเพราะรูปแบบที่นี่อ้างถึงเมื่อความน่าจะเป็นพ่อที่ได้รับมอบหมาย เกณฑ์ที่รูปแบบทางเลือกที่ได้รับการสนับสนุนอย่างต่อเนื่องคชกรรมรูปแบบที่นี่มากกว่ารูปแบบ ANRM ทั้งในการจำลองและเฮียศึกษาวิเคราะห์ข้อมูล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของโคบัญชีความความเป็นพ่อ

ชุด Bayes ( ที่นี่ ) รูปแบบการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมเชิงปริมาณของข้อมูลประสิทธิภาพเมื่อเทียบกับรูปแบบขึ้นอยู่กับการใช้ เฮนเดอร์สันมีเศษความสัมพันธ์เมทริกซ์ ( รถ ) เมื่อบิดาตาย มีลักษณะไม่แน่นอนการจำลองการศึกษา 10 ข้อมูลลักษณะ โดย 30% ของความเป็นสัตว์ที่มีความไม่แน่นอนสำหรับแต่ละสองลักษณะหนึ่งที่มีค่าอัตราพันธุกรรมปานกลาง โดยตรง และผลทางพันธุกรรมของน้ำหนักหย่านม ( นั่น ) และอีกมีอัตราสูงสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงใน postweaning ได้รับ ( PWG )การอนุมานด้านหลังในองค์ประกอบความแปรปรวนที่คล้ายคลึงกันมากระหว่างสองรุ่น ในใบสมัครและข้อมูลจากบราซิลนั่น PWG herefords การด้านหลังบนส่วนประกอบความแปรปรวนยังคล้ายกันมากระหว่างรถกับที่นี่ . นอกจากนี้ อันดับ 6 บนหมายถึงหลังผลทางพันธุกรรมระหว่างสองรุ่นเกิน 1 . อย่างไรก็ตามความแตกต่างในวิธีการของทั้งสองรุ่นเป็นสังเกตสำหรับสัตว์บาง นอกจากนี้ สัตว์ที่มีความเป็นพ่อที่ไม่แน่นอนมีขนาดใหญ่และส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานของผลทางพันธุกรรมโดยใช้ที่นี่รุ่นเมื่อเทียบกับรถรุ่น อาจเป็นเพราะที่นี่แบบอนุมาน เมื่อท่านกำหนดความน่าจะเป็นแบบจำลองแบบทางเลือกเกณฑ์อย่าง ชอบที่นี่มากกว่า ทั้งในรูปแบบรถโมเดลจำลองและ Hereford การวิเคราะห์ข้อมูลการศึกษา .