The most predominant fungal genera

The most predominant fungal genera (Aspergillus,
Alternaria and Penicillium) were selected for molecular
identification to the species level by using ITS1 and ITS4
primers as described by White et al. (1990), based on
amplification of the ITS1 and ITS2 regions of ribosomal
RNA. The results from gel electrophoresis showed
evident differences among genera depending on the
sizes of amplified fragments, and these differences
provide a good tool to discriminate between genera
(Figure 1). For the genus Aspergillus, three different
fragments were seen as follow: 531, 575 and 580 bp,
while two different fragments of sizes 305 and 150 bp
were seen with genus Alternaria, finally, two fragments of
sizes 580 and 600 bp were seen within the genus
Penicillium. The ITS sequences for the contaminated
fungi were analyzed in the GenBank of NCBI, the results
of BLAST search revealed the identity of each
predominant fungi. For the genus Aspergillus, three
different species were identified as A. clavatus
(EF670001.1), A. niger (KC119204.1) and A. terreus
( EF592171.1), with identity 99 to 100%, while, two
different species were identified belonging to the species
Alternaria which were A. alternata (KC134318.1) and A.
citri (AF397051.1) (99% of identity), and two species of
the genus Penicillium were identified as P. expansum
(JX869559.1) and P. glabrum (JX421729.1) (99% of
identity).

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

จำพวกเชื้อราเด่นที่สุด (Aspergillus,
Alternaria และ Penicillium)
ได้รับการแต่งตั้งให้เป็นโมเลกุลการระบุถึงระดับสายพันธุ์โดยใช้ITS1 และ ITS4
ไพรเมอร์ตามที่อธิบายขาว et al, (1990)
บนพื้นฐานของการขยายของITS1 และภูมิภาค ITS2
ของโซมอลอาร์เอ็นเอ ผลที่ได้จากข่าวคราวที่แสดงให้เห็นความแตกต่างที่เห็นได้ชัดในหมู่จำพวกขึ้นอยู่กับขนาดของชิ้นส่วนขยายและความแตกต่างเหล่านี้ให้เป็นเครื่องมือที่ดีในการแยกแยะระหว่างจำพวก(รูปที่ 1) สำหรับสกุล Aspergillus ที่แตกต่างกันสามชิ้นได้เห็นดังต่อไปนี้: 531, 575 และ 580 bp, ขณะที่ทั้งสองชิ้นส่วนที่แตกต่างกันขนาด 305 และ 150 bp ได้เห็นกับสกุล Alternaria ในที่สุดทั้งสองชิ้นส่วนของ580 ขนาด 600 bp ได้เห็นภายใน สกุลPenicillium ลำดับของการปนเปื้อนเชื้อราวิเคราะห์ใน GenBank ของ NCBI ผลของการค้นหาระเบิดเปิดเผยตัวตนของแต่ละคนเชื้อราเด่น สำหรับสกุล Aspergillus สามสายพันธุ์ที่แตกต่างกันถูกระบุว่าเป็นเอclavatus (EF670001.1) เอไนเจอร์ (KC119204.1) และ A. terreus (EF592171.1) กับตัวตนที่ 99-100% ในขณะที่ทั้งสองสายพันธุ์ที่แตกต่างกันถูกระบุอยู่ในสายพันธุ์Alternaria ซึ่ง A. alternata (KC134318.1) และเอcitri (AF397051.1) (99% ของตัวตน) และสองชนิดประเภทPenicillium ถูกระบุว่าเป็นพี expansum (JX869559.1 ) และพี glabrum (JX421729.1) (99% ของตัวตน)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่โดดเด่นที่สุดของเชื้อราสกุล ( Aspergillus , Penicillium และ
= ) สุ่มรหัสเพื่อสายพันธุ์ระดับโมเลกุล

และ its1 its4 โดยใช้ไพรเมอร์ตามที่อธิบายไว้โดยสีขาว et al . ( 2533 ) ตามแบบของ its1 its2

และภูมิภาคของ ribosomal RNA ผลจาก gel electrophoresis พบความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างสกุลขึ้นอยู่กับ

ขนาดของชิ้นส่วนของและเหล่านี้ความแตกต่าง
ให้เครื่องมือที่ดีที่จะแยกแยะระหว่างสกุล
( รูปที่ 1 ) สำหรับกุล Aspergillus , สามชิ้นส่วนที่แตกต่างกัน
เห็นดังนี้ อุปกรณ์ และ 580 /
ในขณะที่สองชิ้นส่วนที่แตกต่างกันขนาด 305 และ 150 BP
เห็นกับสกุลโรคในที่สุด สองชิ้นส่วนของ
ขนาด 580 600 BP ได้เห็นภายในสกุล
ราเหรอของลำดับสำหรับการปนเปื้อนเชื้อรา
วิเคราะห์ขนาดของ ncbi ผลการค้นหา พบระเบิด

เด่นเฉพาะตัวของแต่ละชนิดได้ สำหรับกุล Aspergillus , 3
ชนิดที่ถูกระบุว่าเป็น . clavatus
( ef670001.1 ) , A . niger ( kc119204.1 ) และ A . terreus ที่
( ef592171.1 ) ด้วยเอกลักษณ์ที่ 99 ถึง 100% ในขณะที่สอง
สายพันธุ์ที่แตกต่างกันที่ถูกระบุอยู่ในสปีชีส์
= ซึ่ง . alternata ( kc134318.1 ) และ A .
citri ( af397051.1 ) ( 99% ของตัวตน ) และสองชนิดของ
กุล Penicillium ที่ถูกระบุว่าเป็นหน้า expansum
( jx869559.1 ) และหน้า glabrum ( jx421729.1 ) ( 99% ของ
ตัวตน )