Culture-dependentandculture-indepen

Culture-dependentandculture-independentmethodswerecombinedfortheinvestigationofaceticacidbacteria
(AAB) populations in traditionally produced vinegars and mother of vinegar samples obtained from apple and
grape. The culture-independent denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis, which targeted the
V7–V8 regions of the 16S rRNA gene, showed that Komagataeibacter hansenii and Komagataeibacter europaeus/
Komagataeibacter xylinus were the most dominant species in almost all of the samples analyzed directly. The
culture-independent GTG 5 -rep PCR fingerprinting was used in the preliminary characterization of AAB isolates
and species-level identification was carried out by sequencing of the 16S rRNA gene, 16S–23S rDNA internally
transcribedto thespacer(ITS)region and tufgene.Acetobacterokinawensiswasfrequentlyisolatedfromsamples
obtained from apple while K. europaeus was identified as the dominant species, followed by Acetobacter
indonesiensis in the samples originating from grape. In addition to common molecular techniques, real-time
PCR intercalating dye assays, including DNA melting temperature (Tm) and high resolution melting analysis
(HRM),wereappliedtoaceticacidbacterialisolatesforthefirsttime.ThetargetsequenceofITSregiongenerated
species-specific HRM profiles and Tm values allowed discrimination at species level.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วัฒนธรรม-dependentandculture-independentmethodswerecombinedfortheinvestigationofaceticacidbacteriaประชากร (aab โดย) ซึ่งผลิต vinegars และแม่ตัวอย่างน้ำส้มสายชูที่ได้จากแอปเปิ้ล และองุ่น วัฒนธรรมอิสระ denaturing เจลไล่ระดับ electrophoresis (DGGE) วิเคราะห์ ซึ่งเป็นเป้าหมายแคว้น 16S rRNA ยีน V7-V8 พบที่ hansenii Komagataeibacter Komagataeibacter europaeus และ /Komagataeibacter xylinus สปีชีส์หลักมากที่สุดในตัวอย่างวิเคราะห์โดยตรงเกือบทั้งหมดได้ ที่วัฒนธรรมอิสระ GTG 5-ตัวแทน PCR ลายพิมพ์ใช้ในคุณสมบัติเบื้องต้นของ aab โดยแยกและพันธุ์ระดับรหัสถูกดำเนินการ โดยลำดับของยีน 16S rRNA, 16S – 23S rDNA ภายในภูมิภาค thespacer (ของ) transcribedto และ tufgene Acetobacterokinawensiswasfrequentlyisolatedfromsamplesได้รับจากแอปเปิ้ลในขณะที่คุณ europaeus ระบุเป็นสายพันธุ์หลัก ตาม Acetobacterindonesiensis ในตัวอย่างที่มาจากองุ่น นอกจากนี้ทั่วไปถึงระดับโมเลกุลเทคนิค เรียลไทม์Intercalating ย้อม assays รวมละลายอุณหภูมิ (Tm) และความละเอียดสูงละลายวิเคราะห์ DNA PCR(HRM), wereappliedtoaceticacidbacterialisolatesforthefirsttime ThetargetsequenceofITSregiongeneratedค่า Tm และโพรไฟล์ HRM species-specific ได้แบ่งแยกระดับพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประชากรใน vinegars
ผลิตแบบดั้งเดิมและแม่ของกลุ่มตัวอย่างที่ได้จากน้ำส้มสายชูแอปเปิ้ลและองุ่น denaturing วัฒนธรรมอิสระลาดข่าวคราว (DGGE)
การวิเคราะห์ซึ่งเป้าหมายภูมิภาคV7-V8 ของยีน 16S rRNA แสดงให้เห็นว่า hansenii Komagataeibacter และ Komagataeibacter ยูโร /
Komagataeibacter xylinus ถูกสายพันธุ์ที่โดดเด่นที่สุดในเกือบทุกกลุ่มตัวอย่างวิเคราะห์โดยตรง
GTG วัฒนธรรมอิสระ 5 -rep PCR พิมพ์ลายนิ้วมือถูกใช้ในลักษณะเบื้องต้นของ AAB
แยกและบัตรประจำตัวสายพันธุ์ระดับได้ดำเนินการโดยลำดับของยีน16S rRNA, 16S-23S rDNA ภายใน
transcribedto thespacer (ITS) และภูมิภาค tufgene.Acetobacterokinawensiswasfrequentlyisolatedfromsamples
ที่ได้จากแอปเปิ้ลในขณะที่เคยูโรถูกระบุว่าเป็นสายพันธุ์ที่โดดเด่นตามด้วย Acetobacter
indonesiensis ในกลุ่มตัวอย่างที่มาจากองุ่น นอกจากเทคนิคโมเลกุลร่วมกันในเวลาจริงการตรวจย้อม PCR intercalating รวมทั้งอุณหภูมิหลอมเหลวดีเอ็นเอ (TM) และละลายความละเอียดสูง โปรไฟล์ HRM และค่า Tm ได้รับอนุญาตการเลือกปฏิบัติในระดับสปีชีส์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วัฒนธรรม dependentandculture independentmethodswerecombinedfortheinvestigationofaceticacidbacteria
( AAB ) ประชากรในผ้าที่ผลิตน้ำส้มสายชูและแม่ของตัวอย่างที่ได้จากแอปเปิ้ลและส้ม
องุ่น วัฒนธรรมไที่ลาด gel electrophoresis ( การทดลอง ) วิเคราะห์ ซึ่งเป้าหมาย
v7 V8 และภูมิภาคของเบส 16S rRNA ยีน