ABSTRACT: The combinatorial assembl

ABSTRACT: The combinatorial assembly of protein complexes is at the heart of chromatin biology. Lysine demethylaseLSD1(KDM1A)/CoREST beautifully exemplifies this concept. The active site of the enzyme tightly associates to the N-terminaldomain of transcription factors of the SNAIL1 family, which therefore can competitively inhibit the binding of the N-terminal tailof the histone substrate. Our enzymatic, crystallographic, spectroscopic, and computational studies reveal that LSD1/CoRESTcan bind to a hexapeptide derived from the SNAIL sequence through recognition of a positively charged α-helical turn that formsupon binding to the enzyme. Variations in sequence and length of this six amino acid ligand modulate affinities enabling the samebinding site to differentially interact with proteins that exert distinct biological functions. The discovered short peptide inhibitorsexhibit antiproliferative activities and lay the foundation for the development of peptidomimetic small molecule inhibitors ofLSD1

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นามธรรม: combinatorial การชุมนุมของโปรตีนคอมเพล็กซ์เป็นหัวใจสำคัญของโครมาติชีววิทยา ไลซีน demethylaselsd1 (kdm1a) / corest สวยงามเป็นตัวอย่างแนวคิดนี้ เว็บไซต์ที่ใช้งานของเอนไซม์แน่นร่วมกับ terminaldomain n-ถอดความปัจจัยของครอบครัว snail1 ซึ่งสามารถแข่งขันได้จึงสามารถยับยั้งผูกพันของ n-ขั้ว tailof สารตั้งต้นสโตนเอนไซม์ของเราการศึกษา crystallographic, สเปกโทรสโกและการคำนวณแสดงให้เห็นว่าผูก lsd1/corestcan ไป hexapeptide มาจากลำดับหอยทากผ่านการรับรู้ของการเปิดα-ขดลวดประจุบวกที่ formsupon ผูกพันกับเอนไซม์การเปลี่ยนแปลงในลำดับและระยะเวลาจากนี้แกนด์กรดอะมิโนที่หกปรับชอบพอทำให้เว็บไซต์ samebinding เพื่อที่แตกต่างกันมีปฏิกิริยากับโปรตีนที่ออกแรงฟังก์ชั่นที่แตกต่างกันทางชีวภาพ เปปไทด์สั้นค้นพบ inhibitorsexhibit กิจกรรมยับยั้งและวางรากฐานสำหรับการพัฒนาของ peptidomimetic ยับยั้งโมเลกุลขนาดเล็ก oflsd1

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อ: แอสเซมบลีปัญหาของโปรตีนคอมเพล็กซ์เป็นหัวใจของวิชาชีววิทยาโครมาติน DemethylaseLSD1 ไลซีน (KDM1A) / CoREST exemplifies แนวคิดนี้อย่างสวยงาม ใช้งานเว็บไซต์ของเอนไซม์นี้แน่นร่วมการ terminaldomain N ปัจจัย transcription ของ SNAIL1 ซึ่งดังนั้น สามารถสามารถแข่งขันได้ยับยั้งการรวม tailof N สถานีพื้นผิวฮิสโตน ของเอนไซม์ในระบบ crystallographic ด้าน และคำนวณศึกษาเผยออกที่ LSD1/CoRESTcan ผูกกับ hexapeptide ที่มาลำดับทากผ่านการรับรู้ของα helical กลับคิดค่าธรรมเนียมบวก formsupon ที่ผูกกับเอนไซม์นี้ เปลี่ยนแปลงลำดับและความยาวของลิแกนด์นี้กรดอะมิโนหก modulate affinities เปิดเว็บไซต์ samebinding differentially โต้ตอบกับโปรตีนที่แรงหน้าที่ทางชีวภาพแตกต่างกัน เพปไทด์สั้นพบ inhibitorsexhibit antiproliferative กิจกรรมและวางรากฐานสำหรับการพัฒนาของ ofLSD1 inhibitors โมเลกุลเล็ก peptidomimetic

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นนามธรรมชุด combinatorial ของคอมเพล็กซ์โปรตีนอยู่ที่ใจกลางของชีววิทยา chromatin . ไลซีน corest demethylaselsd 1 ( kdm 1 a )/ชะตากรรมอย่างสวยงามแนวความคิดนี้ ไซต์ที่ใช้งานอยู่ของเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับคนในครอบครัวให้แน่น N - terminaldomain ของปัจจัยการถอดสคริปต์ของหอยทาก 1 ซึ่งทำให้สามารถแข่งขันได้จะสามารถยับยั้งการทำงานของ tailof N - อาคารโดยสารที่ยึดเข้ากับฐาน histone ได้.ของเรา enzymatic , crystallographic , spectroscopic ,และนวัตกรรมเผยให้เห็นว่าการศึกษา lsd 1 / corestcan มัดกับ hexapeptide ที่มาจากหอยทากตามลำดับโดยผ่านการยอมรับของที่ชาร์จแบตเตอรี่ในเชิงบวกจากโซ - เวียนหมุนที่ formsupon มีผลผูกพันกับเอนไซม์.ความแตกต่างของความยาวและตามลำดับของหก ligand กรดอะมิโนนี้กล้ำ affinities การเปิดการใช้งานไซต์ samebinding ที่สามารถโต้ตอบกับโปรตีนที่พยายามทำหน้าที่แตกต่างกันทางชีววิทยาชนชั้นล่าง peptide ในระยะทางสั้นๆเพื่อไปพบที่ inhibitorsexhibit antiproliferative กิจกรรมและวางรากฐานในการพัฒนาของโมเลกุลขนาดเล็ก peptidomimetic oflsd 1 ผลลัพธ์โรคหลอดเลือดสมองแตก