The PCR reaction
was performed in a Techne Cyclogen Thermocycler
as follows: 30 minutes at 50°C (RT reaction); 94°C for
15 minutes (initial PCR activation); 39 three-step cycles
of 94°C for 30 sec for denaturation, 58°C for 1 minute
for annealing and 72°C for 2 minutes for extension;
72°C for 10 minutes (final extension). Since RT-PCR
reactions were carried out overnight, an additional
cycle at 4°C was also added to keep the RT-PCR
product at a stabilizing temperature.
A 1 KB Plus DNA ladder, Cat. No. 10787-018
(Invitrogen Life Technologies, USA) served as
molecular DNA size marker. Ten microlitres of RTPCR
and PCR products were analyzed by
electrophoresis on 1% Nusieve agarose (Sigma
Chemicals, Switzerland) with 2.5 mg/ml of ethidium
bromide and 1X TAE buffer (20X) (Sigma, Switzerland)
that is free of DNAase, RNAase, and proteinase. The
gels were run at 70V: cm for 1.5 h and visualized using
a UV transilluminator (Vilber Lourmat, France).
Reactions that produced the approximate
expected size DNA fragment, as determined by the
primer sets used in table (1), was considered positive.
Samples that contained no amplification product,
amplification product not of the expected size, or
smears were classified as negative.
The PCR reactionwas performed in a Techne Cyclogen Thermocycleras follows: 30 minutes at 50°C (RT reaction); 94°C for15 minutes (initial PCR activation); 39 three-step cyclesof 94°C for 30 sec for denaturation, 58°C for 1 minutefor annealing and 72°C for 2 minutes for extension;72°C for 10 minutes (final extension). Since RT-PCRreactions were carried out overnight, an additionalcycle at 4°C was also added to keep the RT-PCRproduct at a stabilizing temperature.A 1 KB Plus DNA ladder, Cat. No. 10787-018(Invitrogen Life Technologies, USA) served asmolecular DNA size marker. Ten microlitres of RTPCRand PCR products were analyzed byelectrophoresis on 1% Nusieve agarose (SigmaChemicals, Switzerland) with 2.5 mg/ml of ethidiumbromide and 1X TAE buffer (20X) (Sigma, Switzerland)that is free of DNAase, RNAase, and proteinase. Thegels were run at 70V: cm for 1.5 h and visualized usinga UV transilluminator (Vilber Lourmat, France).Reactions that produced the approximateexpected size DNA fragment, as determined by theprimer sets used in table (1), was considered positive.Samples that contained no amplification product,amplification product not of the expected size, orsmears were classified as negative.
การแปล กรุณารอสักครู่..
การตรวจปฏิกิริยา
แสดงใน techne cyclogen เทอร์มอไซเคล ์
ดังนี้ : 30 นาทีที่ 50 ° C ( ปฏิกิริยา RT ) ; 94 ° C
15 นาที ( การเริ่มต้น ) ) ; 39 3 รอบ
94 ° C เป็นเวลา 30 วินาทีสำหรับการหยุดชั่วคราว , 58 องศา C เป็นเวลา 1 นาที
สำหรับการอบและ 72 ° C เป็นเวลา 2 นาที สำหรับการส่งเสริม ;
72 ° C เป็นเวลา 10 นาที ( ส่วนขยายสุดท้าย ) เนื่องจากปฏิกิริยา RT-PCR
ศึกษาเพิ่มเติม
ค้างคืนรอบที่ 4 ° C ก็เพิ่มเพื่อให้ผลิตภัณฑ์ที่อุณหภูมิคงที่นี้
.
1 กิโลพร้อมบันไดดีเอ็นเอแมว ไม่ 10787-018
( Invitrogen ชีวิตเทคโนโลยี , USA ) ทำหน้าที่เป็นโมเลกุลขนาด
ดีเอ็นเอเครื่องหมาย 10 microlitres ผลิตภัณฑ์ rtpcr
และวิเคราะห์โดยวิธี PCR ใน 1% nusieve ( Sigma
, สารเคมี , สวิตเซอร์แลนด์ ) 2.5 มิลลิกรัม / มิลลิลิตรและโบรไมด์คู่
1 x แทบัฟเฟอร์ ( 20x ) ( ซิกม่าสวิตเซอร์แลนด์ )
ที่ฟรี dnaase rnaase , และโปรตีน .
เจลถูกเรียก 70v : 1.5 ซม. และใช้ UV ตรวจ H
transilluminator ( vilber lourmat , ฝรั่งเศส ) .
ปฏิกิริยาที่ผลิตประมาณ
คาดว่าชิ้นส่วนดีเอ็นเอขนาดตามที่กำหนดโดย
primer ชุดที่ใช้ในโต๊ะ ( 1 ) ถือว่าเป็นบวก ตัวอย่าง ที่อยู่ไม่ขยาย
ผลิตภัณฑ์
การเพิ่มปริมาณของผลิตภัณฑ์ไม่ได้คาดหวังขนาด จำแนกเป็นรอยเปื้อนหรือ
ลบ .
การแปล กรุณารอสักครู่..