2.6. Acetylcholinesterase sequencing
PCR was conducted to amplify a region of the acetylcholinesterase
(AChE) gene, since the enzyme encoded by this gene
is the target of organophosphate s. The amplified region encompasses
the two residues that have been found mutated in strains
of Culex pipiens, Cx. tritaeniorhynchus, Cx. vishnui, Anopheles gambiae
and An. albimanus resistant to organophosphates (F290V and
F455W) (Weill et al., 2004) and is located within the gene’s 5th
exon. For this assay, ten adults from F17 RecR and from Rockefeller
were analyzed. Primers (F: 5-CGATAACGAATGGGGAACG-3 and R:
5-TCAGAGGCTCACCGAACACA-3) were designed based on the full
length AChE cDNA (accession on GenBank: EF209048) using the
PrimerSelect software, available in the DNAstar package (Lasergene
7.1). These primers amplify a region of around 500 bp of the gene.
PCR conditions were: 5min at 94 ◦C, followed by 30 cycles of 1min
at 94 ◦C, 1min at 60 ◦C and 2min at 72 ◦C, with a final extension
for 10 min at 72 ◦C. PCR amplicons were purified using GFXTM PCR
DNA and Gel Band Purification (Amersham Pharmacia Biotech) and
sequenced using an ABI 3100. Sequences were edited and analyzed
through the BioEdit (version 7.0.4.1) software.
2.6 ปรุงลำดับ
PCR ได้ดำเนินการเพื่อขยายพื้นที่ของสารที่
(เจ็บ) ยีนเนื่องจากเอนไซม์เข้ารหัสโดยยีนนี้
เป็นเป้าหมายของ organophosphate ฯ ภูมิภาคขยายครอบคลุม
ตกค้างทั้งสองที่มีการพบการกลายพันธุ์ในสายพันธุ์
ของยุง pipiens, Cx tritaeniorhynchus, Cx vishnui, ยุงก้นปล่อง gambiae
และ albimanus ทนต่อ organophosphates (F290V และ
F455W) (Weill et al., 2004) และตั้งอยู่ภายในวันที่ 5 ของยีนของ
เอกซ์ซอน สำหรับการทดสอบนี้สิบผู้ใหญ่จาก F17 RecR และจาก Rockefeller
ถูกนำมาวิเคราะห์ ไพรเมอร์ (F: 5 -CGATAACGAATGGGGAACG 3 และ R:?
5 -TCAGAGGCTCACCGAACACA-3?) ได้รับการออกแบบบนพื้นฐานของเต็ม
ความยาวเจ็บยีน (ภาคยานุวัติใน GenBank: EF209048) โดยใช้
ซอฟแวร์ PrimerSelect ที่มีอยู่ในแพคเกจ DNAstar (Lasergene
7.1) ไพรเมอร์เหล่านี้ขยายพื้นที่ของประมาณ 500 bp ของยีนได้.
เงื่อนไข PCR คือ: 5 นาทีที่ 94 ◦Cตามด้วย 30 รอบของ 1min
ที่ 94 ◦C, 1min ที่ 60 ◦Cและ 2min ที่ 72 ◦C, มีนามสกุลสุดท้าย
เป็นเวลา 10 นาทีที่ 72 ◦C amplicons PCR บริสุทธิ์โดยใช้วิธี PCR GFXTM
DNA และเจลฟอกวง (Amersham Pharmacia ไบโอเทค) และ
หาลำดับการใช้ ABI 3100. ลำดับถูกแก้ไขและวิเคราะห์
ผ่าน BioEdit นี้ (เวอร์ชั่น 7.0.4.1) ซอฟแวร์
การแปล กรุณารอสักครู่..
