TRAP analysisThe design of the fixe

TRAP analysis

The design of the fixed primers for the TRAP analysis was based on I'. fernnfn ESTs using Primer Premier 5.0. Four fixed primers based on the lectin sequence (Table 3) and each of the arbitrary primers used in SRAP were tested in a pre—screening experiment. Three primer combinations were selected to address the I'. ternata genetic diversity. The PCR amplifications were based on the original literature, with each 45—ql PCR mixture consisting of 1 ›‹ PCR buffer, 1.6 mM MgCl , 0.3 mM dNTPs,
0.3 qM primers, 1.5 U Tag DNA polymerase, and 20 rig template. The amplification involved an initial denaturation step at 94 °C for 4 min, followed by 5 cycles of 94 °C for 45 s, 35 °C for 1 min, and 72 °C for 1.5 min and 35 cycles of 94 °C for 1 min, 52 °C for 1 min, and 72 °C for 1.5 min, and a final extension at 72 °C for 10 min. The detection of the PCR products was the same as in the SRAP analysis

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์กับดักการออกแบบไพรเมอร์ถาวรสำหรับการวิจับแบบฉัน ' fernnfn ESTs ใช้รองพื้น 5.0 พรีเมียร์ ทดสอบ 4 ถาวรตามลำดับการศึกษา (ตาราง 3) และแต่ละของไพรเมอร์ที่กำหนดใช้ใน SRAP ไพรเมอร์ในก่อน — ตรวจทดลอง ชุดรองพื้นสามได้เลือกฉัน ' ternata พันธุ PCR amplifications ได้ตามวรรณคดีต้นฉบับ กับ 45 แต่ละตัวผสม PCR ql ประกอบด้วยบัฟเฟอร์ PCR ›‹ 1.6 mM MgCl, dNTPs 0.3 มม. 10.3 qM ไพรเมอร์ 1.5 U แท็กดีเอ็นเอพอลิเมอเรส และเสื้อผ้า 20 แบบ ขยายที่เกี่ยวข้องที่มีขั้นตอน denaturation เริ่มต้นที่ 94 ° C สำหรับ 4 นาที ตาม ด้วย 5 รอบของ 94 ° C สำหรับ 45 s, 35 ° C ต่ำ สุด 1, 72 ° C สำหรับ 1.5 นาที และรอบ 35 94 องศาเซลเซียสใน 1 นาที 52 ° C ต่ำ สุด 1, 72 ° C สำหรับ 1.5 นาที และส่วนขยายเป็นขั้นสุดท้ายที่ 72 ° C สำหรับ 10 นาที การตรวจพบผลิตภัณฑ์ PCR เดียวกันกับการวิเคราะห์ SRAP

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

TRAP วิเคราะห์การออกแบบของไพรเมอร์คงที่สำหรับการวิเคราะห์TRAP ที่ได้รับขึ้นอยู่กับผม fernnfn ESTs ใช้รองพื้นพรีเมียร์ 5.0 สี่ไพรเมอร์คงขึ้นอยู่กับลำดับเลคติน (ตารางที่ 3) และแต่ละพลไพรเมอร์ที่ใช้ในการ SRAP ได้รับการทดสอบในการทดลองก่อนคัดกรอง สามรวมกันไพรเมอร์ได้รับการคัดเลือกไปยังที่อยู่ที่ฉัน ' ความหลากหลายทางพันธุกรรม ternata PCR เครื่องขยายเสียงอยู่บนพื้นฐานของวรรณกรรมต้นฉบับกับแต่ละ 45 ql ส่วนผสม PCR ซึ่งประกอบด้วย 1> <บัฟเฟอร์ PCR 1.6 มิลลิ MgCl 0.3 มิลลิ dNTPs, 0.3 ไพรเมอร์ QM 1.5 U แท็กดีเอ็นเอโพลิเมอร์และแม่แบบของแท่นขุดเจาะ 20 การขยายที่เกี่ยวข้องกับขั้นตอน denaturation เริ่มต้นที่ 94 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 4 นาทีตามด้วย 5 รอบ 94 ° C เป็นเวลา 45 วินาที, 35 ° C เป็นเวลา 1 นาทีและ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1.5 นาทีและ 35 รอบของ 94 ° C เป็นเวลา 1 นาที 52 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาทีและ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1.5 นาทีและนามสกุลสุดท้ายที่ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 10 นาที การตรวจสอบของผลิตภัณฑ์ PCR เป็นเช่นเดียวกับในการวิเคราะห์ SRAP

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กับดักการวิเคราะห์

ออกแบบไพรเมอร์ที่คงที่สำหรับวิเคราะห์กับดักขึ้นอยู่กับฉัน " fernnfn ฐานข้อมูลโดยใช้ไพรเมอร์ Premier 5.0 . สี่ชนิดถาวรตามลำดับ ( ตารางที่ 3 ) พบว่าไพรเมอร์ของแต่ละข้อใช้ใน srap ทดสอบก่อนการทดลอง สามผสมรองพื้นเลือกที่อยู่ฉัน ' ternata ความหลากหลายทางพันธุกรรม .ร่วม amplifications ตามวรรณกรรมต้นฉบับ กับแต่ละ 45 เข้าร่วมส่วนผสมประกอบด้วยบัฟเฟอร์ PCR PCR 1 ›‹ MgCl 1.6 มิลลิเมตร dntps 0.3 0.3 มม. , สูง 1.5 U
QM , แท็ก DNA polymerase และ 20 ใช้แม่แบบ การเพิ่มปริมาณเกี่ยวข้องกับการเริ่มต้น ( ขั้นตอนที่ 94 ° C เป็นเวลา 4 นาที ตามด้วย 5 รอบ 94 ° C เป็นเวลา 45 , 35 ° C เป็นเวลา 1 นาที , และ 72 ° C 15 นาที และ 35 รอบ 94 °องศาเซลเซียสนาน 1 นาที , 52 ° C เป็นเวลา 1 นาที , และ 72 ° C เป็นเวลา 1.5 นาที และงานสุดท้ายที่ 72 ° C 10 นาทีตรวจหาผลิตภัณฑ์ PCR เป็นเช่นเดียวกับใน srap การวิเคราะห์