Primers used for PCR and sequencing

Primers used for PCR and sequencing are listed. For amplification of 23S ribosomal gene
DNA,New100R2was used in combination of either of New061F2,New022F orNew041R2.
New100R2 is a sequence of 16S ribosomal genes which is located upstream of 22S
ribosomal gene, New061F2, New022F and New041R2 are the sequences of downstream
regions of 23S ribosomal genes. These primer pairs made it possible to amplify DNA of
about 6 kb which covers the whole gene of the respective copy of three 23S ribosomal
genes. Primers 0770FwrdHindIII and 0770RevXhoI were used to amplify 1 kb DNA which
contains the entire rluD gene and BfmS12F and BfmS12Rwere used for amplification of the
rpsL gene of 400 bp. All primers listed here were used for the sequencing of a respective
target gene, and designed by us on the basis of the whole genome sequence of B. bifidum
YIT 4007

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไพรเมอร์ใช้ PCR และลำดับที่จะแสดง สำหรับการขยายยีน ribosomal 23Sดีเอ็นเอ New100R2was ที่ใช้ในชุดของ New061F2, New022F orNew041R2New100R2 เป็นลำดับของยีน ribosomal 16S ซึ่งตั้งอยู่ต้นน้ำของ 22Sribosomal ยีน New061F2, New022F และ New041R2 มีลำดับของขั้นปลายน้ำภูมิภาคของยีน ribosomal 23S คู่นี้พื้นทำขยายดีเอ็นเอของประมาณ 6 kb ซึ่งครอบคลุมถึงยีนทั้งหมดของสำเนา 23S ribosomal สามตามลำดับยีน ใช้ขยายฐาน 1 ดีเอ็นเอไพรเมอร์ 0770FwrdHindIII และ 0770RevXhoI ซึ่งประกอบด้วยยีนทั้ง rluD และ BfmS12F และ BfmS12Rwere ที่ใช้สำหรับการขยายของการยีน rpsL ของ 400 bp ไพรเมอร์ทั้งหมดมาใช้สำหรับการจัดลำดับของความเกี่ยวข้องยีนเป้าหมาย และออกแบบ โดยเราตามลำดับทั้งจีโนมของ bifidum เกิดซิงเสียนเยอะ 4007

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไพรเมอร์ที่ใช้สำหรับการจัดลำดับวิธี PCR และมีการระบุไว้ การขยายของสำหรับ 23S
โซมอลยีนดีเอ็นเอNew100R2was ใช้ในการรวมกันของทั้งสอง New061F2, New022F orNew041R2.
New100R2 เป็นลำดับของ 16S ยีนโซมอลซึ่งตั้งอยู่เหนือ 22S
โซมอลยีน New061F2, New022F และ New041R2
มีลำดับของปลายน้ำภูมิภาคของ23S ยีนโซมอล คู่ไพรเมอร์เหล่านี้ทำให้มันเป็นไปได้ที่จะขยายดีเอ็นเอประมาณ 6 กิโลไบต์ซึ่งครอบคลุมยีนทั้งสำเนาที่เกี่ยวข้องของสาม 23S โซมอลยีน ไพรเมอร์ 0770FwrdHindIII 0770RevXhoI และถูกนำมาใช้เพื่อขยายดีเอ็นเอ 1 กิโลไบต์ซึ่งมียีนrluD ทั้งหมดและ BfmS12F และ BfmS12Rwere ใช้สำหรับการขยายของยีนrpsL 400 bp ไพรเมอร์ทั้งหมดไว้ที่นี่ถูกนำมาใช้สำหรับการจัดลำดับของแต่ละยีนเป้าหมายและการออกแบบโดยเราบนพื้นฐานของลำดับจีโนมทั้งหมดของ B. bifidum YIT 4007

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไพรเมอร์ใช้วิธี PCR และลำดับอยู่ เพื่อเพิ่มปริมาณยีนไรโบโซมอลดีเอ็นเอ new100r2was 23s
, ใช้ในการรวมกันของทั้งสอง new061f2 new022f , ornew041r2 .
new100r2 เป็นลำดับ 16S ไรโบโซมอล ยีนซึ่งอยู่ต้นน้ำของยีนไรโบโซมอล new061f2 22s
, , และ new022f new041r2 เป็นลำดับต่อเนื่อง
ภูมิภาค 23s ไรโบโซมอล ยีนคู่ไพรเมอร์เหล่านี้ทำให้มันเป็นไปได้ที่จะขยาย DNA ของ
6 KB ซึ่งครอบคลุมยีนทั้งหมดของสำเนาที่เกี่ยวข้อง 3 23s ไรโบโซมอล
ยีน ไพรเมอร์และ 0770fwrdhindiii 0770revxhoi ถูกใช้เพื่อขยาย 1 กิโลดีเอ็นเอซึ่งมีทั้งยีนและ rlud
bfms12f bfms12rwere และใช้สำหรับการเพิ่ม
rpsl ยีน 400 BP .ทั้งหมดนี่เป็นวิธีที่ใช้สำหรับการจัดลำดับของยีนเป้าหมายที่เกี่ยวข้อง
, และออกแบบโดยเราบนพื้นฐานของทั้งจีโนมลำดับ bifidum
yit 4007 B