After the completion of the rice ge

After the completion of the rice genome sequencing project, Rice Gene Discovery Unit aim to use the bioinformatics software, and database for discovery rice genes, which responsible for the economic trait such as the submergence tolerance, salt tolerance, disease resistances, and so on. To discover those important rice genes, RiceGeneThresher, a public resource for the rice genomic and bioinformatics software and platform, has been developed. RiceGeneThresher funded by the National Center for Genetic Engineering and Biotechnology (BIOTEC), Thailand. The objective of developing RiceGeneThresher is to provide rice researchers as well as breeders an expert and database management system for gene discovery by providing full access to integrated multiplatform relational database of heterogeneous rice genome resource for decision-making and candidate gene selection. Since the post-genome era up coming, we are generating expression data from many experiments by using rice Affymetrix GeneChip (www.affymetrix.com). RiceGeneThresher also aim to provide analysis tool for analyzing microarray analysis by using the Bioconductor set of software. Recently, we also released the tool for discovery the single-feature polymorphism analysis (SFP) by using rice Affymetrix GeneChip.

About Project

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หลังเสร็จสิ้นโครงการลำดับกลุ่มข้าว ข้าวยีนค้นพบหน่วยจุดมุ่งหมายเพื่อใช้ซอฟต์แวร์ bioinformatics และฐานข้อมูลสำหรับค้นหายีนข้าว ซึ่งชอบติดเศรษฐกิจเช่น submergence ยอมรับ ยอมรับเกลือ ความต้านทานโรค และอื่น ๆ การค้นพบยีนที่สำคัญข้าว RiceGeneThresher ทรัพยากรสาธารณะข้าว genomic ซอฟต์แวร์ bioinformatics และแพ ลตฟอร์ม ได้รับการพัฒนา RiceGeneThresher สนับสนุน โดยแห่งชาติศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพ (BIOTEC), ประเทศไทย วัตถุประสงค์ของการพัฒนา RiceGeneThresher เพื่อ ให้นักวิจัยข้าวเป็นบรีดเดอร์สเป็นระบบจัดการฐานข้อมูลและผู้เชี่ยวชาญสำหรับการค้นพบยีน โดยการให้เข้าถึงฐานข้อมูลเชิงสัมพันธ์หลายแพลตฟอร์มรวมของข้าวแตกต่างกันกลุ่มทรัพยากรสำหรับการตัดสินใจและผู้สมัครเลือกยีนได้ ตั้งแต่ยุคหลังจีโนมขึ้นมา เราจะสร้างข้อมูลนิพจน์จากหลายการทดลอง โดยใช้ข้าว Affymetrix GeneChip (www.affymetrix.com) RiceGeneThresher ยังมุ่งให้เครื่องมือวิเคราะห์สำหรับการวิเคราะห์วิเคราะห์ microarray โดยชุด Bioconductor ของซอฟแวร์ เมื่อเร็ว ๆ นี้ เรายังปล่อยเครื่องมือสำหรับการค้นพบการวิเคราะห์เดียวคุณสมบัติโพลีมอร์ฟิซึม (SFP) โดยข้าว Affymetrix GeneChip เกี่ยวกับโครงการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หลังจากเสร็จสิ้นการโครงการลำดับจีโนมข้าว, การค้นพบยีนข้าวหน่วยมุ่งมั่นที่จะใช้ซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศและฐานข้อมูลสำหรับการค้นพบยีนข้าวซึ่งรับผิดชอบในการลักษณะทางเศรษฐกิจเช่นทนน้ำท่วม, ทนเค็ม, ความต้านทานโรคและอื่น ๆ การค้นพบเหล่านั้นยีนข้าวที่สำคัญ RiceGeneThresher ทรัพยากรสาธารณะสำหรับจีโนมข้าวและชีวสารสนเทศและแพลตฟอร์มซอฟต์แวร์ได้รับการพัฒนา ได้รับการสนับสนุน RiceGeneThresher โดยศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพ (ไบโอเทค), ไทย วัตถุประสงค์ในการพัฒนา RiceGeneThresher คือการให้นักวิจัยข้าวเช่นเดียวกับพ่อพันธุ์แม่พันธุ์ผู้เชี่ยวชาญและระบบการจัดการฐานข้อมูลสำหรับการค้นพบยีนโดยการให้การเข้าถึงฐานข้อมูลเชิงสัมพันธ์แบบบูรณาการที่หลากหลายของทรัพยากรจีโนมข้าวที่แตกต่างกันสำหรับการตัดสินใจและการเลือกผู้สมัครของยีน ตั้งแต่ยุคโพสต์จีโนมขึ้นมาเราจะสร้างข้อมูลการแสดงออกจากการทดลองจำนวนมากโดยใช้ข้าว Affymetrix GeneChip (www.affymetrix.com) RiceGeneThresher ยังมุ่งมั่นที่จะให้เครื่องมือในการวิเคราะห์สำหรับการวิเคราะห์การวิเคราะห์ microarray โดยใช้ชุด Bioconductor ของซอฟต์แวร์ เร็ว ๆ นี้เรายังปล่อยเครื่องมือสำหรับการค้นพบการวิเคราะห์ความแตกต่างเดียวคุณลักษณะ (SFP) โดยใช้ข้าว Affymetrix GeneChip. เกี่ยวกับโครงการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หลังจากเสร็จสิ้นการโครงการจีโนมข้าว หน่วยการค้นพบยีนข้าวจุดมุ่งหมายการใช้ชีวสารสนเทศซอฟต์แวร์และฐานข้อมูลสำหรับการค้นพบยีนข้าว ซึ่งรับผิดชอบในลักษณะทางเศรษฐกิจ เช่น ดำน้ำทนเกลือ ความอดทน , ความต้านทานโรค , และดังนั้นบน การค้นพบที่สำคัญ ricegenethresher ยีน , ข้าว ,ทรัพยากรสาธารณะสำหรับข้าวและรสนจีโนมซอฟต์แวร์และแพลตฟอร์มที่ได้รับการพัฒนา ricegenethresher สนับสนุนโดยศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ( ไบโอเทค ) , ประเทศไทยวัตถุประสงค์ของการพัฒนา ricegenethresher ให้นักวิจัยข้าว ตลอดจนนักผู้เชี่ยวชาญและระบบการจัดการฐานข้อมูลสำหรับการค้นพบยีน โดยการให้การเข้าถึงแบบเต็มเพื่อบูรณาการระบบปฏิบัติการฐานข้อมูลทรัพยากรพันธุกรรมข้าวเพื่อการตัดสินใจในการเลือกที่แตกต่างกันของผู้สมัคร ตั้งแต่ยุคหลังจีโนมขึ้นมาเราจะสร้างข้อมูลการแสดงออก จากการทดลองหลาย โดยใช้ข้าว affymetrix genechip ( www.affymetrix . com ) ricegenethresher ยังมุ่งที่จะให้เครื่องมือในการวิเคราะห์สำหรับการวิเคราะห์การวิเคราะห์โดยใช้ bioconductor ชุดซอฟต์แวร์ เมื่อเร็วๆ นี้ เรา ยังได้เปิดตัวเครื่องมือสำหรับการค้นพบและคุณลักษณะเดียว ) การวิเคราะห์ ( SFP ) โดยใช้ข้าว affymetrix genechip .


เกี่ยวกับโครงการ