model ABI 3100 sequencer using the

model ABI 3100 sequencer using the Taq dideoxy
terminator sequencing method (SeqLab, Germany).
Individual sequence fragments were assembled using
Seqman software (www.dnastar.com).
The 1.8 kb sequence of the 16S rRNA gene and
16S/23S rDNA spacer region from ROWBp-U has
been deposited in GenBank under accession number
EU886968, while 1.25 kb sequence (partial sequences)
of the 16S rRNA gene of ROWBp-T (1,102
nucleotides) and AlWBp-U (1,107 nucleotides) were
deposited under FJ788515 and FJ788514, respectively.
The 16S rRNA gene sequence of ROWBp-U,
ROWBp-T, and AlWB-U were aligned by ClustalW2
(http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html),
after having refined them to the same length, with
those of other phytoplasma strains available in
Genbank. 16S rRNA sequence of ROWBp-U,
ROWBp-T and AlWBp-U showed 99% identity
among each other, and with Black-eyed Susan
phyllody (DQ855286), a phytoplasma reported from
Iran, and classified as a 16SrI-A group member.
ROWBp-U showed the highest sequence identity
(99%) with Epilobium phyllody (AY101386), Dog
fennel yellows (DQ381534), and periwinkle virescence
phytoplasmas (DQ381535).
Samples from the following weed species growing
around the infected trees in Urmia tested negative for
phytoplasmas: Cynodon dactylon, Malva sylvestris,
Polygonium aviculare, Sorghum halepense and Tragopogon
pretense. Tomato samples showing big-bud
symptoms and growing in the same area carried a
phytoplasma belonging the clover proliferation group
(16SrVI-A) (unpublished). We did not detect any
other phytoplasmas in our samples.
In Iran, 16SrI phytoplasmas (aster yellows group)
have been detected in association with little leaf of
periwinkle, phyllody of oilseed rape (Salehi et al.
2005), yellows of spinach, virescence of canola

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รุ่น ABI 3100 sequencer ใช้ Taq dideoxyวิธีการจัดลำดับเทอร์มิเนเตอร์ (SeqLab เยอรมนี)ลำดับแต่ละชิ้นส่วนถูกประกอบโดยใช้ซอ Seqman (www.dnastar.com)ลำดับ 1.8 kb ของ 16S rRNA ยีน และภูมิภาคเป็นตัวเว้นวรรค 16S/23S rDNA จาก ROWBp U ได้รับฝากไว้ใน GenBank ภายใต้หมายเลขทะเบียนEU886968 ในขณะที่ลำดับ 1.25 kb (ลำดับบางส่วน)ของยีนใน rRNA 16S ของ ROWBp-T (1,102นิวคลีโอไทด์) และ AlWBp U (1,107 นิวคลีโอไทด์) ได้ฝาก FJ788514 และ FJ788515 ตามลำดับลำดับ 16S rRNA ยีนของ ROWBp UROWBp T และ AlWB U ถูกจัด โดย ClustalW2(http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html),หลังจากมีบริสุทธิ์พวกเขาระยะเวลาเดียวกัน มีของสายพันธุ์ phytoplasma อื่น ๆ ในGenbank 16S rRNA ลำดับของ ROWBp UROWBp-T และ AlWBp U แสดงให้เห็นตัวตน 99%แต่ละคน และศิริรัตน์ Black-eyedphyllody (DQ855286), phytoplasma ที่รายงานจากอิหร่าน และจัดเป็นสมาชิกกลุ่ม 16SrI AROWBp U แสดงให้เห็นว่าตัวลำดับสูงสุด(99%) ด้วย Epilobium phyllody (AY101386), สุนัขยี่หร่าออก (DQ381534), และ periwinkle นิทรรศการสีเขียวphytoplasmas (DQ381535)ตัวอย่างจากการต่อวัชพืชพันธุ์เติบโตรอบ ๆ ต้นไม้ติดไวรัสใน Urmia ทดสอบค่าลบสำหรับphytoplasmas: หญ้าแพรก Malva sylvestrisPolygonium aviculare ข้าวฟ่าง halepense และ Tragopogonสนิท มะเขือเทศตัวอย่างแสดงใหญ่บัดอาการและการเติบโตในพื้นที่เดียวกันดำเนินการของกลุ่มขยายตัวโคล phytoplasma(16SrVI-A) (ยกเลิกประกาศ) เราไม่พบใด ๆอื่น ๆ phytoplasmas ในตัวอย่างของเราในอิหร่าน 16SrI phytoplasmas (สเตอร์ออกกลุ่ม)ได้พบกับใบไม้เล็ก ๆperiwinkle, phyllody ของ oilseed rape (Salehi et alออก 2005), ผักขม นิทรรศการสีเขียวของคาโนลา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปแบบ Abi 3100 ซีเควนใช้แท็ค dideoxy
คนเหล็กวิธีจัดลำดับ ( seqlab , เยอรมนี )

แต่ละลำดับชิ้นส่วนถูกประกอบใช้ซอฟต์แวร์ seqman ( www.dnastar . com )
1.8 กิโลไบต์ลำดับเบส 16S rRNA ยีน 16S rDNA spacer
/ 23s เขต rowbp-u ได้
ถูกฝากในการพบภายใต้หมายเลข
eu886968 ในขณะที่ 1.25 KB ลำดับ ( ลำดับบางส่วน )
ของเบส 16S rRNA ยีนของ rowbp-t ( 1102
nucleotides ) และ alwbp-u ( มีนิวคลีโอไทด์ )
ฝากภายใต้ fj788515 และ fj788514 ตามลำดับ ลำดับเบส 16S rRNA ยีน

rowbp-u rowbp-t , และ alwb-u ชิดโดย clustalw2
( http : / / www.ebi . ac.uk / เครื่องมือ / clustalw2 / index . html )
หลังจากการกลั่น , พวกเขาไปที่ความยาวเดียวกันกับ
ของอื่น ๆไฟโตพลาสมาสายพันธุ์ที่มีอยู่ใน
ขนาด .16S rRNA ลำดับ rowbp-u

, rowbp-t alwbp-u แสดงเอกลักษณ์และ 99% ของแต่ละอื่น ๆและกับ Black Eyed Susan
phyllody ( dq855286 ) , ไฟโตพลาสมา รายงานจาก
อิหร่าน และจัดเป็นสมาชิกกลุ่ม 16sri-a .
rowbp-u พบสูงสุดลำดับเอกลักษณ์
( 99% ) ด้วย epilobium phyllody ( ay101386 ) สีเหลืองยี่หร่าสุนัข
( dq381534 ) และแพงพวย virescence

phytoplasmas ( dq381535 )ตัวอย่างต่อไปนี้ของวัชพืชเติบโต
รอบต้นไม้ที่ติดเชื้อในอูร์เมียทดสอบลบ
phytoplasmas : หญ้าแพรก sylvestris ลูกสำรอง , ,
polygonium aviculare halepense ข้าวฟ่างและ tragopogon
, การเสแสร้ง ตัวอย่างมะเขือเทศแสดงอาการเพื่อน
ที่ใหญ่และเติบโตในพื้นที่เดียวกันถือ
เชื้อไฟโตพลาสมาของโคล ขยายกลุ่ม
( 16srvi-a ) ( พิมพ์ ) เราไม่ได้ตรวจพบ
phytoplasmas อื่น ๆ ในตัวอย่างของเรา .
ในอิหร่าน 16sri phytoplasmas ( แอสเตอร์สีเหลืองกลุ่ม )
ได้รับการตรวจพบในสมาคม มีใบเล็กของ
หอยขม phyllody ของ , oilseed ข่มขืน ( ซาเลฮิ et al .
2005 ) , สีเหลืองของผักโขม virescence ของคาโนล่า