Essentially, the aim of molecular d

Essentially, the aim of molecular docking is to give a prediction of the ligand-receptor
complex structure using computation methods. Docking can be achieved through two
interrelated steps: first by sampling conformations of the ligand in the active site of the
protein; then ranking these conformations via a scoring function. Ideally, sampling
algorithms should be able to reproduce the experimental binding mode and the scoring
function should also rank it highest among all generated conformations. From these two
perspectives, we give a brief overview of basic docking theory.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หลัก เทียบโมเลกุลเป้าหมายคือการ ให้การคาดการณ์ของลิแกนด์ตัวรับใช้วิธีการคำนวณโครงสร้างซับซ้อน เทียบสามารถทำได้ถึงสองขั้นตอนที่สัมพันธ์กัน: แรกเชน conformations ของลิแกนด์ในไซต์ใช้งานอยู่โปรตีน แล้ว จัดอันดับเหล่านี้ conformations ผ่านฟังก์ชันให้คะแนน เชิญ การสุ่มตัวอย่างอัลกอริทึมจะสร้างโหมดทดลองผูกและการให้คะแนนฟังก์ชันควรยังจัดอันดับได้สูงสุด conformations ที่สร้างขึ้นทั้งหมด จากสองมุมมอง เราให้อธิบายภาพรวมของทฤษฎีพื้นฐานเทียบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โดยพื้นฐานแล้วจุดมุ่งหมายของการเชื่อมต่อโมเลกุลคือการให้การคาดการณ์ของแกนด์-รับ
โครงสร้างที่ซับซ้อนโดยใช้วิธีการคำนวณ เชื่อมต่อสามารถทำได้ผ่านสอง
ขั้นตอนสัมพันธ์: เป็นครั้งแรกโดยการสุ่มตัวอย่าง conformations แกนด์ในเว็บไซต์ที่ใช้งานของ
โปรตีน แล้วจัดอันดับ conformations เหล่านี้ผ่านทางฟังก์ชั่นการให้คะแนน จะเป็นการดีที่สุ่มตัวอย่าง
ขั้นตอนวิธีการควรจะสามารถที่จะทำซ้ำโหมดผูกพันทดลองและการให้คะแนน
การทำงานนอกจากนี้ยังควรอันดับที่สูงที่สุดในบรรดา conformations สร้างทั้งหมด จากทั้งสอง
มุมมองที่เราจะให้ภาพรวมคร่าวๆของทฤษฎีการเชื่อมต่อพื้นฐาน