Biomarkers are proteins or other co

Biomarkers are proteins or other components of a clinical sample whose measured intensity alters in response to a biological change such as an infection or disease, and which may therefore be useful for prediction and diagnosis. Proteomics is the science of discovering, identifying and understanding such components using tools such as mass spectrometry. In this paper we aim to provide a concise overview of designing and conducting an MS proteomics study in such a way as to allow statistical analysis that may lead to the discovery of novel markers. We provide a summary of the various stages that make up such an experiment, highlighting the need for experimental goals to be decided upon in advance. We discuss issues in experimental design at the sample collection stage, and good practice for standardising protocols within the proteomics laboratory. We then describe approaches to the data mining stage of the experiment, including the processing steps that transform a raw mass spectrum into a useable form. We propose a permutation-based procedure for determining the significance of reported error rates. Finally, because of its advantage in speed and low cost, we suggest that MS proteomics may be a good candidate for an early primary screening approach to disease diagnosis, identifying areas of risk and making referrals for more specific tests without necessarily making a diagnosis in its own right. Our discussion is illustrated with examples drawn from experiments on bovine blood serum designed to pinpoint novel biomarkers for bovine tuberculosis

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Biomarkers มีโปรตีนหรือส่วนประกอบอื่น ๆ ของตัวอย่างทางคลินิกที่มีความรุนแรงวัดได้เปลี่ยนแปลงในการตอบสนองการเปลี่ยนแปลงทางชีวภาพเช่นการติดเชื้อหรือโรค และซึ่งอาจไม่มีประโยชน์สำหรับการคาดเดาและวินิจฉัย โปรตีโอมิกส์คือ ศาสตร์ของการค้นหา การระบุ และทำความเข้าใจเกี่ยวกับส่วนประกอบเช่นใช้เครื่องมือเช่นรเมท ในเอกสารนี้จะให้ภาพรวมกระชับออกแบบ และโปรตีโอมิกส์ MS มีการดำเนินการศึกษาในลักษณะที่จะช่วยให้การวิเคราะห์ทางสถิติที่อาจนำไปสู่การค้นพบเครื่องหมายนวนิยาย เราจะสรุปของขั้นตอนต่าง ๆ ที่ทำการทดสอบดังกล่าว เน้นความต้องการเป้าหมายที่ทดลองจะถูกตัดสินเมื่อล่วง เราพูดคุยเกี่ยวกับปัญหาในการออกแบบการทดลองที่ระยะการเก็บตัวอย่าง และการปฏิบัติที่ดีสำหรับโพรโทคองในภายในห้องปฏิบัติการโปรตีโอมิกส์ เราแล้วอธิบายวิธีการขั้นตอนการทำเหมืองข้อมูลของทดลอง รวมทั้งขั้นตอนการประมวลผลที่เปลี่ยนวัตถุดิบมวลคลื่นความลงในแบบฟอร์มที่ใช้สอย เรานำเสนอขั้นตอนการเรียงสับเปลี่ยนตามการกำหนดความสำคัญของการรายงานข้อผิดพลาดอัตรา ในที่สุด เนื่องจากความได้เปรียบในความเร็วและต้นทุนต่ำ เราแนะนำว่า โปรตีโอมิกส์ MS อาจมีผู้สมัครที่ดีสำหรับวิธีการคัดกรองหลักต้นเพื่อวินิจฉัยโรค การระบุพื้นที่เสี่ยง และการอ้างอิงสำหรับการทดสอบที่เฉพาะเจาะจงมากขึ้นโดยไม่จำเป็นต้องทำการวินิจฉัยตนเอง ข้อมีภาพประกอบ ด้วยตัวอย่างที่มาจากการทดลองในซีรั่มเลือดวัวที่ออกแบบมาเพื่อระบุ biomarkers นวนิยายสำหรับวัณโรควัว

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Biomarkers เป็นโปรตีนหรือส่วนประกอบอื่น ๆ ของตัวอย่างทางคลินิกที่มีความเข้มเปลี่ยนแปลงในการตอบสนองการเปลี่ยนแปลงทางชีวภาพเช่นการติดเชื้อหรือโรคที่วัดได้และดังนั้นจึงอาจเป็นประโยชน์สำหรับการคาดการณ์และการวินิจฉัย โปรตีนเป็นวิทยาศาสตร์ของการค้นพบ, การระบุและการทำความเข้าใจองค์ประกอบดังกล่าวโดยใช้เครื่องมือเช่น spectrometry มวล ในบทความนี้เรามุ่งมั่นที่จะให้ภาพรวมที่รัดกุมของการออกแบบและดำเนินการศึกษาโปรตีน MS ในลักษณะเช่นเพื่อให้การวิเคราะห์ทางสถิติที่อาจนำไปสู่​​การค้นพบของเครื่องหมายนวนิยาย เราให้บทสรุปของขั้นตอนต่างๆที่ทำขึ้นทดสอบดังกล่าวเป็นไฮไลต์ความจำเป็นสำหรับเป้าหมายการทดลองกับการตัดสินใจล่วงหน้า เราหารือเกี่ยวกับประเด็นในการออกแบบการทดลองในขั้นตอนการเก็บตัวอย่างและการปฏิบัติที่ดีสำหรับมาตรฐานโปรโตคอลภายในห้องปฏิบัติการโปรตีน จากนั้นเราจะอธิบายถึงวิธีการขั้นตอนการทำเหมืองข้อมูลของการทดลองรวมถึงขั้นตอนการประมวลผลที่เปลี่ยนคลื่นความถี่มวลดิบให้เป็นรูปแบบที่สามารถใช้ได้ เรานำเสนอขั้นตอนการเปลี่ยนแปลงที่ใช้สำหรับการกำหนดความสำคัญของการรายงานอัตราการเกิดข้อผิดพลาด ในที่สุดเพราะความได้เปรียบในความเร็วและต้นทุนต่ำเราขอแนะนำให้ MS โปรตีนอาจจะเป็นผู้สมัครที่ดีสำหรับวิธีการตรวจคัดกรองในช่วงต้นหลักในการวินิจฉัยโรคการระบุพื้นที่ของความเสี่ยงและทำให้การอ้างอิงสำหรับการทดสอบเฉพาะเจาะจงมากขึ้นโดยไม่จำเป็นต้องวินิจฉัยในของมัน สิทธิของตัวเอง การสนทนาของเราจะมีภาพประกอบด้วยตัวอย่างมาจากการทดลองในเลือดวัวที่ออกแบบมาเพื่อระบุ biomarkers นวนิยายสำหรับวัววัณโรค

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ซึ่งเป็นโปรตีน หรือส่วนประกอบอื่น ๆของทางวัดตัวอย่างที่มีความเปลี่ยนแปลงในการตอบสนองการเปลี่ยนแปลงทางชีวภาพ เช่น มีการติดเชื้อหรือโรค ซึ่งจะเป็นประโยชน์ในการทำนาย ดังนั้น และการวินิจฉัยโรค โปรตีโอมิกส์เป็นวิทยาศาสตร์ของการค้นพบ , การระบุและเข้าใจส่วนประกอบ เช่น การใช้เครื่องมือ เช่น แมสสเปกโทรเมตรี ในกระดาษนี้เรามุ่งหวังที่จะให้ภาพรวมที่กระชับ และทำการศึกษาออกแบบนางสาวโอมิกส์ในลักษณะที่จะช่วยให้สถิติที่อาจนำไปสู่การค้นพบตำแหน่งใหม่ เราให้ภาพรวมของขั้นตอนต่าง ๆให้มากขึ้น เช่น การทดลอง การเน้นความต้องการเป้าหมายทดลองต้องตัดสินใจล่วงหน้า เราหารือเกี่ยวกับปัญหาในการออกแบบการทดลองในการเก็บตัวอย่างขั้นตอนและแนวปฏิบัติที่ดีสำหรับ standardising แสดงโปรโตคอลภายในห้องปฏิบัติการ จากนั้นเราจะอธิบายวิธีการการทำเหมืองข้อมูลขั้นตอนของการทดลอง รวมถึงการประมวลผล ขั้นตอนที่แปลงสเปกตรัมมวลดิบลงในแบบฟอร์มซึ่งใช้ได้ เรานำเสนอการเปลี่ยนแปลงขั้นตอนพื้นฐานสำหรับการกำหนดความสำคัญของรายงานอัตราความผิดพลาด ในที่สุด เพราะข้อดีของความเร็วและราคาต่ำ เราแนะนำให้คุณแสดงอาจเป็นผู้สมัครที่ดีสำหรับการคัดกรองก่อน วิธีการวินิจฉัยโรค การระบุพื้นที่เสี่ยงและการส่งต่อสำหรับการทดสอบที่เฉพาะเจาะจงมากขึ้น โดยไม่จําเป็นต้องทําการวินิจฉัยในสิทธิของตนเอง การสนทนาของเราจะแสดงด้วยตัวอย่างที่ได้มาจากการทดลองในซีรั่มเลือดวัวที่ออกแบบมาเพื่อระบุซึ่งนวนิยายวัณโรควัว