b) Phylogenetic analysis of the 18S

b) Phylogenetic analysis of the 18S and ITS1 rDNA se- quences To identify the nearest phylogenetic neighbors, each partial sequence of 18S and ITS1 rDNA genes from yeast strains TB2-1 and TW1-3, was compared to sequences in the NCBI GenBank database (www.ncbi.nlm.nih.gov) us- ing the homology search tool (blastn) (Altschul et al., 1997). To produce phylogenetic trees, sequences were aligned us- ing the CLUSTAL W multiple sequence alignment program (version 1.81) (Thompson et al., 1994) and edited manually. Alignments were performed using several yeasts that were closely related to yeast strains TB2-1 and TW1-3, based on information obtained using the BLAST search. Phylogenetic trees were constructed using MEGA, version 3.1 (Kumar et al., 2004).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขการวิเคราะห์ phylogenetic 18S และ ITS1 rDNA se-quences เพื่อระบุการบ้าน phylogenetic แต่ละลำดับบางส่วน 18S และยีน rDNA ITS1 จากยีสต์ TB2-1 และ TW1-3 ถูกเปรียบเทียบกับลำดับในการ NCBI GenBank ฐานข้อมูล (www.ncbi.nlm.nih.gov) เรา-ไอเอ็นจี homology ค้นหาเครื่องมือ (blastn) (Altschul และ al., 1997) การผลิตต้นไม้ phylogenetic ลำดับถูกจัดตำแหน่งเรา-ไอเอ็นจี CLUSTAL W โปรแกรมหลายลำดับตำแหน่ง (รุ่น 1.81) (ทอมร้อยเอ็ด al., 1994) และแก้ไขด้วยตนเอง จัดแนวที่ดำเนินการโดยใช้ yeasts หลายที่ใกล้ชิดเกี่ยวข้องกับยีสต์ TW1-3 ตามข้อมูลที่ได้รับโดยใช้การค้นหาระเบิดและ TB2-1 ต้นไม้ phylogenetic ถูกสร้างโดยใช้ร็อค เวอร์ชัน 3.1 (Kumar et al., 2004)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข) การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของ 18S rDNA และ ITS1 quences เลือกใช้เพื่อระบุสายวิวัฒนาการเพื่อนบ้านที่ใกล้ที่สุดของแต่ละลำดับบางส่วนของยีน 18S และ ITS1 rDNA จากยีสต์ TB2-1 และ TW1-3 ถูกเมื่อเทียบกับลำดับในฐานข้อมูล NCBI GenBank ( www.ncbi.nlm.nih.gov) สหรัฐไอเอ็นจีเครื่องมือค้นหาที่คล้ายคลึงกัน (ไทด์) (Altschul et al., 1997) ในการผลิตต้นไม้ลำดับถูกจัดชิดบนจอภาพ W โปรแกรม CLUSTAL ลำดับหลายจัดตำแหน่ง (รุ่น 1.81) (ธ อมป์สัน et al., 1994) และแก้ไขด้วยตนเอง การจัดแนวถูกดำเนินการโดยใช้หลายยีสต์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับสายพันธุ์ยีสต์ TB2-1 และ TW1-3 อยู่บนพื้นฐานของข้อมูลที่ได้รับโดยใช้การค้นหาระเบิด ต้นไม้ที่ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ MEGA, รุ่น 3.1 (Kumar et al., 2004)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข ) การวิเคราะห์ phylogenetic 18S rDNA และของ its1 เซ - quences ระบุเพื่อนบ้านที่ใกล้ที่สุด ซึ่งแต่ละส่วนของ its1 rDNA ยีน 18S ลำดับและจากสายพันธุ์ยีสต์และ tb2-1 tw1-3 ถูกเปรียบเทียบกับลำดับใน ncbi ขนาดฐานข้อมูล ( www.ncbi . nlm . NIH . gov ) เรา - ไอเอ็นจีเป็นเครื่องมือค้นหา ( blastn ) ( แอลเชิล et al . , 1997 ) สร้าง phylogenetic ต้นไม้ ,ลำดับ ชิดเรา - ing clustal W หลายลำดับการโปรแกรม ( รุ่น 1.81 ) ( Thompson et al . , 1994 ) และแก้ไขด้วยตนเอง การใช้ยีสต์จำนวนต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ยีสต์และ tb2-1 tw1-3 ตามข้อมูลที่ได้โดยใช้การค้นหาระเบิด ต้นไม้ซึ่งถูกสร้างโดยใช้ร็อค รุ่น 3.1 ( Kumar et al . , 2004 ) .