SUMMARY OF การประดิษฐ์
The การประดิษฐ์นี้ relates to a วิธี or process of characterizing a สายพันธุ์ of IBV,
CSFV or NDV ซึ่งประกอบรวมด้วย the steps of: a) generating a cDNA from the virus สายพันธุ์; b) exposing the cDNA to a primer pair ซึ่งประกอบรวมด้วย a forward primer and a reverse primer in a real-time
polymerase chain reaction (PCR) to yield an amplicon, wherein the primer pair is specific to a gene or region of the viral genome; c) performing วีวี (HRM) curve analysis on a double-stranded product ซึ่งประกอบรวมด้วย the amplicon immediately after the real-time PCR; and d) analyzing and comparing the HRM curve thereby characterizing the virus สายพันธุ์. The gene for IBV may be the S1 gene. The gene for NDV may be the F, NP, P, M, HN or L gene. The region for CSFV may be the four structural (C, Ems, El and E2) or eight non-structural protein (Npro, P7, NS2, NS3, NS4A, NS4B, NS5A and NS5B) region.
The การประดิษฐ์นี้ also provides primers and kits for use with such วิธี.
BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS
The following detailed description, given by way of example, but not intended to limit the การประดิษฐ์ solely to the specific embodiments described, may be best understood in
conjunction with the accompanying drawings, in which:
รูป 1 is a table identifying the SEQ ID NO assigned to each DNA and protein sequence.
รูป 2 depicts the sensitivity assay of real-time PCR for IBV.
รูป 3 depicts the amplification curve of IB-QX to show specificity.
รูป 4 shows the melting peak of IB-QX to show specificity.
รูป 5 depicts the S1 sequence of IB-QX and blast results.
รูป 6 shows the sequence comparison results.
รูป 7 shows the sequence identity percentage of IBV สายพันธุ์.
รูป 8 depicts the HRM analysis of IB-QX, IBnC90, Mass and 793/B สายพันธุ์. รูป 9 depicts the HRM analysis of IB-QX and IBnC90 สายพันธุ์.
รูป 10 illustrates the sequence of LBK สายพันธุ์ (CSFV) and the blast results.
สรุปการประดิษฐ์การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับวิธีการหรือกระบวนการของการกำหนดลักษณะของสายพันธุ์ของ IBVซึ่งประกอบรวมด้วย CSFV หรือ NDV ขั้นตอน: การ) สร้าง cDNA เป็นจากไวรัสสายพันธุ์ ขเปิดเผย cDNA จะซึ่งประกอบรวมด้วยคู่กับรองพื้นรองพื้นไปข้างหน้าและรองพื้นกลับในแบบเรียลไทม์ พอลิเมอเรสปฏิกิริยาลูกโซ่ (PCR) ให้เป็น amplicon นั้นคู่รองพื้นโดยเฉพาะยีนหรือภูมิภาคของกลุ่มไวรัส c) ทำการวิเคราะห์โค้งวีวี (HRM) ซึ่งประกอบรวมด้วยขนคู่ผลิตภัณฑ์ amplicon ทันทีหลังจาก PCR จริง และ d) วิเคราะห์ และเปรียบเทียบ HRM เส้นโค้งจึงกำหนดลักษณะสายพันธุ์ไวรัส ยีนสำหรับ IBV ได้ยีน S1 ยีนสำหรับ NDV ได้ยีน F, NP, P, M, HN หรือ L ภูมิภาคสำหรับการ CSFV อาจโครงสร้างสี่ (C, Ems เอล และ E2) หรือภูมิภาค (Npro, P7, NS2, NS3, NS4A, NS4B, NS5A และ NS5B) แปดไม่ใช่โครงสร้างโปรตีนการประดิษฐ์นี้ยังให้ไพรเมอร์และชุดสำหรับใช้กับวิธีดังกล่าวคำอธิบายโดยย่อของวาดต่อไปนี้รายละเอียดคำอธิบาย กำหนดให้ใช้ตัวอย่าง แต่ไม่จำเป็นต้องจำกัดการประดิษฐ์เพื่อ embodiments เฉพาะที่อธิบาย อาจทำให้เข้าใจส่วนใน ร่วมกับรูปวาดมา ซึ่ง:รูปที่ 1 เป็นตารางระบุเลขรหัสลำดับที่กำหนดให้กับแต่ละลำดับดีเอ็นเอและโปรตีนรูปที่ 2 แสดงให้เห็นการวิเคราะห์ความไวของ PCR แบบเรียลไทม์สำหรับ IBVรูปที่ 3 แสดงให้เห็นเส้นโค้งขยายของ IB-QX แสดง specificityรูปที่ 4 แสดงการละลายสูงสุดของ IB-QX แสดง specificityรูปที่ 5 แสดงให้เห็นลำดับ S1 ผล IB QX และระเบิดรูปที่ 6 แสดงผลการเปรียบเทียบลำดับรูป 7 แสดงเปอร์เซ็นต์ระบุลำดับของ IBV สายพันธุ์รูปที่ 8 แสดงให้เห็นการวิเคราะห์ HRM ของ IB QX, IBnC90 มวล และ 793/B สายพันธุ์ รูปที่ 9 แสดงให้เห็นการวิเคราะห์ HRM ของ IB QX และ IBnC90 สายพันธุ์ รูปที่ 10 แสดงลำดับของสายพันธุ์ LBK (CSFV) และผลการระเบิด
การแปล กรุณารอสักครู่..

สรุปการประดิษฐ์
การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับวิธีหรือกระบวนการของการพัฒนาการสายพันธุ์ของหลอดลมอักเสบติดต่อ,
CSFV หรือ NDV ซึ่งประกอบรวมด้วยขั้นตอนของก) การสร้างยีนจากเชื้อไวรัสสายพันธุ์; ข) การเปิดเผยยีนเพื่อคู่ไพรเมอร์ซึ่งประกอบรวมด้วยไพรเมอร์ไปข้างหน้าและย้อนกลับไพรเมอร์ในเวลาจริง
วิธี polymerase chain reaction (PCR) เพื่อให้ amplicon ประเด็นคู่ไพรเมอร์เป็นเฉพาะกับยีนหรือภูมิภาคของไวรัส จีโนม; ค) การแสดงวีวี (HRM) การวิเคราะห์โค้งบนผลิตภัณฑ์เกลียวคู่ซึ่งประกอบรวมด้วย amplicon ทันทีหลังจากที่เรียลไทม์พีซีอาร์; และง) การวิเคราะห์และเปรียบเทียบเส้นโค้งการบริหารทรัพยากรมนุษย์จึงพัฒนาการไวรัสสายพันธุ์ ยีน IBV อาจจะเป็นยีน S1 ยีน NDV อาจจะเป็น F, NP, P, M, HN หรือยีน L ภูมิภาค CSFV อาจจะเป็นสี่โครงสร้าง (C, EMS, เอลและ E2) หรือแปดโปรตีนที่ไม่ใช่โครงสร้าง (Npro, P7, NS2, NS3, NS4A, NS4B, NS5A และ NS5B) ภูมิภาค.
การประดิษฐ์นี้นอกจากนี้ยังมีไพรเมอร์ และชุดสำหรับการใช้งานด้วยเช่นวิธี. คำอธิบายสั้น ๆ ของภาพวาดคำอธิบายรายละเอียดต่อไปนี้ได้รับโดยวิธีการเช่น แต่ไม่ได้มีเจตนาที่จะ จำกัด การประดิษฐ์เพียงเพื่อ embodiments เฉพาะที่อธิบายไว้อาจจะเข้าใจได้ดีที่สุดในการร่วมกับภาพวาดประกอบการ ที่: 1 รูปเป็นตารางการระบุรหัสที่ได้รับมอบหมายไม่ SEQ แต่ละลำดับ DNA และโปรตีน. รูปที่ 2 แสดงให้เห็นถึงการทดสอบความไวของ PCR แบบเรียลไทม์สำหรับ IBV. รูปที่ 3 แสดงให้เห็นถึงการขยายของเส้นโค้ง IB-QX ที่จะแสดงความจำเพาะ. รูป 4 แสดงให้เห็นถึงยอดเขาละลายของ IB-QX ที่จะแสดงความจำเพาะ. รูปที่ 5 แสดงให้เห็นถึงลำดับ S1 ของ IB-QX และผลระเบิด. รูปที่ 6 แสดงผลการเปรียบเทียบลำดับ. รูปที่ 7 แสดงค่าร้อยละของลำดับบัตรหลอดลมอักเสบติดต่อสายพันธุ์. 8 รูปให้เห็น การวิเคราะห์การบริหารทรัพยากรมนุษย์ของ IB-QX, IBnC90, Mass และ 793 / B สายพันธุ์ รูปที่ 9 แสดงให้เห็นถึงการวิเคราะห์การบริหารทรัพยากรมนุษย์ของ IB-QX และ IBnC90 สายพันธุ์. รูป 10 แสดงให้เห็นถึงลำดับของ LBK สายพันธุ์ (CSFV) และผลการระเบิด
การแปล กรุณารอสักครู่..

สรุปการประดิษฐ์
การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับวิธีหรือกระบวนการของการพัฒนาเป็นสายพันธุ์ของ IBV
, รูปแบบหรือ ndv ซึ่งประกอบรวมด้วยขั้นตอน : ) สร้างยีนจากไวรัสสายพันธุ์ ; B ) เปิดเผยวิธีให้รองพื้นคู่ซึ่งประกอบรวมด้วยรองพื้นไปข้างหน้าและย้อนกลับในเวลาจริง
ไพรเมอร์ปฏิกิริยาลูกโซ่ ( PCR ) และผลผลิต ซึ่งไพรเมอร์คู่เฉพาะเจาะจงกับยีนหรือภูมิภาคของจีโนมไวรัส ; C ) แสดงวีวี ( HRM ) การวิเคราะห์เส้นโค้งบนคู่ตกค้างในผลิตภัณฑ์ซึ่งประกอบรวมด้วยและทันทีหลังจากที่ PCR แบบเรียลไทม์ และ 4 ) วิเคราะห์และเปรียบเทียบเส้นโค้งหรืองบแสดงสายพันธุ์ไวรัส .ยีนสำหรับ IBV อาจเป็นยีน S1 . ยีนสำหรับ ndv อาจเป็น F , NP , p , M , HN หรือ L ยีน ภูมิภาคและอาจเป็นสี่โครงสร้าง ( C , EMS , เอลและ E2 ) หรือโปรตีนโครงสร้างแปดไม่ ( npro p7 NS2 , สร้าง , , , ns4b ns4a , และ , ns5a ns5b ) ภูมิภาค .
การประดิษฐ์นี้ยังให้ไพรเมอร์และชุดสำหรับใช้กับวิธี
สรุปรายละเอียดของภาพวาด
มีรายละเอียดดังต่อไปนี้ให้โดยวิธีการเช่น แต่ไม่ได้มีไว้เพื่อ จำกัด การประดิษฐ์เพียงเฉพาะ embodiments อธิบาย อาจจะดีที่สุดเข้าใจ
ร่วมกับประกอบภาพวาดที่ :
รูป 1 เป็นตารางระบุ seq id ไม่มอบหมายให้แต่ละดีเอ็นเอและลำดับโปรตีน .
รูป 2 แสดงให้เห็นวิธี PCR แบบเรียลไทม์ เพื่อความไวของ IBV .
รูป 3 แสดงให้เห็นเส้นโค้งแบบ ib-qx แสดงความจำเพาะรูป .
4 แสดงการละลายสูงสุดของ ib-qx แสดงความจำเพาะ .
รูป 5 แสดงให้เห็นลำดับของผล ib-qx S1 และระเบิด รูป
6 แสดงการเปรียบเทียบลำดับ .
รูป 7 แสดงลำดับฐานะเปอร์เซ็นต์ของ IBV สายพันธุ์ .
รูป 8 แสดงให้เห็นหรือการวิเคราะห์ ib-qx ibnc90 , ,มวลและ 793 / B สายพันธุ์ . รูป 9 . การวิเคราะห์และแสดงให้เห็น ib-qx ibnc90 สายพันธุ์ .
รูป 10 แสดงให้เห็นถึงลำดับ lbk สายพันธุ์และระเบิด
และผลลัพธ์
การแปล กรุณารอสักครู่..
