In the past years, de Bruijn graph

In the past years, de Bruijn graph methods had showed its
advantage for full-length assemblies, but chimeric k-mer nodes
limited the capability of modern de Bruijn graph algorithms
to generate accurate low-coverage assemblies. Moreover,
using shorter k-mer in de Bruijn graph assembler algorithms
produces more mis-assemblies (Schulz et al., 2012), whereas
EBARDenovo can maintain high accuracy of assembly even with a short key length (Supplementary Fig. S5). In conclusion,
the EBARDenovo algorithm is a promising new approach to
identify transcripts from RNA-Seq analysis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในปีผ่านมา วิธี Bruijn เดอกราฟได้แสดงให้เห็นความประโยชน์สำหรับแอสเซมบลีปราศจาก แต่โหน chimeric เคแมร์จำกัดความสามารถของสมัย Bruijn เดอกราฟอัลกอริทึมการสร้างแอสเซมบลีต่ำความครอบคลุมถูกต้อง นอกจากนี้ใช้ k-แมร์สั้นในมิเตอร์ Bruijn เดอกราฟอัลกอริทึมสร้างแอสเซมบลีการต่อเพิ่มเติม (Schulz et al., 2012), ในขณะที่EBARDenovo สามารถรักษาความแม่นยำสูงประกอบกับความยาวคีย์สั้น (เสริมฟิกแม้ S5) ในสรุปอัลกอริทึม EBARDenovo เป็นวิธีการใหม่สัญญาระบุใบแสดงผลจากการวิเคราะห์ลำดับอาร์เอ็นเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในปีที่ผ่านมาเดอกราฟ Bruijn วิธีการได้แสดงให้เห็นว่ามัน
ได้เปรียบสำหรับประกอบเต็มความยาว แต่โหนด k-Mer ลูกผสม
จำกัด ความสามารถในการที่ทันสมัยเดอกราฟ Bruijn อัลกอริทึม
ในการสร้างประกอบที่ถูกต้องครอบคลุมต่ำ นอกจากนี้
การใช้ที่สั้นกว่า k-Mer ใน Bruijn ขั้นตอนวิธีการประกอบกราฟ
ผลิตประกอบผิดพลาดมากขึ้น (ชัลส์ et al., 2012) ในขณะที่
EBARDenovo สามารถรักษาความแม่นยำสูงในการชุมนุมแม้จะมีระยะเวลาสั้น ๆ ที่สำคัญ (เพิ่มเติมรูป. S5) สรุปได้ว่า
อัลกอริทึม EBARDenovo เป็นวิธีการใหม่ที่มีแนวโน้มที่จะ
ระบุใบรับรองผลการเรียนจากการวิเคราะห์ RNA-Seq

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในช่วงหลายปีที่ผ่านมา เดอ กราฟ bruijn วิธีการได้มีผลประโยชน์
สำหรับประกอบแบบเต็มตัว แต่ที่ k-mer โหนด
จำกัดความสามารถของสมัยใหม่ เดอ bruijn กราฟขั้นตอนวิธี
สร้างถูกต้องประกอบความคุ้มครองน้อย นอกจากนี้ การใช้ k-mer
สั้นกว่า เดอ bruijn ขั้นตอนวิธีกราฟประกอบ
ผลิตประกอบ MIS ( ชูลซ์ et al . , 2012 ) , ในขณะที่
ebardenovo สามารถรักษาความถูกต้องสูงประกอบกับคีย์ความยาวสั้น ( เพิ่มเติมรูป S5 ) สรุป ebardenovo
วิธีเป็นวิธีการใหม่ที่สัญญา
ระบุ transcripts จากการวิเคราะห์ seq RNA