tive fold induction or suppression

tive fold induction or suppression of genes in treated
samples versus untreated controls and selecting the
most consistently different signals across the sample
set. A different signature may be established for each
prototypic toxicant class. Once the signatures are determined,
gene-expression profiles induced by unknown
agents in these same model systems can then
be compared with the established signatures. A match
assigns a putative mechanism of action to the test
compound. Figure 2 illustrates this signature method
for different types of oxidant stressors, PAHs, and
peroxisome proliferators. In this example, the unknown
compound in question had a gene-expression
profile similar to that of the oxidant stressors in
the database. We anticipate that this general method
will also reveal cross talk between different pathways
induced by a single agent (e.g., reveal that a compound
has both PAH-like and oxidant-like properties).
In the future, it may be necessary to distinguish
very subtle differences between compounds within
a very large sample set (e.g., thousands of highly similar
structural isomers in a combinatorial chemistry
library or peptide library). To generate these highly
refined signatures, standard statistical clustering techniques
or principal-component analysis can be used.
For the studies outlined in Figure 2, we developed
the custom cDNA microarray chip ToxChip v1.0.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เหนี่ยวนำพับ tive หรือปราบปรามของยีนในการรักษาตัวอย่างและไม่ได้รับการควบคุมและเลือกการสัญญาณต่าง ๆ อย่างสม่ำเสมอส่วนใหญ่ทั่วตัวตั้งค่า อาจสามารถสร้างลายเซ็นที่แตกต่างกันสำหรับแต่ละชั้น toxicant prototypic เมื่อกำหนดลายเซ็นโพรไฟล์การแสดงออกของยีนที่เกิด โดยไม่ทราบสามารถแทนในระบบเหล่านี้รุ่นเดียวกันแล้วเปรียบเทียบกับลายเซ็นขึ้น การแข่งขันกำหนดกลไกการอ้างว่าฝาของการดำเนินการทดสอบผสม รูปที่ 2 แสดงวิธีการลายเซ็นนี้สำหรับชนิดของความเครียดอนุมูลอิสระ สาร PAHs และperoxisome proliferators ในตัวอย่างนี้ ที่ไม่รู้จักในสารประกอบมียีนเป็นโปรไฟล์ความเครียดอนุมูลอิสระในฐานข้อมูล เราคาดหวังที่วิธีนี้ทั่วไปนอกจากนี้ยังจะเปิดเผยพูดคุยข้ามระหว่างทางเดินที่แตกต่างกันเกิดจากตัวแทนเดียว (เช่น เผยที่สารประกอบมีคุณสมบัติ เหมือนหน้าผา และ เหมือนสารต้านอนุมูลอิสระ)ในอนาคต มันอาจจำเป็นต้องแยกสารประกอบภายในแตกมากชุดตัวอย่างขนาดใหญ่มาก (เช่น พันสูงคล้ายisomers โครงสร้างเคมีแบบไลบรารีหรือไลบรารีเพปไทด์) การสร้างเหล่านี้สูงลายเซ็นกลั่น เทคนิคระบบคลัสเตอร์มาตรฐานทางสถิติหรือสามารถใช้การวิเคราะห์ส่วนประกอบหลักการศึกษาที่ระบุไว้ในรูปที่ 2 ที่เราพัฒนาชิการ microarray cDNA เอง ToxChip v1.0

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สั่งพับหรือปราบปรามของยีนในการรักษาตัวอย่างเมื่อเทียบกับการควบคุมรักษา และการเลือกส่วนใหญ่ที่แตกต่างกันอย่างต่อเนื่อง สัญญาณข้ามตัวอย่างชุด ลายเซ็นที่แตกต่างกันสำหรับแต่ละคนอาจตั้งขึ้นprototypic พิษ class เมื่อลายเซ็นมุ่งมั่นยีนโปรไฟล์และไม่รู้จักตัวแทนในรูปแบบเดียวกันนี้ ระบบสามารถแล้วเปรียบเทียบกับการสร้างลายเซ็น การแข่งขันกำหนดกลไกการแสดงออกของการกระทำที่จะทดสอบสารประกอบ รูปที่ 2 แสดงให้เห็นถึงวิธีการนี้ ลายเซ็นสำหรับประเภทของความเครียดและสารอนุมูลอิสระ , ,เพอรอกซิโซม proliferators . ในตัวอย่างนี้ ไม่รู้จักสารประกอบในคำถามมีการแสดงออกของยีนรายละเอียดคล้ายกับที่ของความเครียดออกซิแดนท์ฐานข้อมูล เราคาดหวังว่าวิธีทั่วไปนี้จะเปิดเผยข้ามพูดคุยระหว่างเส้นทางต่าง ๆการเป็นตัวแทนเดียว ( เช่น เปิดเผยว่า สารประกอบมีทั้งป่าเหมือน และอนุมูลอิสระ เช่น สมบัติ )ในอนาคต อาจจะต้องมีการแยกแยะละเอียดมาก ความแตกต่างระหว่างสารประกอบภายในมีตัวอย่างการตั้งค่า ( เช่น พันที่คล้ายคลึงกันอย่างมากโครงสร้างไอโซเมอร์ในการเคมีหอสมุดหรือห้องสมุดเปปไทด์ ) การสร้างเหล่านี้อย่างมากปรับปรุงลายเซ็นมาตรฐานทางสถิติข้อมูลเทคนิคหรือการวิเคราะห์ส่วนประกอบหลักสามารถใช้เป็นสำหรับการศึกษาที่ระบุไว้ในรูปที่ 2 เราพัฒนาcDNA microarray ชิปที่กำหนดเอง toxchip v1.0 .